17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_0625 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_0625  hypothetical protein  100 
 
 		 166 aa  336  8e-92  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0615  hypothetical protein  37.5 
 
 		 161 aa  89.4  2e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.964895  normal  1 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5448  cupin 2, barrel  36.49 
 
 		 147 aa  47.4  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.708388  normal  1 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5845  cupin 2 domain-containing protein  36.49 
 
 		 147 aa  47.4  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1488  cupin 2 domain-containing protein  34.92 
 
 		 115 aa  45.1  0.0005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00804045  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1675  cupin 2, barrel  33.78 
 
 		 147 aa  44.7  0.0006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0630  cupin 2 domain-containing protein  33.78 
 
 		 147 aa  44.7  0.0006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0548  cupin 2 domain-containing protein  33.78 
 
 		 147 aa  44.7  0.0006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.915131  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1649  cupin 2 domain-containing protein  33.78 
 
 		 147 aa  44.7  0.0006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.316822  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0535  cupin 2 domain-containing protein  33.78 
 
 		 147 aa  44.7  0.0006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.293275  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1700  cupin 2 domain-containing protein  33.78 
 
 		 147 aa  44.7  0.0006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.792463 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5649  cupin 2 domain-containing protein  33.78 
 
 		 147 aa  44.7  0.0006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2906  hypothetical protein  31.25 
 
 		 106 aa  43.9  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.808157  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1397  cupin 2 domain-containing protein  29.36 
 
 		 115 aa  43.1  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0319163  normal  0.27943 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5250  cupin 2 domain-containing protein  30.77 
 
 		 373 aa  42.7  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.665578 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4778  cupin 2 domain-containing protein  34.48 
 
 		 350 aa  41.2  0.007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.168461 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4525  cupin 2 domain-containing protein  26.37 
 
 		 147 aa  40.8  0.009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>