15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_0615 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_0615  hypothetical protein  100 
 
 		 161 aa  330  6e-90  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.964895  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0625  hypothetical protein  37.5 
 
 		 166 aa  89.4  2e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3565  cupin 2, barrel  26.92 
 
 		 367 aa  47  0.0001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0167  cupin 2 domain-containing protein  28.57 
 
 		 365 aa  46.6  0.0001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.354659  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2910  cupin 2 protein  28.03 
 
 		 357 aa  46.2  0.0002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.305706  normal  0.232695 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2052  cupin 2 domain-containing protein  27.1 
 
 		 377 aa  46.2  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.748893  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1397  cupin 2 domain-containing protein  35.42 
 
 		 115 aa  45.8  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0319163  normal  0.27943 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1386  cupin 2 domain-containing protein  40.26 
 
 		 116 aa  44.7  0.0006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1030  Cupin 2 conserved barrel domain protein  38.67 
 
 		 172 aa  43.1  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0947  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.25 
 
 		 154 aa  42.7  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.451642  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20700  gentisate 1,2-dioxygenase  28.46 
 
 		 372 aa  43.1  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.280371  normal  0.141412 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0971  cupin domain-containing protein  37.33 
 
 		 171 aa  41.6  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.341283  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2026  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.29 
 
 		 116 aa  42  0.004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0456493  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3702  cupin 2 domain-containing protein  29.58 
 
 		 345 aa  41.6  0.005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.105919  normal  0.217217 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1033  Cupin 2 conserved barrel domain protein  37.33 
 
 		 172 aa  40.8  0.008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.714129  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>