28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_0947 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_0947  Cupin 2 conserved barrel domain protein  100 
 
 		 154 aa  310  3.9999999999999997e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.451642  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0829  Cupin 2 conserved barrel domain protein  88.96 
 
 		 153 aa  277  5e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.55618  normal  1 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5435  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.68 
 
 		 149 aa  49.3  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.657648 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4085  cupin 2 protein  30.43 
 
 		 324 aa  48.5  0.00003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.362082 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1181  Cupin 2 conserved barrel domain protein  38.03 
 
 		 192 aa  47  0.00009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.229288 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3109  cupin region  32.05 
 
 		 175 aa  45.4  0.0003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.348066 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1112  cupin 2 protein  30.43 
 
 		 340 aa  45.1  0.0004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.792724  normal  0.152663 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2770  auxin-binding protein-like protein  34 
 
 		 182 aa  45.1  0.0004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.306172  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3139  cupin domain protein  27.72 
 
 		 376 aa  44.7  0.0005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.557804  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4204  cupin 2 domain-containing protein  36.36 
 
 		 370 aa  44.3  0.0006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.469999  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5649  cupin 2 domain-containing protein  30.93 
 
 		 147 aa  43.9  0.0008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1700  cupin 2 domain-containing protein  30.93 
 
 		 147 aa  43.9  0.0008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.792463 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1649  cupin 2 domain-containing protein  30.93 
 
 		 147 aa  43.9  0.0008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.316822  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0548  cupin 2 domain-containing protein  30.93 
 
 		 147 aa  43.9  0.0008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.915131  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0630  cupin 2 domain-containing protein  30.93 
 
 		 147 aa  43.9  0.0008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1675  cupin 2, barrel  30.93 
 
 		 147 aa  43.9  0.0008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3189  cupin 2, barrel  31.97 
 
 		 190 aa  43.5  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00000805068  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0535  cupin 2 domain-containing protein  30.93 
 
 		 147 aa  43.9  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.293275  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4294  cupin 2 domain-containing protein  30.43 
 
 		 323 aa  43.5  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.689611 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1709  cupin 2, barrel  32.79 
 
 		 163 aa  43.5  0.001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.448021 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0615  hypothetical protein  31.25 
 
 		 161 aa  42.7  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.964895  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1863  cupin 2 domain-containing protein  33.75 
 
 		 100 aa  41.6  0.004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.524548 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2945  cupin 2 protein  32.05 
 
 		 177 aa  41.6  0.004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0664771  decreased coverage  0.00000748463 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0889  hypothetical protein  31.17 
 
 		 169 aa  41.6  0.005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4108  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.8 
 
 		 165 aa  41.2  0.006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2589  pectin degradation protein KdgF  31.17 
 
 		 137 aa  40.8  0.007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.933509  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3702  cupin 2 domain-containing protein  25.81 
 
 		 345 aa  40.4  0.009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.105919  normal  0.217217 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2453  cupin domain-containing protein  30.26 
 
 		 137 aa  40  0.01  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>