104 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_3189 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_3189  cupin 2, barrel  100 
 
 		 190 aa  382  1e-105  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00000805068  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2964  Cupin 2 conserved barrel domain protein  48 
 
 		 160 aa  141  5e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.75352  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4108  Cupin 2 conserved barrel domain protein  44.59 
 
 		 165 aa  117  9.999999999999999e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4406  Cupin 2 conserved barrel domain protein  45.64 
 
 		 169 aa  117  9.999999999999999e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0295153  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0102  Cupin 2 conserved barrel domain protein  36.49 
 
 		 204 aa  116  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.66506 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0105  Cupin 2 conserved barrel domain protein  36.49 
 
 		 204 aa  115  3e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1181  Cupin 2 conserved barrel domain protein  40.82 
 
 		 192 aa  110  1.0000000000000001e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.229288 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0692  cupin 2 domain-containing protein  40.94 
 
 		 163 aa  90.1  2e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1709  cupin 2, barrel  36.69 
 
 		 163 aa  79  0.00000000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.448021 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7008  hypothetical protein  35.1 
 
 		 163 aa  78.2  0.00000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0126624  hitchhiker  0.000933462 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2969  cupin 2  34.78 
 
 		 171 aa  73.2  0.000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2609  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.5 
 
 		 160 aa  73.6  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.629  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3647  cupin 2 domain-containing protein  37.76 
 
 		 149 aa  72.8  0.000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3902  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.65 
 
 		 166 aa  72.4  0.000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.760355  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2295  Cupin 2 conserved barrel domain protein  38.35 
 
 		 166 aa  71.6  0.000000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5435  Cupin 2 conserved barrel domain protein  27.27 
 
 		 149 aa  69.7  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.657648 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1923  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.43 
 
 		 145 aa  70.5  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0356258  normal  0.456316 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0144  cupin 2 domain-containing protein  38.14 
 
 		 165 aa  69.3  0.00000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5299  hypothetical protein  33.06 
 
 		 166 aa  69.3  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.148055  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3153  cupin 2 domain-containing protein  34.48 
 
 		 135 aa  68.6  0.00000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2309  hypothetical protein  38.61 
 
 		 139 aa  67.8  0.00000000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.5332  hitchhiker  0.00622303 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0378  cupin region  34.19 
 
 		 153 aa  67.4  0.0000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.930622  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1228  Cupin 2 conserved barrel domain protein  38.14 
 
 		 135 aa  67  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.066401  normal  0.685252 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3556  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.84 
 
 		 169 aa  65.9  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3706  Cupin 2 conserved barrel domain protein  43.16 
 
 		 163 aa  66.2  0.0000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3191  cupin 2, barrel  34.97 
 
 		 179 aa  65.1  0.0000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0000053457  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2790  cupin 2 domain-containing protein  36.15 
 
 		 153 aa  65.1  0.0000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1714  cupin 2 domain-containing protein  35.29 
 
 		 150 aa  64.3  0.000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.259313 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4562  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.77 
 
 		 153 aa  63.9  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0760  cupin 2 domain-containing protein  36.08 
 
 		 178 aa  63.5  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.26011  normal  0.519438 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3363  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.81 
 
 		 181 aa  63.5  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.331871 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3707  cupin 2, barrel  37.63 
 
 		 138 aa  62.8  0.000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.52835  normal  0.602346 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5084  cupin superfamily protein  33.56 
 
 		 147 aa  62.8  0.000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0259637  normal  0.536671 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0604  cupin 2, barrel  36.08 
 
 		 165 aa  62.4  0.000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.398371  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0617  cupin 2 domain-containing protein  36.08 
 
 		 165 aa  62.4  0.000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.546436  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0595  cupin 2 domain-containing protein  36.08 
 
 		 165 aa  62.4  0.000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.906672  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3197  Cupin 2 conserved barrel domain protein  36.27 
 
 		 191 aa  61.6  0.000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.229687  normal  0.39078 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2141  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.17 
 
 		 159 aa  61.2  0.000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3620  Cupin 2 conserved barrel domain protein  27.45 
 
 		 159 aa  60.8  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.517442  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3503  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.17 
 
 		 182 aa  60.8  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6348  cupin 2 domain-containing protein  32.54 
 
 		 163 aa  59.3  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3791  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.07 
 
 		 159 aa  58.9  0.00000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.302037  normal  0.0222415 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3997  cupin 2 domain-containing protein  31.71 
 
 		 148 aa  58.5  0.00000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.439431  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3405  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.58 
 
 		 156 aa  58.2  0.00000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4525  cupin 2 domain-containing protein  31.82 
 
 		 147 aa  58.2  0.00000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0565  hypothetical protein  32.65 
 
 		 155 aa  57  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.916683  normal  0.52627 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0320  cupin 2 domain-containing protein  28.87 
 
 		 146 aa  55.8  0.0000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.864661  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6634  cupin 2 domain-containing protein  28.76 
 
 		 189 aa  55.8  0.0000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.718615  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0204  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.86 
 
 		 160 aa  55.8  0.0000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0884  cupin 2, barrel  37.36 
 
 		 191 aa  53.9  0.000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0950  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.56 
 
 		 389 aa  54.3  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2781  cupin 2, barrel  33.01 
 
 		 338 aa  53.1  0.000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.402218  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3187  hypothetical protein  50 
 
 		 66 aa  52.4  0.000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00572816  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4882  hypothetical protein  27.48 
 
 		 145 aa  52  0.000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.192272  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3501  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.88 
 
 		 184 aa  52.4  0.000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1864  Cupin 2 conserved barrel domain protein  24.24 
 
 		 144 aa  51.6  0.000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2213  cupin 2 domain-containing protein  32.11 
 
 		 125 aa  51.6  0.000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.971914  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3113  cupin 2 domain-containing protein  32.11 
 
 		 174 aa  51.2  0.000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.487782  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4239  Cupin 2 conserved barrel domain protein  37.38 
 
 		 163 aa  50.8  0.00001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.637233  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6233  Cupin 2 conserved barrel domain protein  37.33 
 
 		 163 aa  50.1  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.398434  normal  0.379299 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5062  hypothetical protein  28.91 
 
 		 157 aa  49.3  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.421326  normal  0.406339 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06772  conserved hypothetical protein  28.1 
 
 		 372 aa  48.9  0.00005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1397  cupin 2 domain-containing protein  37.23 
 
 		 115 aa  48.5  0.00005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0319163  normal  0.27943 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5660  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.11 
 
 		 170 aa  48.5  0.00006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.215719 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0747  cupin-like protein  33.33 
 
 		 169 aa  48.1  0.00007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.179804  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2327  cupin 2 domain-containing protein  33.75 
 
 		 150 aa  48.1  0.00008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000139899 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2200  hypothetical protein  34.65 
 
 		 163 aa  47.4  0.0001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.192403 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1675  cupin 2, barrel  28.1 
 
 		 147 aa  47.4  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5649  cupin 2 domain-containing protein  28.1 
 
 		 147 aa  47.4  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1700  cupin 2 domain-containing protein  28.1 
 
 		 147 aa  47.4  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.792463 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0535  cupin 2 domain-containing protein  28.1 
 
 		 147 aa  47.8  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.293275  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1649  cupin 2 domain-containing protein  28.1 
 
 		 147 aa  47.4  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.316822  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0548  cupin 2 domain-containing protein  28.1 
 
 		 147 aa  47.4  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.915131  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0630  cupin 2 domain-containing protein  28.1 
 
 		 147 aa  47.4  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1603  cupin 2 domain-containing protein  37.33 
 
 		 123 aa  47.8  0.0001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3858  Cupin 2 conserved barrel domain protein  36.26 
 
 		 133 aa  47.4  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3067  cupin 2 domain-containing protein  30.12 
 
 		 145 aa  46.6  0.0002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0389  cupin 2 domain-containing protein  36.99 
 
 		 122 aa  46.6  0.0002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0454  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.49 
 
 		 356 aa  47  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2878  Cupin 2 conserved barrel domain-containing protein  35.9 
 
 		 161 aa  46.6  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.505096  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2799  hypothetical protein  33.72 
 
 		 104 aa  46.2  0.0003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.7832900000000002e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0432  cupin region  32.91 
 
 		 117 aa  45.8  0.0004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.583729  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2685  hypothetical protein  26.92 
 
 		 152 aa  45.4  0.0005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.273941  normal  0.254874 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6281  hypothetical protein  28.19 
 
 		 149 aa  45.4  0.0005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1207  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.31 
 
 		 152 aa  45.4  0.0005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.830198  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3608  cupin 2 domain-containing protein  30.71 
 
 		 159 aa  45.1  0.0006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.13649  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1043  cupin 2 domain-containing protein  30.4 
 
 		 181 aa  44.7  0.0008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5028  cupin 2 domain-containing protein  35.79 
 
 		 210 aa  44.7  0.0008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5448  cupin 2, barrel  28.1 
 
 		 147 aa  44.7  0.0009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.708388  normal  1 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5845  cupin 2 domain-containing protein  28.1 
 
 		 147 aa  44.7  0.0009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1444  cupin 2 domain-containing protein  33.01 
 
 		 132 aa  43.9  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2772  cupin 2 domain-containing protein  40.62 
 
 		 178 aa  43.5  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0947  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.97 
 
 		 154 aa  43.5  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.451642  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0119  Cupin 2 conserved barrel domain protein  39.47 
 
 		 195 aa  43.1  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.338448  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0347  Mannose-1-phosphate guanylyltransferase  34.55 
 
 		 476 aa  43.1  0.002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1355  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.17 
 
 		 195 aa  43.5  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.646374  normal  0.0330672 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0553  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34 
 
 		 136 aa  43.1  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1350  cupin 2 domain-containing protein  32.22 
 
 		 287 aa  43.1  0.003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.832765  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1447  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.38 
 
 		 190 aa  42.7  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.901222  normal  0.428247 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2778  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.56 
 
 		 111 aa  42.4  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.936799 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>