121 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_0432 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007575  Suden_0432  cupin region  100 
 
 		 117 aa  242  9.999999999999999e-64  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.583729  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1435  Cupin 2 conserved barrel domain protein  54.46 
 
 		 122 aa  126  9.000000000000001e-29  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.438384  normal  0.13585 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2121  Cupin 2 conserved barrel domain protein  46.85 
 
 		 121 aa  108  2.0000000000000002e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.625862  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2600  Cupin 2 conserved barrel domain protein  48.57 
 
 		 133 aa  105  3e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.556264 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0303  Cupin 2 conserved barrel domain protein  42.98 
 
 		 121 aa  103  7e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0389  cupin 2 domain-containing protein  38.27 
 
 		 122 aa  79.7  0.00000000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1595  Cupin 2 conserved barrel domain protein  38.2 
 
 		 123 aa  76.6  0.0000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.040843 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1397  cupin 2 domain-containing protein  32.32 
 
 		 115 aa  70.5  0.000000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0319163  normal  0.27943 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0602  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.56 
 
 		 118 aa  68.9  0.00000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2026  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.9 
 
 		 116 aa  62.4  0.000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0456493  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1335  cupin 2 domain-containing protein  30.69 
 
 		 114 aa  62  0.000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000568302  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1351  cupin 2 domain-containing protein  30.69 
 
 		 114 aa  62  0.000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00886277  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1633  cupin 2 domain-containing protein  34.78 
 
 		 113 aa  61.2  0.000000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.905106  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1036  cupin 2 domain-containing protein  31.03 
 
 		 104 aa  59.3  0.00000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.276855  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2400  Cupin 2 conserved barrel domain protein  27.78 
 
 		 127 aa  57  0.00000008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0895  cupin 2 domain-containing protein  26.21 
 
 		 125 aa  54.7  0.0000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1181  Cupin 2 conserved barrel domain protein  39.39 
 
 		 192 aa  54.3  0.0000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.229288 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1023  cupin 2 domain-containing protein  30.97 
 
 		 120 aa  54.3  0.0000006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1603  cupin 2 domain-containing protein  28.16 
 
 		 123 aa  52.8  0.000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5435  Cupin 2 conserved barrel domain protein  40 
 
 		 149 aa  53.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.657648 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3858  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33 
 
 		 133 aa  52.8  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1386  cupin 2 domain-containing protein  29.9 
 
 		 116 aa  52.8  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0819  cupin 2 domain-containing protein  26.53 
 
 		 123 aa  52.4  0.000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2847  Cupin 2 conserved barrel domain protein  26.8 
 
 		 119 aa  52.8  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1883  Cupin 2 conserved barrel domain protein  25 
 
 		 157 aa  52  0.000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0134  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.47 
 
 		 118 aa  51.6  0.000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2041  cupin 2 domain-containing protein  31.87 
 
 		 110 aa  51.2  0.000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.267736 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13508  hypothetical protein  28.57 
 
 		 177 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2538  Cupin 2 conserved barrel domain protein  36.84 
 
 		 107 aa  50.1  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0103935  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1980  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.84 
 
 		 130 aa  50.1  0.00001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1167  cupin 2 domain-containing protein  29.29 
 
 		 152 aa  48.9  0.00002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.168838 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3140  conserved hypothetical phosphomannose protein  29.47 
 
 		 137 aa  49.7  0.00002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5098  Cupin 2 conserved barrel domain protein  39.66 
 
 		 124 aa  48.9  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0323  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.29 
 
 		 151 aa  48.9  0.00003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2234  cupin 2, barrel  27.96 
 
 		 159 aa  48.1  0.00004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.328045 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0923  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30 
 
 		 107 aa  48.1  0.00004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.8499800000000002e-33 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1491  cupin:protein of unknown function DUF861  41.94 
 
 		 133 aa  47.4  0.00007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0104  cupin  28.57 
 
 		 122 aa  47  0.00009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.300673  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3706  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.13 
 
 		 163 aa  46.2  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5005  Cupin 2 conserved barrel domain protein  36.23 
 
 		 255 aa  46.2  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.158315  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0812  Cupin 2 conserved barrel domain protein  39.34 
 
 		 91 aa  46.6  0.0001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000379382  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1243  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.75 
 
 		 161 aa  46.6  0.0001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.942705 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3189  cupin 2, barrel  32.91 
 
 		 190 aa  45.8  0.0002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00000805068  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0223  cupin 2 domain-containing protein  29.41 
 
 		 114 aa  45.8  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1350  cupin 2 domain-containing protein  32.1 
 
 		 287 aa  45.4  0.0003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.832765  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3678  Cupin 2 conserved barrel domain protein  45.95 
 
 		 118 aa  45.1  0.0003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5381  Cupin 2 conserved barrel domain protein  41.07 
 
 		 132 aa  45.1  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5804  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.34 
 
 		 123 aa  45.1  0.0004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5006  hypothetical protein  27.27 
 
 		 274 aa  44.3  0.0005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2502  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.14 
 
 		 159 aa  44.3  0.0005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.529336 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3791  Cupin 2 conserved barrel domain protein  26.36 
 
 		 159 aa  44.7  0.0005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.302037  normal  0.0222415 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1041  cupin 2 domain-containing protein  28.74 
 
 		 311 aa  44.3  0.0006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.421449  normal  0.0580221 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1358  cupin 2 domain-containing protein  28.57 
 
 		 119 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.660301  normal  0.0940885 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2790  cupin 2 domain-containing protein  30.34 
 
 		 153 aa  44.3  0.0006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3191  cupin 2, barrel  30.85 
 
 		 179 aa  43.9  0.0007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0000053457  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0901  Cupin 2 conserved barrel domain-containing protein  24.78 
 
 		 151 aa  43.9  0.0007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.554615  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0722  bicupin, oxalate decarboxylase family  33.33 
 
 		 234 aa  43.9  0.0007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2409  cupin family protein  29.41 
 
 		 114 aa  43.9  0.0008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000116838  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0468  cupin 2 domain-containing protein  31.33 
 
 		 157 aa  43.9  0.0008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3867  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.46 
 
 		 145 aa  43.9  0.0008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.468547  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2908  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.14 
 
 		 159 aa  43.9  0.0008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3618  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.76 
 
 		 153 aa  43.5  0.0009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.471134  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1897  cupin region  27.03 
 
 		 110 aa  42.7  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.766925  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3988  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.81 
 
 		 146 aa  43.1  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.507618  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2183  cupin 2, barrel  27.08 
 
 		 166 aa  43.5  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0487258  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0884  cupin 2, barrel  23.01 
 
 		 191 aa  43.5  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0731  cupin 2 domain-containing protein  30.65 
 
 		 112 aa  43.5  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00910188  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4829  cupin 2 domain-containing protein  33.33 
 
 		 182 aa  43.1  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0191257  normal  0.0141237 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3499  Cupin 2 conserved barrel domain protein  38.03 
 
 		 161 aa  42.7  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.163476 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2463  Cupin 2 conserved barrel domain protein  25 
 
 		 165 aa  43.5  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0556151  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3323  Cupin 2 conserved barrel domain protein  28.75 
 
 		 107 aa  43.5  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00344723  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0105  Cupin 2 conserved barrel domain protein  26.85 
 
 		 204 aa  43.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7008  hypothetical protein  32.84 
 
 		 163 aa  42.7  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0126624  hitchhiker  0.000933462 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2609  Cupin 2 conserved barrel domain protein  37.25 
 
 		 160 aa  43.5  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.629  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0452  Cupin 2 conserved barrel domain protein  27.78 
 
 		 136 aa  43.1  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3175  Cupin 2 conserved barrel domain protein  38.03 
 
 		 161 aa  43.1  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.20235  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0102  Cupin 2 conserved barrel domain protein  26.85 
 
 		 204 aa  43.5  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.66506 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2731  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.11 
 
 		 113 aa  43.1  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.497805  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2672  hypothetical protein  32.14 
 
 		 159 aa  42.7  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.311364  normal  0.391613 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1689  hypothetical protein  32.5 
 
 		 235 aa  42.7  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.209957 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1009  cupin family protein  29.47 
 
 		 119 aa  42.4  0.002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0079  hypothetical protein  29 
 
 		 282 aa  42.4  0.002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1921  hypothetical protein  28 
 
 		 278 aa  42.4  0.002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_88029  predicted protein  33.33 
 
 		 741 aa  42.4  0.002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0692998 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0865  cupin 2 domain-containing protein  33.33 
 
 		 109 aa  42.4  0.002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2960  cupin 2 domain-containing protein  35.42 
 
 		 112 aa  42.7  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0272486 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0193  Cupin 2 conserved barrel domain protein  24.21 
 
 		 126 aa  42.4  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.539282  normal  0.99492 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4108  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.29 
 
 		 165 aa  42.7  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4417  cupin:cupin region  33.33 
 
 		 155 aa  42  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1171  hypothetical protein  35.48 
 
 		 162 aa  41.6  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.355646 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3146  cupin 2 domain-containing protein  30.11 
 
 		 134 aa  41.6  0.003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1024  cupin 2 domain-containing protein  32.47 
 
 		 102 aa  42  0.003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0831873 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2965  mannose-1-phosphate guanylyltransferase/mannose-6-phosphate isomerase  28.57 
 
 		 482 aa  42  0.003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000470306 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5217  Cupin 2 conserved barrel domain protein  28.75 
 
 		 112 aa  42  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.181963  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2000  hypothetical protein  27.5 
 
 		 156 aa  41.6  0.004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5012  hypothetical protein  35.29 
 
 		 155 aa  41.6  0.004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0120588  normal  0.173507 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0144  cupin 2 domain-containing protein  33.85 
 
 		 165 aa  41.6  0.004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2408  cupin 2 domain-containing protein  30.21 
 
 		 100 aa  41.6  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.231406 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3787  homogentisate 12-dioxygenase  35.29 
 
 		 407 aa  41.2  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3197  DNA-binding transcriptional regulator AraC  35.29 
 
 		 325 aa  41.6  0.004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0504834 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>