31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_0901 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013946  Mrub_0901  Cupin 2 conserved barrel domain-containing protein  100 
 
 		 151 aa  313  6e-85  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.554615  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0323  Cupin 2 conserved barrel domain protein  77.48 
 
 		 151 aa  237  2.9999999999999997e-62  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2234  cupin 2, barrel  59.18 
 
 		 159 aa  188  2e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.328045 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2183  cupin 2, barrel  59.57 
 
 		 166 aa  181  3e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0487258  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3226  hypothetical protein  60 
 
 		 167 aa  181  4.0000000000000006e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1243  Cupin 2 conserved barrel domain protein  53.59 
 
 		 161 aa  176  9e-44  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.942705 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2463  Cupin 2 conserved barrel domain protein  57.04 
 
 		 165 aa  172  9.999999999999999e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0556151  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2000  hypothetical protein  56.62 
 
 		 156 aa  168  2e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1167  cupin 2 domain-containing protein  49.31 
 
 		 152 aa  149  1e-35  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.168838 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1883  Cupin 2 conserved barrel domain protein  52.17 
 
 		 157 aa  148  3e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0468  cupin 2 domain-containing protein  46.84 
 
 		 157 aa  132  1.9999999999999998e-30  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1373  ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit  43.7 
 
 		 551 aa  105  2e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_88029  predicted protein  42.22 
 
 		 741 aa  76.3  0.0000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0692998 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0389  cupin 2 domain-containing protein  28.87 
 
 		 122 aa  55.1  0.0000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1397  cupin 2 domain-containing protein  34.04 
 
 		 115 aa  48.9  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0319163  normal  0.27943 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0134  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.33 
 
 		 118 aa  49.3  0.00002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3140  conserved hypothetical phosphomannose protein  36.76 
 
 		 137 aa  48.1  0.00004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1915  cupin 2 domain-containing protein  32.88 
 
 		 129 aa  47  0.00009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0943  XRE family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 182 aa  44.7  0.0005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0432  cupin region  24.78 
 
 		 117 aa  43.9  0.0007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.583729  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0303  Cupin 2 conserved barrel domain protein  28.87 
 
 		 121 aa  43.5  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2026  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.71 
 
 		 116 aa  42  0.003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0456493  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1023  cupin 2 domain-containing protein  26.47 
 
 		 120 aa  41.2  0.005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3893  pectin degradation protein  36.49 
 
 		 113 aa  41.2  0.005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1091  XRE family transcriptional regulator  35.23 
 
 		 182 aa  41.2  0.005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.158888  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0895  cupin 2 domain-containing protein  26.67 
 
 		 125 aa  40.8  0.006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3195  transcriptional regulator, XRE family  38.1 
 
 		 182 aa  40.4  0.008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0639399 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1195  XRE family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 182 aa  40.4  0.008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.152731  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1163  cupin 2 domain-containing protein  38.1 
 
 		 182 aa  40.4  0.008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.967119  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1104  cupin 2 domain-containing protein  38.1 
 
 		 182 aa  40.4  0.008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.183758  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1265  transcriptional regulator, putative  34.09 
 
 		 182 aa  40  0.01  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>