33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hhal_0468 on replicon NC_008789
Organism: Halorhodospira halophila SL1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008789  Hhal_0468  cupin 2 domain-containing protein  100 
 
 		 157 aa  320  5e-87  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1167  cupin 2 domain-containing protein  54.3 
 
 		 152 aa  174  3e-43  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.168838 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0901  Cupin 2 conserved barrel domain-containing protein  46.84 
 
 		 151 aa  132  1.9999999999999998e-30  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.554615  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0323  Cupin 2 conserved barrel domain protein  45.57 
 
 		 151 aa  124  6e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1883  Cupin 2 conserved barrel domain protein  42.14 
 
 		 157 aa  121  4e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1243  Cupin 2 conserved barrel domain protein  48.91 
 
 		 161 aa  120  6e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.942705 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2234  cupin 2, barrel  43.95 
 
 		 159 aa  120  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.328045 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2000  hypothetical protein  44.29 
 
 		 156 aa  112  1.0000000000000001e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1373  ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit  47.54 
 
 		 551 aa  111  3e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3226  hypothetical protein  44.29 
 
 		 167 aa  111  5e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2463  Cupin 2 conserved barrel domain protein  43.97 
 
 		 165 aa  111  5e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0556151  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2183  cupin 2, barrel  41.73 
 
 		 166 aa  102  2e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0487258  normal  1 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_88029  predicted protein  40.28 
 
 		 741 aa  94  8e-19  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0692998 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0389  cupin 2 domain-containing protein  30.85 
 
 		 122 aa  54.3  0.0000007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0819  cupin 2 domain-containing protein  28.43 
 
 		 123 aa  48.9  0.00003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1397  cupin 2 domain-containing protein  32 
 
 		 115 aa  48.5  0.00004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0319163  normal  0.27943 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1036  cupin 2 domain-containing protein  29.35 
 
 		 104 aa  47  0.0001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.276855  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1023  cupin 2 domain-containing protein  29.11 
 
 		 120 aa  45.1  0.0004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2847  Cupin 2 conserved barrel domain protein  37.68 
 
 		 119 aa  45.1  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1335  cupin 2 domain-containing protein  28.26 
 
 		 114 aa  43.9  0.0009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000568302  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1351  cupin 2 domain-containing protein  28.26 
 
 		 114 aa  43.9  0.0009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00886277  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0432  cupin region  31.33 
 
 		 117 aa  43.9  0.0009  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.583729  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0570  methionine--tRNA ligase  32.1 
 
 		 659 aa  43.9  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.755013 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2400  Cupin 2 conserved barrel domain protein  25.4 
 
 		 127 aa  43.5  0.001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1435  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.01 
 
 		 122 aa  43.5  0.001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.438384  normal  0.13585 
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4214  mannose-1-phosphate guanylyltransferase (GDP)  39.06 
 
 		 470 aa  42.7  0.002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0518  mannose-1-phosphate guanylyltransferase/mannose-6-phosphate isomerase  36.11 
 
 		 470 aa  42.7  0.002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.405466  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0541  mannose-1-phosphate guanylyltransferase/mannose-6-phosphate isomerase  32.81 
 
 		 474 aa  42.4  0.003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0538  mannose-1-phosphate guanylyltransferase/mannose-6-phosphate isomerase  32.81 
 
 		 474 aa  42.4  0.003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0301  mannose-1-phosphate guanylyltransferase/mannose-6-phosphate isomerase  35.29 
 
 		 491 aa  41.2  0.006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.503708  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2189  cupin 2 domain-containing protein  34.67 
 
 		 116 aa  40.4  0.009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.525757  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0104  cupin  29.25 
 
 		 122 aa  40.4  0.009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.300673  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1069  Cupin 2 conserved barrel domain protein  27.52 
 
 		 117 aa  40.4  0.01  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.486556 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>