85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_C0104 on replicon NC_007412
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007412  Ava_C0104  cupin  100 
 
 		 122 aa  248  1e-65  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.300673  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2847  Cupin 2 conserved barrel domain protein  72.27 
 
 		 119 aa  189  8e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3001  cupin 2 domain-containing protein  47.46 
 
 		 124 aa  112  1.0000000000000001e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1023  cupin 2 domain-containing protein  38.98 
 
 		 120 aa  101  4e-21  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2973  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  47.17 
 
 		 274 aa  100  7e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1757  Cupin 2 conserved barrel domain protein  45.19 
 
 		 125 aa  91.3  4e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.128793  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1009  cupin family protein  35.51 
 
 		 119 aa  77.4  0.00000000000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0193  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.62 
 
 		 126 aa  73.2  0.000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.539282  normal  0.99492 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2327  cupin 2 domain-containing protein  33.91 
 
 		 150 aa  71.2  0.000000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000139899 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3140  conserved hypothetical phosphomannose protein  36.54 
 
 		 137 aa  70.9  0.000000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1827  hypothetical protein  34.78 
 
 		 121 aa  70.5  0.000000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13508  hypothetical protein  32.76 
 
 		 177 aa  68.2  0.00000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2629  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.9 
 
 		 138 aa  67  0.00000000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0134  Cupin 2 conserved barrel domain protein  36.63 
 
 		 118 aa  65.1  0.0000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1904  cupin region  33.65 
 
 		 120 aa  62.8  0.000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3140  mannose-6-phosphate isomerase, bifunctional enzyme  36.36 
 
 		 458 aa  52  0.000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.116688  normal  0.384157 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1915  cupin 2 domain-containing protein  32.43 
 
 		 129 aa  50.4  0.000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1167  cupin 2 domain-containing protein  33.33 
 
 		 152 aa  49.7  0.00001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.168838 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5005  Cupin 2 conserved barrel domain protein  37.68 
 
 		 255 aa  48.9  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.158315  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4126  cupin 2 domain-containing protein  24.39 
 
 		 119 aa  48.1  0.00004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1305  cupin 2, barrel  30.69 
 
 		 115 aa  48.1  0.00004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0335072  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01320  hypothetical protein  35.37 
 
 		 122 aa  47.4  0.00007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.333196  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0432  cupin region  28.57 
 
 		 117 aa  47  0.00009  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.583729  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8561  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.67 
 
 		 140 aa  47  0.00009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.853837  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2672  hypothetical protein  30 
 
 		 159 aa  47  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.311364  normal  0.391613 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3706  Cupin 2 conserved barrel domain protein  27.78 
 
 		 163 aa  47  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1350  cupin 2 domain-containing protein  29.36 
 
 		 287 aa  46.6  0.0001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.832765  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1435  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.7 
 
 		 122 aa  45.8  0.0002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.438384  normal  0.13585 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0837  cupin 2 domain-containing protein  33.33 
 
 		 125 aa  45.8  0.0002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.168826 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1397  cupin 2 domain-containing protein  37.29 
 
 		 115 aa  45.4  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0319163  normal  0.27943 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5804  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.87 
 
 		 123 aa  45.4  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5098  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.92 
 
 		 124 aa  45.4  0.0003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3988  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31 
 
 		 146 aa  44.3  0.0006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.507618  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0570  methionine--tRNA ligase  30.99 
 
 		 659 aa  44.3  0.0006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.755013 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4521  hypothetical protein  22.22 
 
 		 129 aa  43.9  0.0007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1608  mannose-1-phosphate guanylyltransferase/mannose-6-phosphate isomerase  25.6 
 
 		 478 aa  43.9  0.0008  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00673298  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1592  mannose-1-phosphate guanylyltransferase/mannose-6-phosphate isomerase  25.6 
 
 		 478 aa  43.9  0.0008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.251806  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1013  mannose-1-phosphate guanylyltransferase  25.6 
 
 		 478 aa  43.9  0.0008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1183  mannose-1-phosphate guanylyltransferase  25.6 
 
 		 478 aa  43.9  0.0008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.753982  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01944  hypothetical protein  25.6 
 
 		 478 aa  43.5  0.0008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.163009  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0577  hypothetical protein  36.84 
 
 		 125 aa  43.9  0.0008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.116523  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2342  mannose-1-phosphate guanylyltransferase  25.6 
 
 		 478 aa  43.9  0.0008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01955  mannose-1-phosphate guanyltransferase  25.6 
 
 		 478 aa  43.5  0.0008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.169753  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2984  mannose-1-phosphate guanylyltransferase  25.6 
 
 		 478 aa  43.5  0.0009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000133509 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6318  Methionine--tRNA ligase  28.81 
 
 		 662 aa  43.5  0.0009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.955979 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0323  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.43 
 
 		 151 aa  43.5  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3146  cupin 2 domain-containing protein  27.84 
 
 		 134 aa  43.1  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3623  Cupin 2 conserved barrel domain protein  28.99 
 
 		 122 aa  43.5  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4146  mannose-1-phosphate guanylyltransferase/mannose-6-phosphate isomerase  28.21 
 
 		 474 aa  43.1  0.001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.469733 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0144  cupin 2 domain-containing protein  31.46 
 
 		 165 aa  43.5  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2287  mannose-1-phosphate guanylyltransferase  24.8 
 
 		 478 aa  42.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00436 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0604  cupin 2, barrel  32 
 
 		 165 aa  42.7  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.398371  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0617  cupin 2 domain-containing protein  32 
 
 		 165 aa  42.7  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.546436  normal  1 
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4214  mannose-1-phosphate guanylyltransferase (GDP)  26.92 
 
 		 470 aa  42.7  0.002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0595  cupin 2 domain-containing protein  32 
 
 		 165 aa  42.4  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.906672  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2445  mannose-1-phosphate guanylyltransferase  24.8 
 
 		 478 aa  42.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00324867 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2230  mannose-1-phosphate guanylyltransferase  24.8 
 
 		 478 aa  42.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2338  mannose-1-phosphate guanylyltransferase  24.8 
 
 		 478 aa  42.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2331  mannose-1-phosphate guanylyltransferase  24.8 
 
 		 478 aa  42.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.167233 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0912  Cupin 2 conserved barrel domain protein  36.49 
 
 		 125 aa  42  0.003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1329  mannose-6-phosphate isomerase  29.49 
 
 		 112 aa  42  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0501  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2004  MerR family transcriptional regulator  32.22 
 
 		 178 aa  42  0.003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00158357  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2502  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.67 
 
 		 159 aa  41.6  0.003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.529336 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1575  cupin 2, barrel  38.89 
 
 		 308 aa  42  0.003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2026  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.43 
 
 		 116 aa  42  0.003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0456493  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2121  Cupin 2 conserved barrel domain protein  27.03 
 
 		 121 aa  42  0.003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.625862  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3550  mannose-1-phosphate guanylyltransferase/mannose-6-phosphate isomerase  23.93 
 
 		 480 aa  42  0.003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.520375  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1030  Cupin 2 conserved barrel domain protein  38.57 
 
 		 172 aa  42  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0205  cupin 2 domain-containing protein  24.18 
 
 		 110 aa  41.6  0.004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.633388  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0572  AraC family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 300 aa  41.6  0.004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5336  mannose-1-phosphate guanylyltransferase/mannose-6-phosphate isomerase  23.93 
 
 		 477 aa  41.6  0.004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2600  Cupin 2 conserved barrel domain protein  27.55 
 
 		 133 aa  41.6  0.004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.556264 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00967  mannose-1-phosphate guanylyltransferase  26.21 
 
 		 468 aa  41.2  0.005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1373  ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit  27.66 
 
 		 551 aa  41.2  0.005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3858  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.48 
 
 		 133 aa  40.8  0.006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2663  mannose-1-phosphate guanylyltransferase (GDP)  24.8 
 
 		 478 aa  40.8  0.006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0379621  normal  0.348571 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0468  cupin 2 domain-containing protein  29.25 
 
 		 157 aa  40.4  0.007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6233  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.96 
 
 		 163 aa  40.4  0.007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.398434  normal  0.379299 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3405  Cupin 2 conserved barrel domain protein  26.26 
 
 		 156 aa  40.4  0.007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02481  mannose-1-phosphate guanylyltransferase  26.21 
 
 		 469 aa  40.8  0.007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.271515  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0440  cupin 2, barrel  29.23 
 
 		 149 aa  40.8  0.007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.351298  normal  0.537185 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3902  Cupin 2 conserved barrel domain protein  25.58 
 
 		 166 aa  40.8  0.007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.760355  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4793  mannose-1-phosphate guanylyltransferase/mannose-6-phosphate isomerase  23.08 
 
 		 477 aa  40.4  0.009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.081589  normal  0.402882 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2778  Cupin 2 conserved barrel domain protein  28.24 
 
 		 128 aa  40  0.01  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.492542  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3105  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.43 
 
 		 125 aa  40  0.01  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>