30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_1883 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_1883  Cupin 2 conserved barrel domain protein  100 
 
 		 157 aa  319  9.000000000000001e-87  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0323  Cupin 2 conserved barrel domain protein  57.97 
 
 		 151 aa  164  5.9999999999999996e-40  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2000  hypothetical protein  52.48 
 
 		 156 aa  152  1e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0901  Cupin 2 conserved barrel domain-containing protein  52.17 
 
 		 151 aa  148  3e-35  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.554615  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1167  cupin 2 domain-containing protein  49.67 
 
 		 152 aa  146  9e-35  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.168838 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2183  cupin 2, barrel  50.37 
 
 		 166 aa  132  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0487258  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3226  hypothetical protein  45.99 
 
 		 167 aa  128  3e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1243  Cupin 2 conserved barrel domain protein  46.21 
 
 		 161 aa  128  3e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.942705 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2463  Cupin 2 conserved barrel domain protein  47.06 
 
 		 165 aa  128  3e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0556151  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2234  cupin 2, barrel  45.59 
 
 		 159 aa  126  9.000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.328045 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0468  cupin 2 domain-containing protein  42.14 
 
 		 157 aa  121  4e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1373  ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit  43.33 
 
 		 551 aa  98.2  4e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_88029  predicted protein  40.68 
 
 		 741 aa  76.6  0.0000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0692998 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0389  cupin 2 domain-containing protein  32.29 
 
 		 122 aa  62  0.000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0432  cupin region  25 
 
 		 117 aa  52  0.000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.583729  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1595  Cupin 2 conserved barrel domain protein  36.05 
 
 		 123 aa  51.2  0.000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.040843 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0819  cupin 2 domain-containing protein  28.4 
 
 		 123 aa  50.4  0.000009  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0895  cupin 2 domain-containing protein  27.88 
 
 		 125 aa  49.3  0.00002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1435  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31 
 
 		 122 aa  47.8  0.00006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.438384  normal  0.13585 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1397  cupin 2 domain-containing protein  26.67 
 
 		 115 aa  47.4  0.00007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0319163  normal  0.27943 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5005  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.8 
 
 		 255 aa  46.6  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.158315  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7501  gentisate 1,2-dioxygenase  30.85 
 
 		 345 aa  46.2  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.398812 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1387  cupin 2, barrel  38.24 
 
 		 379 aa  45.8  0.0002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.125216  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2026  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31 
 
 		 116 aa  44.3  0.0006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0456493  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1603  cupin 2 domain-containing protein  27.03 
 
 		 123 aa  42.7  0.002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2254  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.08 
 
 		 370 aa  42  0.003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1036  cupin 2 domain-containing protein  26.8 
 
 		 104 aa  41.2  0.005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.276855  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4214  cupin 2 domain-containing protein  25.42 
 
 		 387 aa  40.8  0.007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.358042  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1633  cupin 2 domain-containing protein  25.56 
 
 		 113 aa  40.8  0.008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.905106  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0134  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.29 
 
 		 118 aa  40.8  0.008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>