57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_1036 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009718  Fnod_1036  cupin 2 domain-containing protein  100 
 
 		 104 aa  216  8.999999999999998e-56  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.276855  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1633  cupin 2 domain-containing protein  59.6 
 
 		 113 aa  130  5e-30  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.905106  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1351  cupin 2 domain-containing protein  52.34 
 
 		 114 aa  122  1e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00886277  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1335  cupin 2 domain-containing protein  52.34 
 
 		 114 aa  122  1e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000568302  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0389  cupin 2 domain-containing protein  51.61 
 
 		 122 aa  100  6e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1386  cupin 2 domain-containing protein  43.62 
 
 		 116 aa  92.8  1e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2026  Cupin 2 conserved barrel domain protein  47.78 
 
 		 116 aa  90.1  8e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0456493  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1397  cupin 2 domain-containing protein  45.35 
 
 		 115 aa  82.8  0.000000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0319163  normal  0.27943 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0602  Cupin 2 conserved barrel domain protein  40.48 
 
 		 118 aa  81.6  0.000000000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1595  Cupin 2 conserved barrel domain protein  40 
 
 		 123 aa  74.7  0.0000000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.040843 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2600  Cupin 2 conserved barrel domain protein  38.89 
 
 		 133 aa  70.5  0.000000000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.556264 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2121  Cupin 2 conserved barrel domain protein  36.36 
 
 		 121 aa  69.3  0.00000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.625862  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0303  Cupin 2 conserved barrel domain protein  36.36 
 
 		 121 aa  67  0.00000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1435  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.33 
 
 		 122 aa  62.8  0.000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.438384  normal  0.13585 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0432  cupin region  31.03 
 
 		 117 aa  59.3  0.00000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.583729  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0819  cupin 2 domain-containing protein  33.72 
 
 		 123 aa  58.9  0.00000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2400  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.76 
 
 		 127 aa  51.6  0.000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1167  cupin 2 domain-containing protein  25.81 
 
 		 152 aa  50.1  0.00001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.168838 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2501  cupin 2 domain-containing protein  31.87 
 
 		 135 aa  48.5  0.00003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.342935  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2685  cupin 2 domain-containing protein  32.14 
 
 		 134 aa  47.8  0.00005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.477579  hitchhiker  0.0004758 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0468  cupin 2 domain-containing protein  29.35 
 
 		 157 aa  47  0.00009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2583  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.35 
 
 		 115 aa  46.6  0.0001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1551  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.18 
 
 		 132 aa  44.7  0.0004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0911719  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0281  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.52 
 
 		 122 aa  44.7  0.0004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1041  cupin 2 domain-containing protein  30.77 
 
 		 311 aa  44.7  0.0004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.421449  normal  0.0580221 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1603  cupin 2 domain-containing protein  28.43 
 
 		 123 aa  43.5  0.001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1351  cupin 2 domain-containing protein  31.03 
 
 		 132 aa  43.1  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.300773  normal  0.281811 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0884  cupin 2, barrel  40 
 
 		 191 aa  43.1  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0895  cupin 2 domain-containing protein  28.21 
 
 		 125 aa  43.5  0.001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2985  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.47 
 
 		 142 aa  42.4  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.171008  normal  0.0376623 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1181  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.08 
 
 		 192 aa  42.7  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.229288 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1532  cupin 2 domain-containing protein  36 
 
 		 115 aa  42.7  0.002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5708  cupin 2 domain-containing protein  25.61 
 
 		 111 aa  42.7  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.203885  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1270  hypothetical protein  32.95 
 
 		 140 aa  42.7  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5793  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.44 
 
 		 141 aa  42  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0814644 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0147  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.53 
 
 		 141 aa  42  0.003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04818  cupin domain  30.67 
 
 		 141 aa  41.6  0.003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0847  hypothetical protein  26.8 
 
 		 132 aa  41.6  0.004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.166508  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2037  Cupin 2 conserved barrel domain protein  36.92 
 
 		 112 aa  41.6  0.004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0486792  normal  0.209563 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2286  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31 
 
 		 114 aa  41.6  0.004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2778  Cupin 2 conserved barrel domain protein  28.21 
 
 		 111 aa  41.6  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.936799 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3146  cupin 2 domain-containing protein  29.29 
 
 		 134 aa  41.2  0.005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4272  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.07 
 
 		 149 aa  41.2  0.005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.510368  normal  0.109894 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2234  cupin 2, barrel  30 
 
 		 159 aa  41.2  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.328045 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1883  Cupin 2 conserved barrel domain protein  26.8 
 
 		 157 aa  41.2  0.005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0737  cupin 2 domain-containing protein  30.95 
 
 		 207 aa  41.2  0.005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2039  cupin 2, barrel  24.74 
 
 		 136 aa  40.8  0.006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.454361  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0826  Cupin 2 conserved barrel domain protein  25.26 
 
 		 115 aa  40.8  0.006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0273  XRE family transcriptional regulator  27.14 
 
 		 176 aa  40.8  0.006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.0000144131  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2440  hypothetical protein  36.49 
 
 		 129 aa  40.8  0.006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0542121  normal  0.878166 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0275  cupin 2 domain-containing protein  27.14 
 
 		 188 aa  40.8  0.007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000353927  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1831  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.27 
 
 		 149 aa  40.8  0.007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00137972  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0825  cupin 2 domain-containing protein  23.16 
 
 		 136 aa  40.8  0.007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0570  methionine--tRNA ligase  35.94 
 
 		 659 aa  40.4  0.007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.755013 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1951  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.89 
 
 		 131 aa  40.4  0.008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.578106  normal  0.399763 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8329  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.21 
 
 		 140 aa  40.4  0.009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.972022  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3486  hypothetical protein  31.17 
 
 		 133 aa  40.4  0.009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.927106 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>