176 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_2440 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008009  Acid345_2440  hypothetical protein  100 
 
 		 129 aa  265  1e-70  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0542121  normal  0.878166 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5381  Cupin 2 conserved barrel domain protein  59.69 
 
 		 132 aa  158  3e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3906  cupin 2 domain-containing protein  55.81 
 
 		 133 aa  151  2.9999999999999998e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.000227782  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4006  cupin 2 domain-containing protein  64.76 
 
 		 137 aa  149  8.999999999999999e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.244405  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1491  cupin:protein of unknown function DUF861  57.48 
 
 		 133 aa  147  6e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3737  cupin 2 domain-containing protein  53.72 
 
 		 135 aa  142  2e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.107824  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2329  Cupin 2 conserved barrel domain protein  52.85 
 
 		 128 aa  140  6e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.0016638  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2654  Cupin 2 conserved barrel domain protein  60.19 
 
 		 128 aa  140  8e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.810725  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2444  hypothetical protein  58.88 
 
 		 141 aa  135  1e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.406383  normal  0.979022 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3695  cupin region  41.6 
 
 		 127 aa  78.6  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1767  cupin 2, barrel  40.8 
 
 		 127 aa  78.6  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0773162  normal  0.597439 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2205  Cupin 2 conserved barrel domain protein  42.16 
 
 		 141 aa  78.2  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1605  cupin 2, barrel  40.68 
 
 		 127 aa  77.4  0.00000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.843392  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4460  Cupin 2 conserved barrel domain protein  37.5 
 
 		 140 aa  77  0.00000000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0766179  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4530  cupin 2 domain-containing protein  41.51 
 
 		 140 aa  72.8  0.000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.812738  normal  0.896938 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4123  hypothetical protein  36.44 
 
 		 129 aa  71.6  0.000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.685288  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0116  cupin 2 domain-containing protein  41.35 
 
 		 136 aa  71.6  0.000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1779  Cupin 2 conserved barrel domain protein  41.51 
 
 		 131 aa  68.9  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3157  Cupin 2 conserved barrel domain protein  37.19 
 
 		 129 aa  68.6  0.00000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.737145  normal  0.282512 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5386  hypothetical protein  37.8 
 
 		 127 aa  66.6  0.0000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.272839  normal  0.670212 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3788  cupin 2 domain-containing protein  31.3 
 
 		 133 aa  65.9  0.0000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.140912  normal  0.456948 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1503  cupin 2 domain-containing protein  31.45 
 
 		 133 aa  65.1  0.0000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3204  cupin region  36.14 
 
 		 150 aa  62  0.000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0134576 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4316  cupin 2  31.4 
 
 		 146 aa  60.1  0.000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0735  cupin 2 domain-containing protein  36.14 
 
 		 178 aa  59.7  0.00000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2920  cupin 2, barrel  32.35 
 
 		 134 aa  57  0.0000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.288591  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5795  cupin 2 domain-containing protein  28.68 
 
 		 135 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.732811  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4890  Cupin 2 conserved barrel domain protein  36.29 
 
 		 134 aa  55.8  0.0000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.625882 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6639  cupin 2 domain-containing protein  31.54 
 
 		 135 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0292958  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3724  hypothetical protein  26.72 
 
 		 157 aa  54.7  0.0000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5430  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.26 
 
 		 139 aa  54.7  0.0000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5056  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.55 
 
 		 133 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0370159 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1578  cupin region  32.26 
 
 		 134 aa  53.1  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.489903  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0092  hypothetical protein  30.34 
 
 		 134 aa  53.1  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4181  cupin 2, barrel  33.33 
 
 		 151 aa  53.1  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4247  cupin 2 domain-containing protein  33.33 
 
 		 151 aa  53.1  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.308806 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4403  cupin 2 domain-containing protein  33.33 
 
 		 151 aa  53.1  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.707936  normal  0.738548 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4626  cupin 2 domain-containing protein  39.39 
 
 		 134 aa  52.4  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000448523 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5578  cupin 2 domain-containing protein  29.03 
 
 		 134 aa  52.8  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2420  Cupin 2 conserved barrel domain protein  27.13 
 
 		 135 aa  52.4  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.796075 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1426  hypothetical protein  29.77 
 
 		 130 aa  52  0.000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.416507  normal  0.349881 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0348  hypothetical protein  31.46 
 
 		 135 aa  52  0.000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5346  cupin 2 domain-containing protein  33.71 
 
 		 171 aa  52  0.000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0870556 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2343  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.83 
 
 		 139 aa  51.6  0.000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2490  hypothetical protein  33.33 
 
 		 132 aa  51.6  0.000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.440666  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5642  Cupin 2 conserved barrel domain protein  41.94 
 
 		 179 aa  51.2  0.000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6168  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.29 
 
 		 172 aa  51.2  0.000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03510  hypothetical protein  31.46 
 
 		 135 aa  51.6  0.000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.866507  hitchhiker  0.00000000000000348857 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5062  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.48 
 
 		 136 aa  50.8  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2037  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.88 
 
 		 112 aa  49.7  0.00001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0486792  normal  0.209563 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5257  cupin 2, barrel  38.18 
 
 		 131 aa  50.1  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5602  cupin 2 domain-containing protein  38.18 
 
 		 131 aa  50.1  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.418121 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4505  cupin 2 domain-containing protein  31.91 
 
 		 145 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0594  hypothetical protein  34.21 
 
 		 143 aa  48.5  0.00003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7642  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.6 
 
 		 138 aa  48.5  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0261511  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5435  hypothetical protein  32.26 
 
 		 145 aa  48.9  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.534413  normal  0.706923 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_13891  hypothetical protein  34.21 
 
 		 143 aa  48.5  0.00003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0865  cupin 2 domain-containing protein  47.06 
 
 		 109 aa  48.5  0.00003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1923  Cupin 2 conserved barrel domain protein  49.09 
 
 		 145 aa  48.1  0.00004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0356258  normal  0.456316 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1999  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.46 
 
 		 134 aa  47.8  0.00005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2731  Cupin 2 conserved barrel domain protein  38.81 
 
 		 113 aa  47.8  0.00005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.497805  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4002  cupin 2 protein  31.25 
 
 		 126 aa  47.4  0.00007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2102  cupin 2 domain-containing protein  32.56 
 
 		 134 aa  47.4  0.00007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2501  cupin 2 domain-containing protein  43.33 
 
 		 135 aa  47.4  0.00007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.342935  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2268  cupin 2 domain-containing protein  33.82 
 
 		 111 aa  47.4  0.00007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1396  cupin 2 domain-containing protein  32.56 
 
 		 102 aa  47.4  0.00008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8435  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.11 
 
 		 139 aa  47  0.00008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2285  Cupin 2 conserved barrel domain protein  27.42 
 
 		 173 aa  47  0.00008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1558  cupin 2 domain-containing protein  39.39 
 
 		 180 aa  47  0.00009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3496  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.05 
 
 		 140 aa  46.6  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0995  cupin region  38.3 
 
 		 138 aa  46.2  0.0001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1181  Cupin 2 conserved barrel domain protein  37.35 
 
 		 192 aa  46.2  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.229288 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0623  cupin 2 domain-containing protein  32.93 
 
 		 148 aa  46.6  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.339889  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5822  cupin 2 domain-containing protein  31.25 
 
 		 141 aa  47  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.186045 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2274  cupin region  34.07 
 
 		 137 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.921638  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4136  Cupin 2 conserved barrel domain protein  45.45 
 
 		 127 aa  45.8  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1346  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.92 
 
 		 150 aa  45.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.787585  hitchhiker  0.0000000363501 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_10991  double-stranded beta-helix domain-containing protein  31.4 
 
 		 146 aa  45.8  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1318  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.92 
 
 		 150 aa  45.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2685  cupin 2 domain-containing protein  41.67 
 
 		 134 aa  46.2  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.477579  hitchhiker  0.0004758 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7693  transcriptional regulator MerR family  33.33 
 
 		 271 aa  45.4  0.0003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.56372  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0195  cupin domain-containing protein  30.49 
 
 		 318 aa  45.1  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.579249  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6088  cupin 2 domain-containing protein  33.7 
 
 		 138 aa  45.1  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1706  cupin 2 protein  27.97 
 
 		 136 aa  45.1  0.0003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.42595  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3716  cupin 2, barrel  37.1 
 
 		 129 aa  45.1  0.0003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.000701811  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6385  cupin 2 domain-containing protein  33.7 
 
 		 138 aa  45.4  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.128861 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0295  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.18 
 
 		 134 aa  45.1  0.0003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0238  Cupin 2 conserved barrel domain protein  41.07 
 
 		 111 aa  45.1  0.0003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.519233  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6134  cupin region  37.5 
 
 		 138 aa  44.7  0.0004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4282  cupin 2 domain-containing protein  32.61 
 
 		 137 aa  45.1  0.0004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0273  cupin 2 domain-containing protein  35.06 
 
 		 141 aa  44.7  0.0004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1504  Cupin 2 conserved barrel domain protein  40.74 
 
 		 111 aa  44.3  0.0005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.220487  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33680  Protein of unknown function (DUF861)  41.94 
 
 		 147 aa  44.7  0.0005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.741976  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0837  cupin 2 domain-containing protein  33.85 
 
 		 125 aa  44.3  0.0006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.168826 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4272  Cupin 2 conserved barrel domain protein  36 
 
 		 149 aa  44.3  0.0006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.510368  normal  0.109894 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5737  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.32 
 
 		 139 aa  44.3  0.0006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1306  transcriptional regulator, XRE family  32.63 
 
 		 170 aa  43.9  0.0007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000237827 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5435  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.85 
 
 		 149 aa  43.9  0.0007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.657648 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2919  transcriptional regulator, XRE family  32.63 
 
 		 170 aa  43.9  0.0007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4297  cupin 2 domain-containing protein  39.22 
 
 		 144 aa  43.9  0.0008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>