84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_0884 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_0884  cupin 2, barrel  100 
 
 		 191 aa  384  1e-106  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5028  cupin 2 domain-containing protein  40.22 
 
 		 210 aa  124  6e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0181  Cupin 2 conserved barrel domain protein  40.8 
 
 		 184 aa  111  5e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10448  hypothetical protein  30.28 
 
 		 179 aa  70.5  0.00000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0119  Cupin 2 conserved barrel domain protein  26.11 
 
 		 195 aa  68.9  0.00000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.338448  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0633  cupin 2 domain-containing protein  30.67 
 
 		 158 aa  64.7  0.0000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.643791  normal  0.229137 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3191  cupin 2, barrel  30.43 
 
 		 179 aa  64.3  0.0000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0000053457  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1069  Cupin 2 conserved barrel domain protein  50 
 
 		 117 aa  59.7  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.486556 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0452  Cupin 2 conserved barrel domain protein  37.08 
 
 		 136 aa  58.2  0.00000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3791  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.33 
 
 		 159 aa  56.6  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.302037  normal  0.0222415 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4108  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.98 
 
 		 165 aa  56.6  0.0000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4406  Cupin 2 conserved barrel domain protein  37.11 
 
 		 169 aa  56.2  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0295153  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5708  cupin 2 domain-containing protein  37.74 
 
 		 111 aa  56.2  0.0000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.203885  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0105  Cupin 2 conserved barrel domain protein  25.76 
 
 		 204 aa  55.1  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3902  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.01 
 
 		 166 aa  55.1  0.0000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.760355  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2327  cupin 2 domain-containing protein  30.77 
 
 		 150 aa  54.7  0.0000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000139899 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0102  Cupin 2 conserved barrel domain protein  25.76 
 
 		 204 aa  54.7  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.66506 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2609  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.01 
 
 		 160 aa  53.9  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.629  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3189  cupin 2, barrel  37.36 
 
 		 190 aa  53.9  0.000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00000805068  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5299  hypothetical protein  32.74 
 
 		 166 aa  53.1  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.148055  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0602  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.22 
 
 		 118 aa  52.4  0.000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3405  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.75 
 
 		 156 aa  52.4  0.000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2790  cupin 2 domain-containing protein  28.87 
 
 		 153 aa  52.4  0.000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7008  hypothetical protein  31.43 
 
 		 163 aa  52  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0126624  hitchhiker  0.000933462 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4882  hypothetical protein  26.24 
 
 		 145 aa  51.6  0.000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.192272  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1864  Cupin 2 conserved barrel domain protein  24.82 
 
 		 144 aa  50.8  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1447  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.37 
 
 		 190 aa  50.8  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.901222  normal  0.428247 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1181  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.09 
 
 		 192 aa  50.1  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.229288 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2778  Cupin 2 conserved barrel domain protein  44.64 
 
 		 111 aa  50.4  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.936799 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2141  Cupin 2 conserved barrel domain protein  38.55 
 
 		 159 aa  49.7  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2964  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.1 
 
 		 160 aa  48.1  0.00008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.75352  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1714  cupin 2 domain-containing protein  29.69 
 
 		 150 aa  48.1  0.00008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.259313 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1923  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.53 
 
 		 145 aa  47.4  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0356258  normal  0.456316 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0595  cupin 2 domain-containing protein  32.47 
 
 		 165 aa  47.8  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.906672  normal  1 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5435  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.59 
 
 		 149 aa  47.8  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.657648 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0604  cupin 2, barrel  32.47 
 
 		 165 aa  47.8  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.398371  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33680  Protein of unknown function (DUF861)  34.29 
 
 		 147 aa  47.4  0.0001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.741976  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0617  cupin 2 domain-containing protein  32.47 
 
 		 165 aa  47.8  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.546436  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1041  cupin 2 domain-containing protein  45.16 
 
 		 311 aa  47.8  0.0001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.421449  normal  0.0580221 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0274  transcriptional regulator, XRE family  32.69 
 
 		 205 aa  47  0.0002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.64998  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3067  cupin 2 domain-containing protein  31.18 
 
 		 145 aa  46.2  0.0003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1729  transcriptional regulator, XRE family  39.74 
 
 		 195 aa  46.2  0.0003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.114176  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0144  cupin 2 domain-containing protein  31.25 
 
 		 165 aa  46.2  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1207  Cupin 2 conserved barrel domain protein  26.39 
 
 		 152 aa  46.2  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.830198  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3140  conserved hypothetical phosphomannose protein  33.75 
 
 		 137 aa  46.2  0.0003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0445  Cupin 2 conserved barrel domain protein  44.64 
 
 		 123 aa  46.2  0.0003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.205887 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1009  cupin family protein  24.71 
 
 		 119 aa  45.1  0.0006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5545  cupin 2 domain-containing protein  35.14 
 
 		 141 aa  45.1  0.0007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0193  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.77 
 
 		 126 aa  43.9  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.539282  normal  0.99492 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1709  cupin 2, barrel  30.68 
 
 		 163 aa  43.9  0.001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.448021 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0692  cupin 2 domain-containing protein  32 
 
 		 163 aa  43.9  0.001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0865  cupin 2 domain-containing protein  36.78 
 
 		 109 aa  44.3  0.001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3197  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.26 
 
 		 191 aa  44.3  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.229687  normal  0.39078 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0432  cupin region  23.01 
 
 		 117 aa  43.5  0.002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.583729  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0204  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.58 
 
 		 160 aa  43.1  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0320  cupin 2 domain-containing protein  25.56 
 
 		 146 aa  43.5  0.002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.864661  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3706  Cupin 2 conserved barrel domain protein  28.69 
 
 		 163 aa  43.5  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6281  hypothetical protein  29.46 
 
 		 149 aa  43.9  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1396  cupin 2 domain-containing protein  47.92 
 
 		 102 aa  43.1  0.002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1036  cupin 2 domain-containing protein  40 
 
 		 104 aa  43.1  0.002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.276855  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4126  cupin 2 domain-containing protein  32.95 
 
 		 119 aa  43.5  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0134  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32 
 
 		 118 aa  43.9  0.002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1023  cupin 2 domain-containing protein  32.73 
 
 		 120 aa  43.1  0.002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2249  cupin 2, barrel  33.82 
 
 		 143 aa  43.5  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2629  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.88 
 
 		 138 aa  43.1  0.003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1646  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.78 
 
 		 116 aa  42.7  0.003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3638  cupin 2 domain-containing protein  26.61 
 
 		 152 aa  42.7  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.588869  normal  0.0557412 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0929  XRE family transcriptional regulator  36.07 
 
 		 224 aa  42.7  0.003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.145461  normal  0.153472 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0016  mannose-1-phosphate guanylyltransferase/mannose- 6-phosphate isomerase  32.39 
 
 		 447 aa  42.4  0.004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3556  Cupin 2 conserved barrel domain protein  26.92 
 
 		 169 aa  42.4  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3503  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.06 
 
 		 182 aa  42.4  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0760  cupin 2 domain-containing protein  29.87 
 
 		 178 aa  42.4  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.26011  normal  0.519438 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3570  rhamnose ABC transporter, periplasmic rhamnose-binding protein  30 
 
 		 331 aa  42.4  0.005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0352467  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6233  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30 
 
 		 163 aa  41.6  0.007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.398434  normal  0.379299 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01320  hypothetical protein  32.91 
 
 		 122 aa  41.6  0.007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.333196  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2409  cupin family protein  38.1 
 
 		 114 aa  41.6  0.007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000116838  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1159  putative transcription regulator protein  30.53 
 
 		 182 aa  41.6  0.008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.109435 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0389  cupin 2 domain-containing protein  30.93 
 
 		 122 aa  41.2  0.008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1033  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.71 
 
 		 172 aa  41.6  0.008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.714129  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0577  hypothetical protein  42.86 
 
 		 125 aa  41.2  0.008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.116523  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1228  Cupin 2 conserved barrel domain protein  28.44 
 
 		 135 aa  41.2  0.009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.066401  normal  0.685252 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1863  cupin 2 domain-containing protein  45.83 
 
 		 100 aa  41.2  0.01  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.524548 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1444  cupin 2 domain-containing protein  32.26 
 
 		 132 aa  41.2  0.01  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0971  cupin domain-containing protein  31.71 
 
 		 171 aa  41.2  0.01  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.341283  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>