115 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbur_1009 on replicon NC_007955
Organism: Methanococcoides burtonii DSM 6242



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007955  Mbur_1009  cupin family protein  100 
 
 		 119 aa  246  1e-64  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1827  hypothetical protein  60.5 
 
 		 121 aa  150  4e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1904  cupin region  55.93 
 
 		 120 aa  141  2e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2327  cupin 2 domain-containing protein  56.3 
 
 		 150 aa  139  9.999999999999999e-33  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000139899 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2629  Cupin 2 conserved barrel domain protein  55.56 
 
 		 138 aa  138  3e-32  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0134  Cupin 2 conserved barrel domain protein  57.63 
 
 		 118 aa  137  3.9999999999999997e-32  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3140  conserved hypothetical phosphomannose protein  57.89 
 
 		 137 aa  130  6.999999999999999e-30  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0193  Cupin 2 conserved barrel domain protein  47.01 
 
 		 126 aa  116  9e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.539282  normal  0.99492 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2847  Cupin 2 conserved barrel domain protein  36.36 
 
 		 119 aa  80.1  0.000000000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0104  cupin  35.51 
 
 		 122 aa  77.4  0.00000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.300673  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13508  hypothetical protein  40.2 
 
 		 177 aa  75.5  0.0000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2973  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  36.19 
 
 		 274 aa  70.1  0.00000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01320  hypothetical protein  35.45 
 
 		 122 aa  61.6  0.000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.333196  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1757  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.19 
 
 		 125 aa  57.8  0.00000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.128793  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3001  cupin 2 domain-containing protein  32.35 
 
 		 124 aa  55.5  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3988  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.85 
 
 		 146 aa  55.8  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.507618  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2501  cupin 2 domain-containing protein  28.83 
 
 		 135 aa  54.3  0.0000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.342935  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1023  cupin 2 domain-containing protein  27.12 
 
 		 120 aa  53.9  0.0000006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2685  cupin 2 domain-containing protein  27.93 
 
 		 134 aa  53.9  0.0000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.477579  hitchhiker  0.0004758 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4126  cupin 2 domain-containing protein  26.67 
 
 		 119 aa  53.9  0.0000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1488  cupin 2 domain-containing protein  41.43 
 
 		 115 aa  53.5  0.0000009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00804045  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0577  hypothetical protein  40.23 
 
 		 125 aa  53.1  0.000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.116523  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1603  cupin 2 domain-containing protein  30 
 
 		 123 aa  52.4  0.000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2502  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.06 
 
 		 159 aa  52.4  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.529336 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2672  hypothetical protein  34.85 
 
 		 159 aa  52  0.000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.311364  normal  0.391613 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2908  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.06 
 
 		 159 aa  51.2  0.000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1532  cupin 2 domain-containing protein  36.05 
 
 		 115 aa  50.8  0.000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5786  cupin 2 conserved barrel domain protein  29.63 
 
 		 135 aa  50.8  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.242076  normal  0.0379764 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5139  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.63 
 
 		 126 aa  50.4  0.000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.168258  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4274  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.78 
 
 		 150 aa  49.7  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.680617 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0440  cupin 2, barrel  34.67 
 
 		 149 aa  49.3  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.351298  normal  0.537185 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3146  cupin 2 domain-containing protein  26.88 
 
 		 134 aa  48.9  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1444  cupin 2 domain-containing protein  28 
 
 		 132 aa  48.9  0.00003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8561  Cupin 2 conserved barrel domain protein  36.36 
 
 		 140 aa  48.5  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.853837  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1595  Cupin 2 conserved barrel domain protein  28.16 
 
 		 123 aa  48.1  0.00004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.040843 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3333  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.73 
 
 		 294 aa  48.1  0.00004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0663795  normal  0.136427 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7008  hypothetical protein  26.92 
 
 		 163 aa  47.4  0.00007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0126624  hitchhiker  0.000933462 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3858  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.27 
 
 		 133 aa  47  0.00008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1305  cupin 2, barrel  38.1 
 
 		 115 aa  47  0.00009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0335072  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1654  hypothetical protein  26.09 
 
 		 134 aa  47  0.0001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.225443  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1397  cupin 2 domain-containing protein  31.82 
 
 		 115 aa  46.6  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0319163  normal  0.27943 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2414  hypothetical protein  32.56 
 
 		 155 aa  46.2  0.0001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.478977  normal  0.947675 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33680  Protein of unknown function (DUF861)  30.56 
 
 		 147 aa  46.6  0.0001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.741976  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0801  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.82 
 
 		 122 aa  46.2  0.0001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.332449  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1270  hypothetical protein  33.33 
 
 		 140 aa  45.8  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0722  bicupin, oxalate decarboxylase family  34.62 
 
 		 234 aa  45.4  0.0002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5302  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.33 
 
 		 153 aa  45.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5434  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.47 
 
 		 135 aa  45.4  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.429783  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1285  cupin region  28.26 
 
 		 113 aa  45.1  0.0003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0884  cupin 2, barrel  24.71 
 
 		 191 aa  45.1  0.0003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1819  hypothetical protein  32.81 
 
 		 114 aa  44.7  0.0004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2322  oxalate decarboxylase  30.84 
 
 		 389 aa  44.7  0.0004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2031  mannose-1-phosphate guanylyltransferase/mannose-6-phosphate isomerase  32.22 
 
 		 478 aa  45.1  0.0004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0272076  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3638  cupin 2 domain-containing protein  28.24 
 
 		 152 aa  44.7  0.0004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.588869  normal  0.0557412 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3867  Cupin 2 conserved barrel domain protein  27.38 
 
 		 145 aa  44.7  0.0004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.468547  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4417  cupin:cupin region  34.29 
 
 		 155 aa  44.3  0.0005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1181  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.26 
 
 		 192 aa  44.7  0.0005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.229288 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2265  cupin 2 domain-containing protein  28.77 
 
 		 172 aa  44.3  0.0005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.97009  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2836  DNA-binding protein  30.21 
 
 		 184 aa  44.3  0.0005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000716748  hitchhiker  0.00000000374058 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3902  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.77 
 
 		 166 aa  43.9  0.0008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.760355  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2392  cupin 2 domain-containing protein  29.73 
 
 		 140 aa  43.5  0.0009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.232938  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0206  Cupin 2 conserved barrel domain protein  37.1 
 
 		 115 aa  43.5  0.0009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3712  cupin region  28.77 
 
 		 172 aa  43.1  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.963003  normal  0.584711 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0692  cupin 2 domain-containing protein  28.95 
 
 		 163 aa  43.5  0.001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3184  cupin region  28.75 
 
 		 162 aa  43.5  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2121  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.79 
 
 		 121 aa  43.1  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.625862  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5005  Cupin 2 conserved barrel domain protein  37.5 
 
 		 255 aa  43.1  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.158315  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1207  Cupin 2 conserved barrel domain protein  27.78 
 
 		 152 aa  43.1  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.830198  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1678  mannose-1-phosphate guanylyltransferase/mannose-6-phosphate isomerase  28.24 
 
 		 467 aa  42.7  0.002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0432  cupin region  29.47 
 
 		 117 aa  42.4  0.002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.583729  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1468  cupin 2 domain-containing protein  35.82 
 
 		 190 aa  42.7  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0572  AraC family transcriptional regulator  27.38 
 
 		 300 aa  42.7  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2945  cupin 2 domain-containing protein  27.71 
 
 		 171 aa  42.4  0.002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0544  hypothetical protein, putative phage gene  31.4 
 
 		 116 aa  42.7  0.002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.597495  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0381  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.75 
 
 		 103 aa  42.4  0.002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.754668  normal  0.233584 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1646  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.53 
 
 		 116 aa  42.7  0.002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08099  oxalate decarboxylase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G14610)  36 
 
 		 477 aa  42  0.003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.361819  normal  0.0552946 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0230  transcriptional regulator  30.21 
 
 		 197 aa  42  0.003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5012  hypothetical protein  34.29 
 
 		 155 aa  42  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0120588  normal  0.173507 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2161  cupin 2 domain-containing protein  35.9 
 
 		 152 aa  41.6  0.003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0191913  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2315  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.35 
 
 		 374 aa  41.6  0.003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1579  TonB box-like  32.86 
 
 		 151 aa  41.6  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0694121  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2863  cupin 2, barrel  25.71 
 
 		 107 aa  41.2  0.004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1315  cupin 2 domain-containing protein  32.53 
 
 		 163 aa  41.6  0.004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00314344  normal  0.472915 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1069  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.58 
 
 		 117 aa  41.6  0.004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.486556 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0177  cupin 2 domain-containing protein  21.36 
 
 		 148 aa  41.6  0.004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.178476 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1358  cupin 2 domain-containing protein  29.85 
 
 		 119 aa  41.6  0.004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.660301  normal  0.0940885 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2778  Cupin 2 conserved barrel domain protein  38.98 
 
 		 128 aa  41.6  0.004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.492542  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3512  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.27 
 
 		 126 aa  41.6  0.004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1644  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.11 
 
 		 154 aa  41.6  0.004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.522674  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2605  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.27 
 
 		 126 aa  41.6  0.004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0523242  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5804  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.41 
 
 		 123 aa  41.6  0.004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003224  mannose-6-phosphate isomerase  29.07 
 
 		 116 aa  41.6  0.004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0709  homogentisate 12-dioxygenase  31.82 
 
 		 397 aa  41.6  0.004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4136  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.55 
 
 		 127 aa  41.6  0.004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0147  Cupin 2 conserved barrel domain protein  27.78 
 
 		 141 aa  41.2  0.005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2662  cupin 2 domain-containing protein  28.57 
 
 		 119 aa  41.2  0.005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0320  cupin 2 domain-containing protein  26.83 
 
 		 146 aa  41.2  0.005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.864661  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0413  Cupin domain protein  29.35 
 
 		 198 aa  41.2  0.005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0926264  normal  0.0398077 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4456  hypothetical protein  22.11 
 
 		 129 aa  40.8  0.006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0285903  normal  0.0443513 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>