58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_2249 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_2249  cupin 2, barrel  100 
 
 		 143 aa  298  2e-80  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1603  cupin 2 domain-containing protein  28.3 
 
 		 123 aa  59.3  0.00000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2400  Cupin 2 conserved barrel domain protein  26.79 
 
 		 127 aa  52  0.000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05332  AraC-like ligand binding domain protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G14370)  33.33 
 
 		 203 aa  49.7  0.00001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.484672  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1181  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.83 
 
 		 192 aa  49.3  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.229288 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0819  cupin 2 domain-containing protein  23.76 
 
 		 123 aa  48.1  0.00004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2906  hypothetical protein  29.58 
 
 		 106 aa  47  0.00008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.808157  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3902  Cupin 2 conserved barrel domain protein  28.87 
 
 		 166 aa  46.6  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.760355  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2945  cupin 2 domain-containing protein  28.03 
 
 		 171 aa  45.8  0.0002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0262  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.11 
 
 		 121 aa  45.8  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.11735 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4297  cupin 2 domain-containing protein  26.51 
 
 		 144 aa  45.4  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5435  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.47 
 
 		 149 aa  45.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.657648 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2053  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.82 
 
 		 118 aa  45.4  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1646  Cupin 2 conserved barrel domain protein  37.31 
 
 		 116 aa  45.4  0.0003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2414  hypothetical protein  24.35 
 
 		 155 aa  45.1  0.0003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.478977  normal  0.947675 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3472  hypothetical protein  32.53 
 
 		 276 aa  45.1  0.0003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.489268  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3146  cupin 2 domain-containing protein  27.59 
 
 		 134 aa  44.7  0.0004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0266  Cupin 2 conserved barrel domain protein  27.94 
 
 		 130 aa  44.3  0.0006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.465169  normal  0.12222 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2778  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.76 
 
 		 128 aa  43.9  0.0007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.492542  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1044  methionine--tRNA ligase  34.38 
 
 		 671 aa  43.9  0.0008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.120671 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4521  hypothetical protein  26.8 
 
 		 129 aa  43.9  0.0008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2327  cupin 2 domain-containing protein  26.85 
 
 		 150 aa  43.5  0.0009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000139899 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1041  cupin 2 domain-containing protein  26.61 
 
 		 311 aa  43.5  0.0009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.421449  normal  0.0580221 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0884  cupin 2, barrel  33.82 
 
 		 191 aa  43.5  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2148  Cupin 2 conserved barrel domain protein  26.47 
 
 		 133 aa  43.5  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.0024464  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5804  Cupin 2 conserved barrel domain protein  22.55 
 
 		 123 aa  43.5  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2037  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.95 
 
 		 112 aa  43.1  0.001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0486792  normal  0.209563 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3773  Cupin 2 conserved barrel domain protein  26.76 
 
 		 421 aa  43.1  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.239832  normal  0.155443 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0193  Cupin 2 conserved barrel domain protein  27.63 
 
 		 126 aa  42.4  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.539282  normal  0.99492 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4993  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.78 
 
 		 137 aa  42.7  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.391501  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0837  cupin 2 domain-containing protein  29.27 
 
 		 125 aa  42.4  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.168826 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4882  hypothetical protein  28 
 
 		 145 aa  42.7  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.192272  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4715  Cupin 2 conserved barrel domain protein  27.19 
 
 		 127 aa  42  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4456  hypothetical protein  22.77 
 
 		 129 aa  41.6  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0285903  normal  0.0443513 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0177  cupin 2 domain-containing protein  28.57 
 
 		 148 aa  42  0.003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.178476 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6318  Methionine--tRNA ligase  27.16 
 
 		 662 aa  41.6  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.955979 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2026  Cupin 2 conserved barrel domain protein  25.23 
 
 		 116 aa  41.6  0.004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0456493  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1069  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.88 
 
 		 117 aa  41.6  0.004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.486556 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1714  cupin 2 domain-containing protein  33.33 
 
 		 150 aa  41.2  0.005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.259313 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4274  Cupin 2 conserved barrel domain protein  24.76 
 
 		 150 aa  41.2  0.005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.680617 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3270  gentisate 1,2-dioxygenase  34.72 
 
 		 342 aa  40.8  0.006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.395363 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2433  gentisate 1,2-dioxygenase  34.72 
 
 		 342 aa  40.8  0.006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4249  Acireductone dioxygenase ARD  30.3 
 
 		 152 aa  40.8  0.007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.262659  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0109  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.26 
 
 		 377 aa  40.4  0.007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.146013 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0825  cupin 2 domain-containing protein  27.96 
 
 		 136 aa  40.8  0.007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3140  conserved hypothetical phosphomannose protein  28.4 
 
 		 137 aa  40.8  0.007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3716  cupin 2, barrel  34.43 
 
 		 129 aa  40.8  0.007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.000701811  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33680  Protein of unknown function (DUF861)  32.2 
 
 		 147 aa  40.4  0.008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.741976  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1023  cupin 2 domain-containing protein  29.63 
 
 		 120 aa  40.4  0.008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1662  cupin 2 domain-containing protein  31.17 
 
 		 108 aa  40.4  0.008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000140317  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1663  DNA-binding protein  30.77 
 
 		 185 aa  40.4  0.008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0865  cupin 2 domain-containing protein  32 
 
 		 109 aa  40.4  0.008  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2799  hypothetical protein  28.57 
 
 		 104 aa  40.4  0.008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.7832900000000002e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2409  cupin family protein  28.33 
 
 		 114 aa  40.4  0.008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000116838  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0895  cupin 2 domain-containing protein  28.89 
 
 		 125 aa  40.4  0.009  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2440  hypothetical protein  32.81 
 
 		 129 aa  40.4  0.009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0542121  normal  0.878166 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0981  gentisate 1,2-dioxygenase  31.03 
 
 		 348 aa  40.4  0.009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.352055  hitchhiker  0.000255596 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0506  hypothetical protein  27.43 
 
 		 126 aa  40  0.01  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0871689  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>