More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_6318 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_6318  Methionine--tRNA ligase  100 
 
 		 662 aa  1349    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.955979 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3273  methionyl-tRNA synthetase  59.85 
 
 		 662 aa  785    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.433163 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3089  Methionine--tRNA ligase  60 
 
 		 749 aa  788    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.107488  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1044  methionine--tRNA ligase  61.83 
 
 		 671 aa  807    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.120671 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0570  methionine--tRNA ligase  33.39 
 
 		 659 aa  288  2.9999999999999996e-76  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.755013 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4208  Methionine--tRNA ligase  31.61 
 
 		 645 aa  276  1.0000000000000001e-72  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0857223  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04125  methionyl-tRNA synthetase  28.82 
 
 		 690 aa  221  3.9999999999999997e-56  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0255166  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1834  methionyl-tRNA synthetase  29.25 
 
 		 688 aa  219  8.999999999999998e-56  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.726687  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2662  Methionine--tRNA ligase  31.43 
 
 		 542 aa  213  9e-54  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3624  Methionine--tRNA ligase  30.85 
 
 		 513 aa  203  9e-51  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1471  methionyl-tRNA synthetase  29.11 
 
 		 682 aa  202  9.999999999999999e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.282843  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0857  methionyl-tRNA synthetase  27.84 
 
 		 711 aa  202  1.9999999999999998e-50  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.318688  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0170  methionyl-tRNA synthetase  28.65 
 
 		 680 aa  194  3e-48  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2149  methionine--tRNA ligase  32.38 
 
 		 536 aa  194  4e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.147199 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2956  methionyl-tRNA synthetase  29.1 
 
 		 691 aa  194  6e-48  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.570356 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1190  methionyl-tRNA synthetase  27.26 
 
 		 702 aa  190  7e-47  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.975612  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_331  methionyl-tRNA synthetase  27.41 
 
 		 553 aa  187  5e-46  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00222615  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1277  hypothetical protein  26.12 
 
 		 557 aa  187  8e-46  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0125783 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2689  methionyl-tRNA synthetase  27.19 
 
 		 689 aa  186  2.0000000000000003e-45  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.404037 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0368  methionyl-tRNA synthetase  26.85 
 
 		 553 aa  186  2.0000000000000003e-45  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000165751  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1197  methionyl-tRNA synthetase  26.77 
 
 		 700 aa  185  3e-45  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0388  methionyl-tRNA synthetase  26.94 
 
 		 553 aa  182  1e-44  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0335428  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1403  methionyl-tRNA synthetase  28.16 
 
 		 705 aa  182  2e-44  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.349899  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5898  methionyl-tRNA synthetase  27.45 
 
 		 565 aa  181  2.9999999999999997e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.41818 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0979  methionyl-tRNA synthetase  28.71 
 
 		 599 aa  181  2.9999999999999997e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.625182  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7066  methionyl-tRNA synthetase  25.56 
 
 		 693 aa  181  4.999999999999999e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.842095  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1186  methionyl-tRNA synthetase  28.11 
 
 		 702 aa  180  7e-44  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.304835 
 
 
-
 
NC_002620  TC0301  methionyl-tRNA synthetase  28.6 
 
 		 550 aa  179  2e-43  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0520884  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0083  methionyl-tRNA synthetase  27.14 
 
 		 702 aa  177  6e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.158203  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1367  methionyl-tRNA synthetase  26.79 
 
 		 704 aa  176  9e-43  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00459582  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0389  methionyl-tRNA synthetase  28.46 
 
 		 606 aa  176  9.999999999999999e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1113  methionyl-tRNA synthetase  26.68 
 
 		 703 aa  176  1.9999999999999998e-42  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1011  methionyl-tRNA synthetase  26.29 
 
 		 702 aa  176  1.9999999999999998e-42  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.493296  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2749  methionyl-tRNA synthetase  29.54 
 
 		 499 aa  172  2e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0342203  normal  0.0114918 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1159  methionyl-tRNA synthetase  27.94 
 
 		 570 aa  172  2e-41  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2964  hypothetical protein  30.21 
 
 		 494 aa  171  3e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.07748  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2037  methionyl-tRNA synthetase  27.41 
 
 		 592 aa  170  6e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.509449  normal  0.192694 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1568  methionyl-tRNA synthetase  27.42 
 
 		 699 aa  170  8e-41  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4070  methionyl-tRNA synthetase  28.52 
 
 		 605 aa  169  1e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.310796  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1317  methionyl-tRNA synthetase  25.92 
 
 		 570 aa  169  1e-40  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0492827  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0619  methionyl-tRNA synthetase  27.75 
 
 		 672 aa  167  4e-40  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0094  methionyl-tRNA synthetase  24.4 
 
 		 734 aa  167  5e-40  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.168493  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8622  tRNA synthetase class I (I, L, M and V)  27.01 
 
 		 593 aa  167  8e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0976  methionyl-tRNA synthetase  27.57 
 
 		 600 aa  166  1.0000000000000001e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000127359  normal  0.0415567 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3011  methionyl-tRNA synthetase  27.17 
 
 		 592 aa  166  1.0000000000000001e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.980202  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2785  methionyl-tRNA synthetase  27.93 
 
 		 574 aa  166  2.0000000000000002e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0013223  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2630  methionyl-tRNA synthetase  28.1 
 
 		 577 aa  166  2.0000000000000002e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.285635  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0586  methionyl-tRNA synthetase  28.89 
 
 		 605 aa  165  3e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0283  methionyl-tRNA synthetase  28.97 
 
 		 531 aa  164  4.0000000000000004e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1328  methionyl-tRNA synthetase  26.97 
 
 		 663 aa  164  4.0000000000000004e-39  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1347  methionyl-tRNA synthetase  27.31 
 
 		 663 aa  164  6e-39  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.511485  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1779  methionyl-tRNA synthetase  27.82 
 
 		 565 aa  163  8.000000000000001e-39  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.368344  normal  0.651092 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0902  methionyl-tRNA synthetase  27.58 
 
 		 597 aa  163  9e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.320514  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01380  methionyl-tRNA synthetase (AFU_orthologue; AFUA_1G09010)  27.18 
 
 		 658 aa  163  1e-38  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0346  methionyl-tRNA synthetase  26.82 
 
 		 567 aa  163  1e-38  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05440  methionyl-tRNA synthetase  24.61 
 
 		 540 aa  162  2e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.220303  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0625  methionyl-tRNA synthetase  27.44 
 
 		 663 aa  159  1e-37  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.997771  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0722  methionyl-tRNA synthetase  29.16 
 
 		 600 aa  159  1e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000318448 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1531  methionyl-tRNA synthetase  26.68 
 
 		 617 aa  159  1e-37  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0743167  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0780  methionyl-tRNA synthetase  28.54 
 
 		 603 aa  158  3e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.207529  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32490  methionyl-tRNA synthetase  27.38 
 
 		 595 aa  157  4e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.84169  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1256  methionine--tRNA ligase  27.34 
 
 		 625 aa  157  6e-37  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000206162 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5716  methionyl-tRNA synthetase  26.84 
 
 		 597 aa  156  1e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1337  methionyl-tRNA synthetase  24.8 
 
 		 663 aa  154  7e-36  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4862  methionyl-tRNA synthetase  27.43 
 
 		 544 aa  153  8e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0963  methionyl-tRNA synthetase  23.42 
 
 		 551 aa  153  8e-36  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000994373 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5177  methionyl-tRNA synthetase  28.09 
 
 		 544 aa  153  8.999999999999999e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2197  methionyl-tRNA synthetase  25.61 
 
 		 573 aa  152  3e-35  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4903  methionyl-tRNA synthetase  26.28 
 
 		 544 aa  150  1.0000000000000001e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5278  methionyl-tRNA synthetase  26.28 
 
 		 544 aa  150  1.0000000000000001e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2825  methionyl-tRNA synthetase  24.49 
 
 		 690 aa  149  1.0000000000000001e-34  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.23951 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0615  methionyl-tRNA synthetase  24.91 
 
 		 565 aa  149  1.0000000000000001e-34  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5183  methionyl-tRNA synthetase  24.21 
 
 		 544 aa  149  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4747  methionyl-tRNA synthetase  26.28 
 
 		 544 aa  149  2.0000000000000003e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5192  methionyl-tRNA synthetase  27.36 
 
 		 544 aa  149  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01790  methionyl-tRNA synthetase  26.13 
 
 		 694 aa  149  2.0000000000000003e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0911016  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5147  methionyl-tRNA synthetase  26.28 
 
 		 544 aa  149  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0971  methionyl-tRNA synthetase  25.88 
 
 		 614 aa  147  5e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0325311 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0067  methionyl-tRNA synthetase  24.86 
 
 		 544 aa  147  7.0000000000000006e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0016  methionyl-tRNA synthetase  25.09 
 
 		 694 aa  146  1e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0136  methionyl-tRNA synthetase  24.72 
 
 		 582 aa  145  2e-33  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03104  methionyl-tRNA synthetase  30.61 
 
 		 496 aa  145  3e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.415534  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1818  methionyl-tRNA synthetase  30.04 
 
 		 496 aa  144  4e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1838  methionyl-tRNA synthetase  26.08 
 
 		 557 aa  144  6e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.894587  normal  0.204358 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0726  methionyl-tRNA synthetase  25.14 
 
 		 673 aa  142  1.9999999999999998e-32  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.295956  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2601  methionyl-tRNA synthetase  26.49 
 
 		 717 aa  142  1.9999999999999998e-32  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03320  methionyl-tRNA synthetase  26.78 
 
 		 600 aa  142  1.9999999999999998e-32  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0820  methionyl-tRNA synthetase  25.29 
 
 		 662 aa  142  1.9999999999999998e-32  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.816271 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1432  methionyl-tRNA synthetase  25 
 
 		 700 aa  142  3e-32  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.111821  normal  0.539533 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0543  methionyl-tRNA synthetase  28.65 
 
 		 710 aa  141  3e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19280  methionyl-tRNA synthetase  25.75 
 
 		 681 aa  141  3.9999999999999997e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4147  methionyl-tRNA synthetase  24.91 
 
 		 682 aa  141  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4507  methionyl-tRNA synthetase  24.95 
 
 		 683 aa  141  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000498816 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17560  methionyl-tRNA synthetase  23.89 
 
 		 599 aa  141  4.999999999999999e-32  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0814812  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3886  methionyl-tRNA synthetase  24.68 
 
 		 682 aa  140  7e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.444378 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1386  methionyl-tRNA synthetase  27.56 
 
 		 595 aa  139  1e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.693312  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0695  methionyl-tRNA synthetase  25.48 
 
 		 663 aa  138  3.0000000000000003e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.708898 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1405  methionyl-tRNA synthetase  25.5 
 
 		 678 aa  138  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.341077  normal  0.644842 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0850  methionyl-tRNA synthetase  26.05 
 
 		 595 aa  137  5e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.13207  normal  0.94417 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2721  methionyl-tRNA synthetase  26.95 
 
 		 680 aa  137  5e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>