89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A2414 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A2414  hypothetical protein  100 
 
 		 155 aa  310  3.9999999999999997e-84  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.478977  normal  0.947675 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2240  Cupin 2 conserved barrel domain-containing protein  31.25 
 
 		 124 aa  62  0.000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.130311  normal  0.0267337 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5098  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.55 
 
 		 124 aa  57.8  0.00000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5804  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.82 
 
 		 123 aa  57.4  0.00000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1603  cupin 2 domain-containing protein  32.58 
 
 		 123 aa  56.2  0.0000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4632  Cupin 2 conserved barrel domain protein  36.36 
 
 		 123 aa  50.4  0.000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0666075 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5427  homogentisate 12-dioxygenase  40 
 
 		 385 aa  49.3  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0911564  normal  0.337883 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1488  cupin 2 domain-containing protein  43.1 
 
 		 115 aa  49.7  0.00002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00804045  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1459  hypothetical protein  50 
 
 		 332 aa  48.9  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0434689  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0837  Cupin 2 conserved barrel domain protein  41.67 
 
 		 130 aa  48.1  0.00004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02595  homogentisate 1,2-dioxygenase  38.98 
 
 		 386 aa  48.1  0.00005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2265  cupin 2 domain-containing protein  37.5 
 
 		 172 aa  47.8  0.00005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.97009  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3623  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.33 
 
 		 122 aa  47.8  0.00006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1579  TonB box-like  32.99 
 
 		 151 aa  47.8  0.00006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0694121  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0728  homogentisate 1,2-dioxygenase  37.29 
 
 		 385 aa  47.4  0.00008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0193  Cupin 2 conserved barrel domain protein  40.98 
 
 		 126 aa  46.6  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.539282  normal  0.99492 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3280  homogentisate 12-dioxygenase  35 
 
 		 385 aa  46.6  0.0001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.524985 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1009  cupin family protein  32.56 
 
 		 119 aa  46.2  0.0002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3846  transcriptional regulator, AraC family  35.71 
 
 		 381 aa  46.2  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000533064  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1994  cupin 2 domain-containing protein  30.43 
 
 		 181 aa  45.8  0.0002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.663759  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07738  hypothetical protein  31.65 
 
 		 173 aa  45.8  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1882  auxin-binding protein, putative  36.71 
 
 		 167 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3716  cupin 2, barrel  33.85 
 
 		 129 aa  46.2  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.000701811  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5302  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.91 
 
 		 153 aa  45.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0206  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.69 
 
 		 115 aa  45.1  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2228  cupin 2 domain-containing protein  36.71 
 
 		 166 aa  45.4  0.0003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000300974 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8205  hypothetical protein  31.36 
 
 		 136 aa  45.4  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0784  cupin 2 domain-containing protein  39.66 
 
 		 129 aa  45.4  0.0003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0399886  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2249  cupin 2, barrel  24.35 
 
 		 143 aa  45.1  0.0004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1707  Cupin domain protein  32.76 
 
 		 178 aa  45.1  0.0004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3712  cupin region  34.88 
 
 		 172 aa  44.7  0.0005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.963003  normal  0.584711 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6321  homogentisate 12-dioxygenase  42.31 
 
 		 396 aa  44.7  0.0005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4136  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.09 
 
 		 127 aa  44.7  0.0005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1397  cupin 2 domain-containing protein  32.53 
 
 		 115 aa  44.3  0.0006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0319163  normal  0.27943 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2072  auxin-binding protein, putative  35.44 
 
 		 167 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0382674  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3661  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.69 
 
 		 218 aa  44.3  0.0007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4274  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.85 
 
 		 150 aa  43.9  0.0008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.680617 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1207  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.47 
 
 		 152 aa  43.5  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.830198  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1714  cupin 2 domain-containing protein  32.5 
 
 		 150 aa  43.5  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.259313 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1644  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.85 
 
 		 154 aa  43.1  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.522674  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3997  cupin 2 domain-containing protein  40 
 
 		 148 aa  43.1  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.439431  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0971  Cupin 2 conserved barrel domain protein  41.67 
 
 		 166 aa  43.5  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1386  cupin 2 domain-containing protein  33.71 
 
 		 116 aa  43.5  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1963  hypothetical protein  38.98 
 
 		 386 aa  42.4  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2053  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.62 
 
 		 118 aa  42.7  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2291  homogentisate 1,2-dioxygenase  38.1 
 
 		 386 aa  42.4  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000437513  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2363  homogentisate 1,2-dioxygenase  38.1 
 
 		 386 aa  42.4  0.002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.445339  normal  0.275941 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2481  homogentisate 1,2-dioxygenase  38.1 
 
 		 386 aa  42.4  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.59318  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2403  Cupin 2 conserved barrel domain protein  42.86 
 
 		 332 aa  42.4  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1532  cupin 2 domain-containing protein  34.48 
 
 		 115 aa  42.4  0.002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2150  cupin 2 domain-containing protein  28.79 
 
 		 124 aa  42.7  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0837605 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1907  transcriptional regulator, AraC family  38.89 
 
 		 279 aa  42  0.003  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00680023  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1654  cupin 2 domain-containing protein  22.73 
 
 		 361 aa  42  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0677  cupin 2 domain-containing protein  23.21 
 
 		 255 aa  42  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3638  cupin 2 domain-containing protein  33.77 
 
 		 152 aa  42  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.588869  normal  0.0557412 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1456  DNA-binding transcriptional regulator ChbR  38.89 
 
 		 279 aa  42  0.003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.276942 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2315  Cupin 2 conserved barrel domain protein  26.03 
 
 		 374 aa  42  0.003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5435  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.59 
 
 		 149 aa  42  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.657648 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1628  cupin 2, barrel  22.73 
 
 		 356 aa  42  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1897  DNA-binding transcriptional regulator ChbR  38.89 
 
 		 279 aa  41.6  0.004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.737431  normal  0.387468 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5971  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.53 
 
 		 130 aa  41.6  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01692  hypothetical protein  38.89 
 
 		 280 aa  42  0.004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3140  conserved hypothetical phosphomannose protein  33.33 
 
 		 137 aa  42  0.004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1608  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34 
 
 		 104 aa  41.6  0.004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00104789  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2453  DNA-binding transcriptional regulator ChbR  38.89 
 
 		 279 aa  41.6  0.004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01704  DNA-binding transcriptional dual regulator  38.89 
 
 		 280 aa  42  0.004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.906027  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0468  cupin 2 domain-containing protein  23.21 
 
 		 361 aa  41.6  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1601  cupin 2 domain-containing protein  23.21 
 
 		 361 aa  41.6  0.004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1956  DNA-binding transcriptional regulator ChbR  38.89 
 
 		 279 aa  41.6  0.004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1817  DNA-binding transcriptional regulator ChbR  38.89 
 
 		 279 aa  41.6  0.004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.208317  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0589  cupin 2 domain-containing protein  23.21 
 
 		 361 aa  41.6  0.004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2100  cupin region  40.38 
 
 		 119 aa  41.2  0.005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2945  cupin 2 domain-containing protein  32.5 
 
 		 171 aa  41.2  0.005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_25000  predicted protein  26.44 
 
 		 221 aa  41.2  0.006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.19447  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3113  cupin 2 domain-containing protein  37.5 
 
 		 174 aa  41.2  0.006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.487782  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1350  cupin 2 domain-containing protein  31.53 
 
 		 287 aa  40.8  0.006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.832765  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2154  homogentisate 1,2-dioxygenase  36.51 
 
 		 386 aa  41.2  0.006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.634063 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1429  DNA-binding transcriptional regulator ChbR  40.43 
 
 		 280 aa  40.8  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.670453  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1444  DNA-binding transcriptional regulator ChbR  40.43 
 
 		 280 aa  40.8  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1412  DNA-binding transcriptional regulator ChbR  40.43 
 
 		 280 aa  40.8  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.212987  normal  0.035912 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1856  DNA-binding transcriptional regulator ChbR  40.43 
 
 		 280 aa  40.8  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.348031  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2029  DNA-binding transcriptional regulator ChbR  40.43 
 
 		 280 aa  40.8  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2162  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.2 
 
 		 115 aa  40.8  0.007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000761945  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1315  cupin 2 domain-containing protein  31.52 
 
 		 163 aa  40.8  0.008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00314344  normal  0.472915 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2861  hypothetical protein  28.36 
 
 		 159 aa  40.4  0.008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1685  cupin 2 domain-containing protein  42.86 
 
 		 141 aa  40.4  0.009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1709  DNA-binding transcriptional regulator ChbR  32.56 
 
 		 272 aa  40.4  0.01  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0381  Cupin 2 conserved barrel domain protein  40 
 
 		 103 aa  40.4  0.01  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.754668  normal  0.233584 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2200  hypothetical protein  31.13 
 
 		 163 aa  40.4  0.01  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.192403 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>