More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_3846 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013216  Dtox_3846  transcriptional regulator, AraC family  100 
 
 		 381 aa  798    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000533064  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2883  transcriptional regulator, AraC family  43.1 
 
 		 321 aa  241  2e-62  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.00000839866  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1698  AraC family transcriptional regulator  28.78 
 
 		 686 aa  146  5e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000348751  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1432  AraC family transcriptional regulator  28.78 
 
 		 686 aa  146  5e-34  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00438113  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0522  hypothetical protein  49.18 
 
 		 91 aa  73.2  0.000000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1173  cupin 2 domain-containing protein  22.74 
 
 		 316 aa  72  0.00000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1528  AraC family transcriptional regulator  23.32 
 
 		 284 aa  72  0.00000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1886  transcriptional regulator, AraC family  24.62 
 
 		 289 aa  70.1  0.00000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1575  AraC family transcriptional regulator  23.11 
 
 		 339 aa  69.3  0.0000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1613  cupin 2 domain-containing protein  26.45 
 
 		 299 aa  66.6  0.0000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0246689  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1047  AraC family transcriptional regulator  24.22 
 
 		 285 aa  66.2  0.0000000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2638  transcriptional regulator, AraC family  23.87 
 
 		 282 aa  65.9  0.000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1596  transcriptional regulator, AraC family  24.72 
 
 		 287 aa  65.1  0.000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3159  AraC family transcriptional regulator  21.75 
 
 		 296 aa  65.1  0.000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0089  helix-turn-helix domain-containing protein  26.03 
 
 		 745 aa  65.5  0.000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0092  helix-turn-helix domain-containing protein  26.03 
 
 		 745 aa  65.5  0.000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2550  two component transcriptional regulator, AraC family  30.39 
 
 		 502 aa  64.7  0.000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3657  AraC family transcriptional regulator  40 
 
 		 430 aa  64.3  0.000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.316455  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1548  transcriptional regulator, AraC family  23.05 
 
 		 276 aa  63.9  0.000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1597  AraC family transcriptional regulator  20.73 
 
 		 310 aa  62.4  0.00000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0709  AraC family transcriptional regulator  24.82 
 
 		 292 aa  62  0.00000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0374  transcriptional regulator, AraC family  24.45 
 
 		 336 aa  62  0.00000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2253  two component AraC family transcriptional regulator  32.98 
 
 		 532 aa  62  0.00000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3156  AraC family transcriptional regulator  22.52 
 
 		 283 aa  61.6  0.00000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0086  filamentation induced by cAMP protein Fic  37.8 
 
 		 304 aa  61.6  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4591  two component transcriptional regulator, AraC family  35.42 
 
 		 265 aa  61.2  0.00000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4141  helix-turn-helix domain-containing protein  22.79 
 
 		 278 aa  61.2  0.00000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000207295  hitchhiker  0.0000292463 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4448  AraC family transcriptional regulator  34.94 
 
 		 283 aa  60.8  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.172214 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4032  transcriptional regulator, AraC family  34.94 
 
 		 283 aa  60.5  0.00000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1003  transcriptional regulator, AraC family  22.34 
 
 		 289 aa  60.8  0.00000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4522  AraC family transcriptional regulator  34.94 
 
 		 283 aa  60.8  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000425632 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4445  AraC family transcriptional regulator  34.94 
 
 		 278 aa  60.8  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00788504 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4358  transcriptional regulator, AraC family protein  34.94 
 
 		 278 aa  60.8  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0276  helix-turn-helix domain-containing protein  24.22 
 
 		 291 aa  60.8  0.00000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4327  transcriptional regulator, AraC family protein  34.94 
 
 		 278 aa  60.8  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4400  AraC family transcriptional regulator  34.94 
 
 		 283 aa  60.5  0.00000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.370971  normal  0.467233 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03839  predicted DNA-binding transcriptional regulator  34.94 
 
 		 283 aa  60.5  0.00000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4062  AraC family transcriptional regulator  34.94 
 
 		 283 aa  60.5  0.00000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03788  hypothetical protein  34.94 
 
 		 283 aa  60.5  0.00000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4188  AraC family transcriptional regulator  34.94 
 
 		 283 aa  60.5  0.00000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5413  transcriptional regulator, AraC family  34.94 
 
 		 283 aa  60.5  0.00000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4492  AraC family transcriptional regulator  34.94 
 
 		 283 aa  60.5  0.00000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.494011  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0853  two component transcriptional regulator, AraC family  33.71 
 
 		 509 aa  60.1  0.00000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1223  transcriptional regulator, AraC family  23.66 
 
 		 284 aa  60.1  0.00000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0726394  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1106  AraC family transcriptional regulator  23.4 
 
 		 309 aa  59.7  0.00000008  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0983  helix-turn-helix domain-containing protein  38.37 
 
 		 295 aa  59.7  0.00000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3588  AraC family transcriptional regulator  24.37 
 
 		 325 aa  59.7  0.00000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0511949  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4427  AraC family transcriptional regulator  24.37 
 
 		 325 aa  59.7  0.00000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3940  AraC family transcriptional regulator  24.37 
 
 		 325 aa  59.7  0.00000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2890  transcriptional regulator, AraC family  25.57 
 
 		 300 aa  59.3  0.0000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.178075  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1549  transcriptional regulator, AraC family  26.82 
 
 		 316 aa  58.9  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0143415  hitchhiker  0.00302933 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01433  transcriptional regulator  36.36 
 
 		 242 aa  59.3  0.0000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.738294  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5122  transcriptional regulator AraC family  27.68 
 
 		 314 aa  59.3  0.0000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.962416  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1280  two component transcriptional regulator, AraC family  36.14 
 
 		 492 aa  58.9  0.0000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0320  AraC family transcriptional regulator  22.35 
 
 		 281 aa  58.9  0.0000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.996721  hitchhiker  0.0000353353 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0464  AraC family transcriptional regulator  22.61 
 
 		 259 aa  59.3  0.0000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2158  two component transcriptional regulator, AraC family  35.51 
 
 		 493 aa  58.5  0.0000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0783  ATP-binding region ATPase domain protein  30.84 
 
 		 1374 aa  58.5  0.0000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3397  AraC family transcriptional regulator  22.43 
 
 		 298 aa  58.5  0.0000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000136095  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2718  two component transcriptional regulator, AraC family  32.94 
 
 		 259 aa  58.5  0.0000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1485  helix-turn-helix domain-containing protein  40.96 
 
 		 306 aa  58.2  0.0000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.232503  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0716  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 296 aa  58.2  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00193737 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3827  AraC family transcriptional regulator  38.96 
 
 		 235 aa  57.8  0.0000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5909  transcriptional regulator, AraC family  29.46 
 
 		 291 aa  58.2  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.678896 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2388  AraC family transcriptional regulator  25.1 
 
 		 278 aa  57.8  0.0000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.262251  unclonable  0.0000340178 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0197  AraC family transcriptional regulator  34.12 
 
 		 278 aa  57.8  0.0000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.160748  normal  0.0260258 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6879  transcriptional regulator, AraC family  29.46 
 
 		 291 aa  57.8  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0489024  normal  0.393248 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3940  AraC family transcriptional regulator  38.96 
 
 		 235 aa  57.8  0.0000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.423213  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5912  transcriptional regulator, AraC family  37.97 
 
 		 290 aa  57.8  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.264328  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0732  AraC-like transcriptional regulator  23.37 
 
 		 292 aa  58.2  0.0000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000598686  normal  0.0654387 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3914  AraC family transcriptional regulator  38.96 
 
 		 235 aa  57.8  0.0000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3415  AraC family transcriptional regulator  22.93 
 
 		 266 aa  57.8  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5388  transcriptional regulator, AraC family  36.96 
 
 		 298 aa  57.4  0.0000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.769805 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3480  transcriptional regulator, AraC family  32.04 
 
 		 114 aa  57.4  0.0000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.138328  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3204  AraC family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 317 aa  57.4  0.0000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0423  transcriptional regulator, AraC family  45.28 
 
 		 311 aa  57.4  0.0000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000736171  hitchhiker  0.000000152275 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6046  transcriptional regulator, AraC family  23.75 
 
 		 315 aa  57  0.0000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0485371 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2110  transcriptional regulator, AraC family  31.63 
 
 		 185 aa  57  0.0000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.695339  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3127  transcriptional regulator, AraC family  31.63 
 
 		 409 aa  57  0.0000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0091  transcriptional regulator, AraC family  40 
 
 		 240 aa  57.4  0.0000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.994797 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5309  helix-turn-helix domain-containing protein  23.33 
 
 		 296 aa  57  0.0000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.446177 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6068  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 287 aa  57  0.0000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0102  two component transcriptional regulator, AraC family  33.72 
 
 		 519 aa  56.6  0.0000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5694  AraC family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 319 aa  56.6  0.0000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.730665  normal  0.260224 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1153  ThiJ/PfpI domain-containing protein  35.96 
 
 		 338 aa  56.6  0.0000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.074608 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2461  AraC family transcriptional regulator  25 
 
 		 277 aa  56.6  0.0000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4005  hypothetical protein  48.98 
 
 		 67 aa  56.6  0.0000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2058  transcriptional regulator, AraC family  22.3 
 
 		 286 aa  56.2  0.0000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0342  AraC family transcriptional regulator  27.72 
 
 		 778 aa  56.6  0.0000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0234  transcription regulator protein  40 
 
 		 248 aa  56.2  0.0000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.942813 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1157  AraC family transcriptional regulator  31.15 
 
 		 248 aa  56.2  0.0000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1507  AraC family transcriptional regulator  28.85 
 
 		 370 aa  56.2  0.0000009  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3518  transcriptional regulator, AraC family  34.62 
 
 		 275 aa  56.2  0.0000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.630647 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0628  AraC family transcriptional regulator  34.34 
 
 		 319 aa  55.8  0.000001  Brucella suis 1330  Bacteria  decreased coverage  0.000338841  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6041  transcriptional regulator, AraC family  29.29 
 
 		 303 aa  55.8  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.331066 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2237  AraC family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 310 aa  56.2  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1388  AraC family transcriptional regulator  40 
 
 		 336 aa  55.8  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00534804  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1393  transcriptional regulator, AraC family  22.94 
 
 		 303 aa  55.5  0.000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1148  AraC family transcriptional regulator  23.79 
 
 		 323 aa  55.5  0.000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00767065  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4138  AraC family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 311 aa  55.8  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>