More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_1549 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_1549  transcriptional regulator, AraC family  100 
 
 		 316 aa  643    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0143415  hitchhiker  0.00302933 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0210  AraC family transcriptional regulator  49.53 
 
 		 274 aa  108  2e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.85611 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1537  transcriptional regulator, AraC family  49.04 
 
 		 282 aa  105  1e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.164062  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1111  transcriptional regulator, AraC family  47.12 
 
 		 312 aa  101  2e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5694  AraC family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 319 aa  100  3e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.730665  normal  0.260224 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4513  transcriptional regulator, AraC family  46.15 
 
 		 133 aa  95.1  1e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1524  transcriptional regulator, AraC family  43.86 
 
 		 301 aa  93.2  5e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.753144  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4632  AraC family transcriptional regulator  43.69 
 
 		 316 aa  92.8  7e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.569454  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4645  transcriptional regulator, AraC family  46 
 
 		 112 aa  92  1e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0412729 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0134  AraC family transcriptional regulator  41.44 
 
 		 322 aa  90.9  3e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6717  transcriptional regulator, AraC family  37.39 
 
 		 296 aa  90.5  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.121518  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3869  AraC family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 304 aa  90.1  4e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2139  helix-turn-helix domain-containing protein  39.05 
 
 		 294 aa  89.7  5e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.957349  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4732  helix-turn-helix domain-containing protein  45.92 
 
 		 293 aa  87.8  2e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0052536 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3971  putative transcriptional regulator  34.82 
 
 		 272 aa  87  4e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.347316  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0810  AraC family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 306 aa  85.9  9e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29260  putative transcriptional regulator  34.58 
 
 		 297 aa  85.9  9e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42360  transcriptional regulator, AraC family  35.29 
 
 		 318 aa  84.3  0.000000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3740  helix-turn-helix domain-containing protein  37.04 
 
 		 301 aa  83.6  0.000000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.436963  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3475  helix-turn-helix domain-containing protein  43.14 
 
 		 292 aa  83.6  0.000000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1472  AraC family transcriptional regulator  40.87 
 
 		 292 aa  83.6  0.000000000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.327977  normal  0.780269 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1148  transcriptional regulator, AraC family  36.11 
 
 		 309 aa  83.6  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7634  transcriptional regulator AraC family  32.45 
 
 		 304 aa  83.2  0.000000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.63081  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3417  AraC family transcriptional regulator  40.37 
 
 		 299 aa  82.8  0.000000000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.138414  normal  0.441033 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1365  AraC family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 353 aa  82.8  0.000000000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.122979  normal  0.036458 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1268  transcriptional regulator, AraC family  38.89 
 
 		 300 aa  82  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6041  transcriptional regulator, AraC family  39.39 
 
 		 303 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.331066 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3129  AraC family transcriptional regulator  36.19 
 
 		 299 aa  80.5  0.00000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3053  transcriptional regulator, AraC family  36.63 
 
 		 296 aa  79.7  0.00000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1477  transcriptional regulator, AraC family  37.39 
 
 		 278 aa  79.3  0.00000000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.000537918  unclonable  0.00000296813 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5332  AraC family transcriptional regulator  41.84 
 
 		 301 aa  78.6  0.0000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4739  proline utilization regulator  36.29 
 
 		 250 aa  78.6  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.284133  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2274  AraC family transcriptional regulator  40.4 
 
 		 307 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.348217  normal  0.470943 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2736  AraC family transcriptional regulator  34.26 
 
 		 154 aa  78.6  0.0000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.66637 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1650  AraC family transcriptional regulator  32.73 
 
 		 316 aa  79  0.0000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3086  transcriptional regulator, AraC family  35.64 
 
 		 296 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.164604  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1857  helix-turn-helix domain-containing protein  34.62 
 
 		 126 aa  77.4  0.0000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0222434 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4138  AraC family transcriptional regulator  40.22 
 
 		 311 aa  77  0.0000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3583  transcriptional regulator AraC family  35.85 
 
 		 293 aa  77  0.0000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1596  transcriptional regulator, AraC family  28.11 
 
 		 287 aa  76.6  0.0000000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3361  helix-turn-helix domain-containing protein  36.52 
 
 		 160 aa  76.6  0.0000000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6513  transcriptional regulator, AraC family  41.67 
 
 		 306 aa  76.3  0.0000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0536  AraC family transcriptional regulator  33.51 
 
 		 304 aa  76.3  0.0000000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0180  AraC family transcriptional regulator  32.73 
 
 		 223 aa  76.3  0.0000000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1840  AraC family transcriptional regulator  39.64 
 
 		 271 aa  75.9  0.0000000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000248404 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6285  transcriptional regulator, AraC family  40.37 
 
 		 287 aa  75.9  0.0000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.671161  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1225  AraC family transcriptional regulator  37.38 
 
 		 249 aa  75.9  0.0000000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.615855  normal  0.0441463 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2461  AraC family transcriptional regulator  36.63 
 
 		 277 aa  75.9  0.0000000000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3088  AraC family transcriptional regulator  32.79 
 
 		 296 aa  75.9  0.000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.530109  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2401  transcriptional regulator, AraC family  35.92 
 
 		 202 aa  75.5  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2193  transcriptional regulator, AraC family  35.64 
 
 		 296 aa  75.5  0.000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000412725 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1106  AraC family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 309 aa  74.3  0.000000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0125  transcriptional regulator, AraC family  35.71 
 
 		 300 aa  74.3  0.000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0583  AraC family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 312 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.98908  normal  0.54842 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2379  AraC family transcriptional regulator  30.36 
 
 		 304 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0538221  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54190  proline utilization regulator  36.21 
 
 		 250 aa  74.7  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3069  transcriptional regulator, AraC family  30.33 
 
 		 296 aa  73.9  0.000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1047  transcriptional regulator, AraC family  41.84 
 
 		 273 aa  73.6  0.000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.859066 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3170  transcriptional regulator, AraC family  35.35 
 
 		 332 aa  73.9  0.000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.777646  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1220  AraC family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 267 aa  73.6  0.000000000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.21436  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2634  AraC family transcriptional regulator  31 
 
 		 204 aa  73.6  0.000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2907  transcriptional regulator, AraC family  37.5 
 
 		 289 aa  73.2  0.000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0560618  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2469  AraC family transcriptional regulator  33.94 
 
 		 361 aa  73.6  0.000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0971  AraC family transcriptional regulator  34 
 
 		 136 aa  73.2  0.000000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000205729  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5475  transcriptional regulator, AraC family  36.89 
 
 		 305 aa  73.6  0.000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.59164  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2836  AraC family transcriptional regulator  33.01 
 
 		 296 aa  73.2  0.000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00254989  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1172  AraC family DNA-binding response regulator  25.69 
 
 		 250 aa  72.8  0.000000000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.409048  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1980  AraC family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 293 aa  72.8  0.000000000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.949603 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2496  helix-turn-helix domain-containing protein  37.41 
 
 		 308 aa  72.4  0.000000000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0383135  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7037  AraC family transcriptional regulator  34 
 
 		 301 aa  72  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.283867  normal  0.289972 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1036  AraC family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 300 aa  71.6  0.00000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.139629  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2843  AraC family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 296 aa  72.4  0.00000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.538425  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1013  AraC family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 300 aa  72  0.00000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.126228  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1014  AraC family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 300 aa  71.6  0.00000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.210728  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2776  AraC family transcriptional regulator  29.75 
 
 		 296 aa  72  0.00000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5912  AraC family transcriptional regulator  35.92 
 
 		 281 aa  72  0.00000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1271  transcriptional regulator, AraC family  33.04 
 
 		 300 aa  72  0.00000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.121916  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1114  AraC family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 300 aa  71.6  0.00000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3057  AraC family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 296 aa  72.4  0.00000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.118978  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1194  transcriptional regulator, AraC family  33.04 
 
 		 300 aa  72  0.00000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.926126 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0168  AraC/XylS family transcriptional regulator  32.74 
 
 		 287 aa  71.6  0.00000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000293268  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15370  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  38.82 
 
 		 415 aa  71.2  0.00000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2816  AraC family transcriptional regulator  32 
 
 		 296 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0540  transcriptional regulator, AraC family  35.29 
 
 		 289 aa  71.2  0.00000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.516999  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0853  transcriptional regulator, AraC family  28.97 
 
 		 284 aa  71.2  0.00000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1458  AraC family transcriptional regulator  34 
 
 		 301 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0091  AraC family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 278 aa  71.2  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6370  AraC family transcriptional regulator  34 
 
 		 301 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1216  AraC family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 300 aa  70.5  0.00000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1627  transcriptional regulator, AraC family  32 
 
 		 273 aa  70.5  0.00000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000116038  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1732  transcriptional regulator, AraC family  38.54 
 
 		 288 aa  70.9  0.00000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0803469 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6795  transcriptional regulator, AraC family  30.09 
 
 		 306 aa  70.9  0.00000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.312804  hitchhiker  0.00000309577 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9084  transcriptional regulator AraC family  36.89 
 
 		 315 aa  70.9  0.00000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4788  AraC family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 344 aa  70.5  0.00000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.139915  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6086  transcriptional regulator, AraC family  36.89 
 
 		 288 aa  70.5  0.00000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.993456 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1021  AraC family transcriptional regulator  33.09 
 
 		 300 aa  70.5  0.00000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1170  transcriptional regulator, AraC family  33.09 
 
 		 300 aa  70.5  0.00000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00906983  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4587  AraC family transcriptional regulator  38.14 
 
 		 291 aa  70.5  0.00000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.213128  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3482  AraC family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 299 aa  70.1  0.00000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.675068  normal  0.589184 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5122  transcriptional regulator AraC family  33.86 
 
 		 314 aa  70.1  0.00000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.962416  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>