More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_C6068 on replicon NC_007336
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007336  Reut_C6068  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 		 287 aa  584  1e-166  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3740  helix-turn-helix domain-containing protein  39.49 
 
 		 301 aa  103  3e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.436963  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1980  AraC family transcriptional regulator  44.86 
 
 		 293 aa  99  9e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.949603 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3129  AraC family transcriptional regulator  37.18 
 
 		 299 aa  99  9e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2413  transcriptional regulator, AraC family  50 
 
 		 322 aa  98.2  1e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.333457  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0798  AraC family transcriptional regulator  38.85 
 
 		 311 aa  97.4  2e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2736  AraC family transcriptional regulator  38.69 
 
 		 154 aa  97.4  3e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.66637 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0345  AraC family transcriptional regulator  38.85 
 
 		 311 aa  97.1  3e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0829  AraC family transcriptional regulator  38.85 
 
 		 311 aa  97.1  3e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0210284  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0085  transcriptional regulator, AraC family  35.48 
 
 		 296 aa  97.1  3e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0195711 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3921  AraC family transcriptional regulator  38.85 
 
 		 311 aa  96.3  5e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.892105 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5108  AraC family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 316 aa  95.9  8e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.310256  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6717  transcriptional regulator, AraC family  27.71 
 
 		 296 aa  95.1  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.121518  normal  1 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4172  AraC family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 295 aa  95.1  1e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0833223  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1650  AraC family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 316 aa  94  3e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3482  AraC family transcriptional regulator  41.27 
 
 		 299 aa  93.6  3e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.675068  normal  0.589184 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0536  AraC family transcriptional regulator  41.8 
 
 		 304 aa  93.6  4e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1041  helix-turn-helix, AraC type:Arac protein, arabinose-binding/dimerisation  40.54 
 
 		 291 aa  92.4  8e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.29946 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2507  transcriptional regulator, AraC family  41.73 
 
 		 291 aa  92  9e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6513  transcriptional regulator, AraC family  45.13 
 
 		 306 aa  92  1e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4605  AraC family transcriptional regulator  41.13 
 
 		 291 aa  90.9  2e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4223  transcriptional regulator, AraC family  41.67 
 
 		 299 aa  90.9  2e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0134  AraC family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 322 aa  91.3  2e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2274  AraC family transcriptional regulator  39.43 
 
 		 307 aa  90.9  2e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.348217  normal  0.470943 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4111  transcriptional regulator, AraC family  41.67 
 
 		 299 aa  90.9  2e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.596036  normal  0.240547 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2224  AraC family transcriptional regulator  34.93 
 
 		 278 aa  90.1  3e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000575993  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1207  putative transcriptional regulator  37.01 
 
 		 293 aa  90.5  3e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0859  AraC family transcriptional regulator  41.13 
 
 		 291 aa  90.1  3e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.775109  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4587  AraC family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 291 aa  90.1  4e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.213128  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13470  AraC family transcriptional regulator  37.01 
 
 		 293 aa  90.1  4e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0899227  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4464  helix-turn-helix domain-containing protein  41.13 
 
 		 291 aa  89.7  5e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2907  transcriptional regulator, AraC family  44.76 
 
 		 289 aa  89  7e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0560618  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2932  transcriptional regulator, AraC family  44.86 
 
 		 293 aa  89  8e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3244  AraC family transcriptional regulator  35.44 
 
 		 301 aa  88.6  1e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.432164 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4632  AraC family transcriptional regulator  33.8 
 
 		 316 aa  88.6  1e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.569454  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4258  AraC family transcriptional regulator  37.01 
 
 		 327 aa  88.6  1e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6955  transcriptional regulator, AraC family  39.53 
 
 		 346 aa  87.8  2e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.737934  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1213  transcriptional regulator, AraC family  36.72 
 
 		 291 aa  87.8  2e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2469  AraC family transcriptional regulator  38.69 
 
 		 361 aa  87.4  2e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1881  transcriptional regulator, AraC family  45.28 
 
 		 305 aa  87.4  2e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.831794  normal  0.0117859 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1365  AraC family transcriptional regulator  44.66 
 
 		 353 aa  88.2  2e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.122979  normal  0.036458 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2326  transcriptional regulator, AraC family  38.06 
 
 		 295 aa  87.8  2e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0937352 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2139  helix-turn-helix domain-containing protein  29.17 
 
 		 294 aa  87.4  3e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.957349  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4318  AraC family transcriptional regulator  34.81 
 
 		 305 aa  87  3e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00219342 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7634  transcriptional regulator AraC family  46.94 
 
 		 304 aa  87  3e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.63081  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5827  helix-turn-helix domain-containing protein  41.74 
 
 		 316 aa  87.4  3e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.112164  normal  0.283627 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6285  transcriptional regulator, AraC family  31.94 
 
 		 287 aa  86.7  4e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.671161  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0932  AraC family transcriptional regulator  37.3 
 
 		 291 aa  86.7  4e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1148  transcriptional regulator, AraC family  28.88 
 
 		 309 aa  86.7  4e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1576  transcriptional regulator, AraC family  47 
 
 		 436 aa  86.3  5e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6617  transcriptional regulator, AraC family  43.48 
 
 		 287 aa  86.3  5e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.131937 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1268  transcriptional regulator, AraC family  35.14 
 
 		 300 aa  86.3  5e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6041  transcriptional regulator, AraC family  43.69 
 
 		 303 aa  86.3  6e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.331066 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1047  AraC family transcriptional regulator  37.62 
 
 		 285 aa  86.3  6e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2046  AraC family transcriptional regulator  38.76 
 
 		 291 aa  85.9  7e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0173792  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2981  AraC family transcriptional regulator  34.81 
 
 		 305 aa  85.9  7e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5093  AraC family transcriptional regulator  34.81 
 
 		 301 aa  85.9  7e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.467029 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3583  transcriptional regulator AraC family  28.89 
 
 		 293 aa  85.5  8e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2701  AraC family transcriptional regulator  38.76 
 
 		 315 aa  85.5  9e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.137316  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0867  AraC family transcriptional regulator  38.76 
 
 		 315 aa  85.5  9e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000394258  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1909  AraC family transcriptional regulator  38.76 
 
 		 315 aa  85.5  9e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.190572  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0027  AraC family transcriptional regulator  31.85 
 
 		 299 aa  85.1  0.000000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.618912  normal  0.0626425 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1405  AraC family transcriptional regulator  38.76 
 
 		 251 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000697123  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3203  AraC family transcriptional regulator  38.76 
 
 		 315 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.10279  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1318  AraC family transcriptional regulator  31.54 
 
 		 294 aa  84.7  0.000000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.761239  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5000  AraC family transcriptional regulator  34.18 
 
 		 305 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0574  AraC family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 311 aa  85.1  0.000000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0798057  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1477  transcriptional regulator, AraC family  34.39 
 
 		 278 aa  85.5  0.000000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.000537918  unclonable  0.00000296813 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1524  transcriptional regulator, AraC family  38.1 
 
 		 301 aa  85.5  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.753144  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5860  AraC family transcriptional regulator  34.18 
 
 		 305 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.499461  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3238  AraC family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 290 aa  84.7  0.000000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.996927 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3164  AraC family transcriptional regulator  38.76 
 
 		 332 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0245945  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3417  AraC family transcriptional regulator  43.24 
 
 		 299 aa  84.3  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.138414  normal  0.441033 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1732  transcriptional regulator, AraC family  41.51 
 
 		 288 aa  84.3  0.000000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0803469 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2413  AraC family transcriptional regulator  35.25 
 
 		 305 aa  84.7  0.000000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0125  transcriptional regulator, AraC family  26.92 
 
 		 300 aa  84.3  0.000000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5215  helix-turn-helix domain-containing protein  30.57 
 
 		 331 aa  83.6  0.000000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3475  helix-turn-helix domain-containing protein  30.72 
 
 		 292 aa  84  0.000000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2201  transcriptional regulator, AraC family  45.36 
 
 		 335 aa  83.6  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1472  AraC family transcriptional regulator  41.75 
 
 		 292 aa  83.2  0.000000000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.327977  normal  0.780269 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2212  AraC family transcriptional regulator  27.32 
 
 		 302 aa  83.2  0.000000000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0208  ThiJ/PfpI domain-containing protein  44.86 
 
 		 318 aa  82.8  0.000000000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0903161  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2093  AraC family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 287 aa  83.2  0.000000000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.369123  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0152  transcriptional regulator, AraC family  44.86 
 
 		 318 aa  83.2  0.000000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.143566 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42360  transcriptional regulator, AraC family  39.62 
 
 		 318 aa  82.4  0.000000000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1543  transcriptional regulator, AraC family  32.92 
 
 		 300 aa  82.4  0.000000000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2555  AraC family transcriptional regulator  38.85 
 
 		 311 aa  82.4  0.000000000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3305  two component transcriptional regulator, AraC family  37 
 
 		 513 aa  81.6  0.00000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1754  transcriptional regulator, AraC family  33.78 
 
 		 308 aa  82  0.00000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0810  AraC family transcriptional regulator  31.64 
 
 		 306 aa  81.6  0.00000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0517  helix-turn-helix domain-containing protein  37.61 
 
 		 180 aa  81.6  0.00000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.970363 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2634  AraC family transcriptional regulator  31.07 
 
 		 204 aa  81.6  0.00000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0600  helix-turn-helix domain-containing protein  40.78 
 
 		 297 aa  81.3  0.00000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2337  AraC family transcriptional regulator  40.16 
 
 		 289 aa  81.3  0.00000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000580503  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0725  AraC family transcriptional regulator  41.86 
 
 		 311 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.576949 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1673  AraC family transcriptional regulator  40 
 
 		 314 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.310754 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0276  helix-turn-helix domain-containing protein  39 
 
 		 291 aa  81.3  0.00000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0708  AraC family transcriptional regulator  41.86 
 
 		 311 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5694  AraC family transcriptional regulator  31.85 
 
 		 319 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.730665  normal  0.260224 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1958  response regulator receiver protein  29.55 
 
 		 530 aa  80.5  0.00000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000471781  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>