More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_3480 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_3480  transcriptional regulator, AraC family  100 
 
 		 114 aa  240  3.9999999999999997e-63  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.138328  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2396  AraC family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 358 aa  92.8  2e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0547551  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2592  AraC family transcriptional regulator  42.16 
 
 		 364 aa  87.4  6e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00912873  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2406  AraC family transcriptional regulator  42.16 
 
 		 367 aa  87  8e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.280616  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2582  AraC family transcriptional regulator  42.16 
 
 		 364 aa  87  8e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.147074  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2360  AraC family transcriptional regulator  42 
 
 		 367 aa  86.3  1e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000000000555626  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2326  AraC family transcriptional regulator  42 
 
 		 367 aa  85.9  2e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2772  transcriptional regulator, AraC family  40 
 
 		 364 aa  84.7  4e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.320342  decreased coverage  0.000000000118835 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0739  transposon Tn10 TetD protein  28.3 
 
 		 113 aa  76.3  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.899902  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0634  transposon Tn10 TetD protein  28.57 
 
 		 113 aa  75.9  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0677  transposon Tn10 TetD protein  28.57 
 
 		 113 aa  75.9  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.198694  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0620  transposon Tn10 TetD protein  28.57 
 
 		 113 aa  75.9  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0693  transposon Tn10 TetD protein  28.57 
 
 		 113 aa  75.9  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.808673  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0971  AraC family transcriptional regulator  35.85 
 
 		 136 aa  74.3  0.0000000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000205729  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1078  AraC family transcriptional regulator  27.36 
 
 		 113 aa  74.3  0.0000000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.531138 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0092  helix-turn-helix domain-containing protein  33.65 
 
 		 745 aa  72.4  0.000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1216  AraC family transcriptional regulator  31.13 
 
 		 300 aa  72  0.000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1036  AraC family transcriptional regulator  31.13 
 
 		 300 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.139629  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1013  AraC family transcriptional regulator  31.13 
 
 		 300 aa  72.8  0.000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.126228  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1014  AraC family transcriptional regulator  31.13 
 
 		 300 aa  72  0.000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.210728  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1194  transcriptional regulator, AraC family  31.13 
 
 		 300 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.926126 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1271  transcriptional regulator, AraC family  31.13 
 
 		 300 aa  72.8  0.000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.121916  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1114  AraC family transcriptional regulator  31.13 
 
 		 300 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4171  transcriptional regulator, AraC family  31.13 
 
 		 300 aa  72.8  0.000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0089  helix-turn-helix domain-containing protein  33.65 
 
 		 745 aa  72.4  0.000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1021  AraC family transcriptional regulator  30.19 
 
 		 300 aa  71.6  0.000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1958  response regulator receiver protein  35.35 
 
 		 530 aa  72  0.000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000471781  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1170  transcriptional regulator, AraC family  30.19 
 
 		 300 aa  71.6  0.000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00906983  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0774  AraC family transcriptional regulator  35.05 
 
 		 278 aa  68.9  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000960474 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0102  two component transcriptional regulator, AraC family  32.38 
 
 		 519 aa  68.6  0.00000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3482  AraC family transcriptional regulator  33 
 
 		 140 aa  69.3  0.00000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.119803  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1683  AraC family transcriptional regulator  28.18 
 
 		 221 aa  67  0.00000000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1997  DNA-binding transcriptional activator MarA  31.37 
 
 		 127 aa  66.6  0.0000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0707519 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01490  DNA-binding transcriptional dual activator of multiple antibiotic resistance  30.3 
 
 		 127 aa  65.5  0.0000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0187741  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2115  transcriptional regulator, AraC family  30.3 
 
 		 127 aa  65.5  0.0000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000178307  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1733  DNA-binding transcriptional activator MarA  30.3 
 
 		 127 aa  65.5  0.0000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1632  DNA-binding transcriptional activator MarA  30.3 
 
 		 127 aa  65.5  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.599726  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1691  DNA-binding transcriptional activator MarA  30.3 
 
 		 127 aa  65.5  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01501  hypothetical protein  30.3 
 
 		 127 aa  65.5  0.0000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0218777  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2127  DNA-binding transcriptional activator MarA  30.3 
 
 		 127 aa  65.5  0.0000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.299134  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1051  transcriptional regulator, AraC family  31.53 
 
 		 276 aa  65.5  0.0000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1624  DNA-binding transcriptional activator MarA  30.3 
 
 		 127 aa  65.5  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.936948  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1651  DNA-binding transcriptional activator MarA  30.3 
 
 		 127 aa  65.5  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00571718  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1674  DNA-binding transcriptional activator MarA  30.3 
 
 		 127 aa  65.5  0.0000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12670  DNA-binding domain-containing protein, AraC-type  33 
 
 		 250 aa  66.2  0.0000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1816  DNA-binding transcriptional activator MarA  30.3 
 
 		 127 aa  65.5  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2145  DNA-binding transcriptional activator MarA  30.3 
 
 		 127 aa  65.5  0.0000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.883582  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1639  DNA-binding transcriptional activator MarA  30.3 
 
 		 127 aa  65.5  0.0000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3305  two component transcriptional regulator, AraC family  34.41 
 
 		 513 aa  65.1  0.0000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3174  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 280 aa  65.1  0.0000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.626893  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3156  two component transcriptional regulator, AraC family  36.14 
 
 		 515 aa  64.7  0.0000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.949308  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001047  transcriptional regulator AraC family  34 
 
 		 299 aa  64.3  0.0000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2466  transcriptional regulator, AraC family  30.69 
 
 		 313 aa  64.3  0.0000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0526  transcriptional regulator, AraC family  32.26 
 
 		 129 aa  64.3  0.0000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000198595  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0211  transcriptional regulator, AraC family  29.7 
 
 		 299 aa  63.2  0.000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0192  AraC family transcriptional regulator  29.7 
 
 		 299 aa  63.2  0.000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0179  AraC family transcriptional regulator  29.7 
 
 		 299 aa  63.2  0.000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0147136  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3702  transcriptional regulator, AraC type  34.41 
 
 		 308 aa  62.8  0.000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0191  AraC family transcriptional regulator  29.7 
 
 		 299 aa  63.2  0.000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2755  transcriptional regulator, AraC family  29.59 
 
 		 300 aa  63.5  0.000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1548  transcriptional regulator, AraC family  32.99 
 
 		 276 aa  62.8  0.000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0216  transcriptional regulator, AraC family  28.71 
 
 		 299 aa  63.2  0.000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3627  DNA gyrase inhibitor  33.33 
 
 		 300 aa  62  0.000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000240584  hitchhiker  0.00747313 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2797  transcription activator effector binding  36 
 
 		 279 aa  62.4  0.000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.338998 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0182  AraC family transcriptional regulator  29.7 
 
 		 299 aa  62  0.000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3983  transcriptional regulator, AraC family  28.57 
 
 		 291 aa  61.6  0.000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2113  two component AraC family transcriptional regulator  35.35 
 
 		 548 aa  61.6  0.000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2833  AraC family transcriptional regulator  29.25 
 
 		 128 aa  61.6  0.000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.360969  hitchhiker  0.00326998 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0011  transcriptional regulator, AraC family  29.81 
 
 		 285 aa  61.2  0.000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000871788  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1583  two component AraC family transcriptional regulator  29.13 
 
 		 533 aa  60.8  0.000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.160886  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0176  AraC family transcriptional regulator  29.7 
 
 		 299 aa  60.8  0.000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4957  transcriptional regulator, AraC family  33.02 
 
 		 290 aa  60.8  0.000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2238  AraC family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 297 aa  60.5  0.000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000454466 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2387  AraC family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 128 aa  60.5  0.000000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000368739  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3363  transcriptional regulator, AraC family  33.65 
 
 		 308 aa  60.5  0.000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.202497  normal  0.403341 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2484  AraC family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 128 aa  60.5  0.000000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.151206  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0618  two component AraC family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 258 aa  60.1  0.000000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000605397  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0464  AraC family transcriptional regulator  26 
 
 		 259 aa  60.5  0.000000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5151  AraC family transcriptional regulator  31 
 
 		 316 aa  59.7  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.479428  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6761  AraC family transcriptional regulator  32.69 
 
 		 310 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.844239 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1217  transcription activator, effector binding  28.83 
 
 		 288 aa  59.7  0.00000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4584  transcriptional activator FtrA  29.7 
 
 		 323 aa  60.1  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.113469  normal  0.315018 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2642  transcriptional regulator, AraC family  34.69 
 
 		 198 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000194016 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2550  two component transcriptional regulator, AraC family  29.81 
 
 		 502 aa  59.3  0.00000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3503  transcription activator, effector binding  30 
 
 		 294 aa  58.9  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00111619  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1280  two component transcriptional regulator, AraC family  32.71 
 
 		 492 aa  59.3  0.00000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2462  AraC family transcriptional regulator  25.49 
 
 		 267 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.177963  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2212  AraC family transcriptional regulator  26.47 
 
 		 302 aa  58.9  0.00000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0125  transcriptional regulator, AraC family  27.36 
 
 		 300 aa  59.3  0.00000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0165  AraC family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 298 aa  58.5  0.00000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1106  AraC family transcriptional regulator  26.73 
 
 		 309 aa  58.9  0.00000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0019  transcriptional regulator, AraC family  35.11 
 
 		 314 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2914  methylphosphotriester-DNA alkyltransferase  34.69 
 
 		 198 aa  58.5  0.00000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.431589  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0027  AraC family transcriptional regulator  30 
 
 		 299 aa  58.5  0.00000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.618912  normal  0.0626425 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3221  transcriptional regulator, AraC family  34.69 
 
 		 198 aa  58.5  0.00000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3953  AraC family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 287 aa  58.5  0.00000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0509927  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1919  AraC family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 329 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.480868  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3782  AraC family transcriptional regulator  31.52 
 
 		 319 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0502919 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2727  AraC family transcription regulator  32.69 
 
 		 336 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0371  AraC family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 288 aa  58.5  0.00000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>