More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECD_01490 on replicon CP001509
Organism: Escherichia coli BL21(DE3)



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_01490  DNA-binding transcriptional dual activator of multiple antibiotic resistance  100 
 
 		 127 aa  266  8e-71  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0187741  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2115  transcriptional regulator, AraC family  100 
 
 		 127 aa  266  8e-71  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000178307  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2127  DNA-binding transcriptional activator MarA  100 
 
 		 127 aa  266  8e-71  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.299134  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01501  hypothetical protein  100 
 
 		 127 aa  266  8e-71  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0218777  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2145  DNA-binding transcriptional activator MarA  100 
 
 		 127 aa  266  8e-71  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.883582  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1639  DNA-binding transcriptional activator MarA  100 
 
 		 127 aa  266  8e-71  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1674  DNA-binding transcriptional activator MarA  100 
 
 		 127 aa  266  8e-71  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1733  DNA-binding transcriptional activator MarA  100 
 
 		 127 aa  266  8e-71  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1691  DNA-binding transcriptional activator MarA  95.24 
 
 		 127 aa  251  3e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1816  DNA-binding transcriptional activator MarA  95.24 
 
 		 127 aa  251  3e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1651  DNA-binding transcriptional activator MarA  95.24 
 
 		 127 aa  251  3e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00571718  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1624  DNA-binding transcriptional activator MarA  95.24 
 
 		 127 aa  251  3e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.936948  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1632  DNA-binding transcriptional activator MarA  95.24 
 
 		 127 aa  251  3e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.599726  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1997  DNA-binding transcriptional activator MarA  92.74 
 
 		 127 aa  240  3.9999999999999997e-63  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0707519 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1523  AraC family transcriptional regulator  52 
 
 		 152 aa  117  6e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00364512  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1078  AraC family transcriptional regulator  50 
 
 		 113 aa  117  7.999999999999999e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.531138 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2466  transcriptional regulator, AraC family  55.1 
 
 		 313 aa  115  9.999999999999999e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2755  transcriptional regulator, AraC family  52.38 
 
 		 300 aa  115  1.9999999999999998e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3673  transcriptional regulator, AraC family  50 
 
 		 295 aa  114  3.9999999999999997e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0568  transcriptional regulator, AraC family  51.49 
 
 		 293 aa  114  3.9999999999999997e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.117041  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0529  transcriptional regulator, AraC family  50 
 
 		 288 aa  114  5e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0557  AraC family transcriptional regulator  50.5 
 
 		 289 aa  113  1.0000000000000001e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4944  right origin-binding protein  50.5 
 
 		 289 aa  111  4.0000000000000004e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4837  right origin-binding protein  50.5 
 
 		 289 aa  111  4.0000000000000004e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4996  right origin-binding protein  50.5 
 
 		 289 aa  111  4.0000000000000004e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3867  transcriptional regulator, AraC family  49.04 
 
 		 295 aa  111  4.0000000000000004e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.0000535009  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4910  right origin-binding protein  50.5 
 
 		 289 aa  111  4.0000000000000004e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4998  right origin-binding protein  50.5 
 
 		 289 aa  111  4.0000000000000004e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0739  transposon Tn10 TetD protein  44.23 
 
 		 113 aa  111  4.0000000000000004e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.899902  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04272  DNA-binding transcriptional activator  50.5 
 
 		 289 aa  110  5e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3601  transcriptional regulator, AraC family  50.5 
 
 		 289 aa  110  5e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3660  AraC family transcriptional regulator  50.5 
 
 		 289 aa  110  5e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4946  right origin-binding protein  50.5 
 
 		 289 aa  110  5e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.96055 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4943  right origin-binding protein  50.5 
 
 		 289 aa  110  5e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4994  right origin-binding protein  50.5 
 
 		 289 aa  110  5e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4632  right origin-binding protein  50.5 
 
 		 289 aa  110  5e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04237  hypothetical protein  50.5 
 
 		 289 aa  110  5e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5910  right origin-binding protein  50.5 
 
 		 289 aa  110  5e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1890  AraC family transcriptional regulator  49.04 
 
 		 120 aa  110  5e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.520011  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0620  transposon Tn10 TetD protein  44.55 
 
 		 113 aa  110  9e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0677  transposon Tn10 TetD protein  44.55 
 
 		 113 aa  110  9e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.198694  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1931  AraC family transcriptional regulator  46.6 
 
 		 118 aa  110  1.0000000000000001e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0129269  hitchhiker  0.0018191 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0679  AraC family transcriptional regulator  49.5 
 
 		 289 aa  109  1.0000000000000001e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0014238  normal  0.551474 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3609  AraC family transcriptional regulator  48.51 
 
 		 288 aa  108  2.0000000000000002e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3481  right origin-binding protein  48.51 
 
 		 288 aa  108  2.0000000000000002e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0814  right origin-binding protein  48.51 
 
 		 288 aa  108  2.0000000000000002e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0693  transposon Tn10 TetD protein  44.55 
 
 		 113 aa  108  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.808673  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0634  transposon Tn10 TetD protein  44.55 
 
 		 113 aa  108  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0597  AraC family transcriptional regulator  49.49 
 
 		 292 aa  105  2e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4021  AraC family transcriptional regulator  46.9 
 
 		 288 aa  104  4e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.185045  normal  0.0217611 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2238  AraC family transcriptional regulator  45.19 
 
 		 297 aa  99.8  1e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000454466 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0266  DNA-binding transcriptional regulator SoxS  41.84 
 
 		 108 aa  99  2e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4524  DNA-binding transcriptional regulator SoxS  41.84 
 
 		 107 aa  98.2  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4516  DNA-binding transcriptional regulator SoxS  41.84 
 
 		 107 aa  98.2  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4609  DNA-binding transcriptional regulator SoxS  41.84 
 
 		 107 aa  98.2  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.917171  normal  0.375209 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4660  DNA-binding transcriptional regulator SoxS  41.84 
 
 		 107 aa  98.2  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4610  DNA-binding transcriptional regulator SoxS  41.84 
 
 		 107 aa  98.2  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0547666  normal  0.902957 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3482  AraC family transcriptional regulator  40.35 
 
 		 140 aa  98.6  3e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.119803  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03934  DNA-binding transcriptional dual regulator  41.84 
 
 		 107 aa  96.7  1e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0326041  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3930  transcriptional regulator, AraC family  41.84 
 
 		 107 aa  96.7  1e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5565  DNA-binding transcriptional regulator SoxS  41.84 
 
 		 107 aa  96.7  1e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.601347  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4524  DNA-binding transcriptional regulator SoxS  41.84 
 
 		 107 aa  96.7  1e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4580  DNA-binding transcriptional regulator SoxS  41.84 
 
 		 107 aa  96.7  1e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4615  DNA-binding transcriptional regulator SoxS  41.84 
 
 		 107 aa  96.7  1e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3965  DNA-binding transcriptional regulator SoxS  41.84 
 
 		 107 aa  96.7  1e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.105984 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4304  DNA-binding transcriptional regulator SoxS  41.84 
 
 		 107 aa  96.7  1e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03894  hypothetical protein  41.84 
 
 		 107 aa  96.7  1e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0334168  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2009  AraC family transcriptional regulator  49.45 
 
 		 297 aa  94  7e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.532444  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1897  AraC family transcriptional regulator  49.45 
 
 		 297 aa  94  7e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0436968  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0971  AraC family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 136 aa  90.5  7e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000205729  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2833  AraC family transcriptional regulator  41.3 
 
 		 128 aa  87.8  5e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.360969  hitchhiker  0.00326998 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003322  hypothetical protein  40.82 
 
 		 310 aa  86.3  1e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.757084  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06300  methylphosphotriester-DNA alkyltransferase  39.05 
 
 		 302 aa  84.7  4e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2484  AraC family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 128 aa  84  7e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.151206  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2387  AraC family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 128 aa  84  7e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000368739  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0192  AraC family transcriptional regulator  38.78 
 
 		 299 aa  83.2  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0179  AraC family transcriptional regulator  38.78 
 
 		 299 aa  83.2  0.000000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0147136  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0216  transcriptional regulator, AraC family  38.78 
 
 		 299 aa  82.8  0.000000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0191  AraC family transcriptional regulator  38.78 
 
 		 299 aa  83.2  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0211  transcriptional regulator, AraC family  38.78 
 
 		 299 aa  83.2  0.000000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0526  transcriptional regulator, AraC family  36.73 
 
 		 129 aa  82.8  0.000000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000198595  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0182  AraC family transcriptional regulator  38.78 
 
 		 299 aa  82  0.000000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1794  putative regulatory protein  41.9 
 
 		 283 aa  81.3  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.227844  normal  0.117823 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1480  putative regulatory protein  41.9 
 
 		 283 aa  81.3  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1796  putative regulatory protein  41.9 
 
 		 283 aa  81.3  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.131481  normal  0.259376 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1661  putative regulatory protein  41.9 
 
 		 283 aa  81.6  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0701683 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0332  AraC family transcriptional regulator  37.76 
 
 		 285 aa  80.5  0.000000000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0176  AraC family transcriptional regulator  37.76 
 
 		 299 aa  80.5  0.000000000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3303  transcriptional regulator, AraC family  36.73 
 
 		 228 aa  79.7  0.00000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.401511  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00261  hypothetical protein  36.73 
 
 		 219 aa  79.7  0.00000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0268  putative HTH-type transcriptional regulator YkgA  36.36 
 
 		 163 aa  79.7  0.00000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0910  HTH-type transcription regulator, AraC-family  37.76 
 
 		 298 aa  80.1  0.00000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.576456  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00257  predicted DNA-binding transcriptional regulator  36.73 
 
 		 283 aa  79.3  0.00000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0313  AraC family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 285 aa  79.3  0.00000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3321  AraC family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 283 aa  79.3  0.00000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0352  AraC family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 285 aa  79.3  0.00000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.203769  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3983  transcriptional regulator, AraC family  35.29 
 
 		 291 aa  77.8  0.00000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009788  EcE24377A_D0027  AraC family transcriptional regulator  39 
 
 		 286 aa  77.4  0.00000000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1472  AraC family transcriptional regulator  36.89 
 
 		 294 aa  76.3  0.0000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.102681  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0009  helix-turn-helix domain-containing protein  35.24 
 
 		 306 aa  76.6  0.0000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000070115 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>