More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BCE_2592 on replicon NC_003909
Organism: Bacillus cereus ATCC 10987



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003909  BCE_2592  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 
364 aa  748    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00912873  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2772  transcriptional regulator, AraC family  92.03 
 
 
364 aa  694    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.320342  decreased coverage  0.000000000118835 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2406  AraC family transcriptional regulator  92.58 
 
 
367 aa  694    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.280616  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2360  AraC family transcriptional regulator  91.21 
 
 
367 aa  687    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000000000555626  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2326  AraC family transcriptional regulator  90.11 
 
 
367 aa  681    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2582  AraC family transcriptional regulator  92.58 
 
 
364 aa  693    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.147074  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2396  AraC family transcriptional regulator  77.37 
 
 
358 aa  572  1.0000000000000001e-162  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0547551  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2637  transcriptional regulator, AraC family  92.56 
 
 
242 aa  459  9.999999999999999e-129  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0171843  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2553  transcriptional regulator, AraC family  91.38 
 
 
242 aa  439  9.999999999999999e-123  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2595  transcriptional regulator, AraC family  87.6 
 
 
242 aa  436  1e-121  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.65223e-17 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3480  transcriptional regulator, AraC family  42.16 
 
 
114 aa  87.4  4e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.138328  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0165  AraC family transcriptional regulator  35.71 
 
 
298 aa  78.6  0.0000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0526  transcriptional regulator, AraC family  41.49 
 
 
129 aa  76.3  0.0000000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000198595  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4021  AraC family transcriptional regulator  33.6 
 
 
288 aa  73.6  0.000000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.185045  normal  0.0217611 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0971  AraC family transcriptional regulator  35.45 
 
 
136 aa  72.4  0.00000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000205729  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0557  AraC family transcriptional regulator  38 
 
 
289 aa  72  0.00000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1523  AraC family transcriptional regulator  33.06 
 
 
152 aa  71.6  0.00000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00364512  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2107  AraC family transcriptional regulator  30.77 
 
 
313 aa  71.6  0.00000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.342925  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1997  DNA-binding transcriptional activator MarA  35.85 
 
 
127 aa  71.2  0.00000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0707519 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04272  DNA-binding transcriptional activator  38 
 
 
289 aa  70.5  0.00000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3601  transcriptional regulator, AraC family  38 
 
 
289 aa  70.5  0.00000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4994  right origin-binding protein  38 
 
 
289 aa  70.5  0.00000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0568  transcriptional regulator, AraC family  33.87 
 
 
293 aa  70.5  0.00000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.117041  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04237  hypothetical protein  38 
 
 
289 aa  70.5  0.00000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5910  right origin-binding protein  38 
 
 
289 aa  70.5  0.00000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4943  right origin-binding protein  38 
 
 
289 aa  70.5  0.00000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4946  right origin-binding protein  38 
 
 
289 aa  70.5  0.00000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.96055 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4632  right origin-binding protein  38 
 
 
289 aa  70.5  0.00000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6275  AraC family transcriptional regulator  34.29 
 
 
279 aa  70.5  0.00000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3660  AraC family transcriptional regulator  38 
 
 
289 aa  70.5  0.00000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4837  right origin-binding protein  38 
 
 
289 aa  70.1  0.00000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0620  transposon Tn10 TetD protein  32.67 
 
 
113 aa  70.5  0.00000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4910  right origin-binding protein  38 
 
 
289 aa  70.1  0.00000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4944  right origin-binding protein  38 
 
 
289 aa  70.1  0.00000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0677  transposon Tn10 TetD protein  32.67 
 
 
113 aa  70.5  0.00000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.198694  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4996  right origin-binding protein  38 
 
 
289 aa  70.1  0.00000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4998  right origin-binding protein  38 
 
 
289 aa  70.1  0.00000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3673  transcriptional regulator, AraC family  37 
 
 
295 aa  70.1  0.00000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0529  transcriptional regulator, AraC family  36.73 
 
 
288 aa  69.7  0.00000000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0739  transposon Tn10 TetD protein  32.65 
 
 
113 aa  69.7  0.00000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.899902  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1691  DNA-binding transcriptional activator MarA  34.51 
 
 
127 aa  68.9  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0693  transposon Tn10 TetD protein  32.67 
 
 
113 aa  68.6  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.808673  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0634  transposon Tn10 TetD protein  32.67 
 
 
113 aa  68.6  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0679  AraC family transcriptional regulator  28.39 
 
 
289 aa  68.6  0.0000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0014238  normal  0.551474 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1651  DNA-binding transcriptional activator MarA  34.51 
 
 
127 aa  68.9  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00571718  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1624  DNA-binding transcriptional activator MarA  34.51 
 
 
127 aa  68.9  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.936948  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1632  DNA-binding transcriptional activator MarA  34.51 
 
 
127 aa  68.9  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.599726  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1816  DNA-binding transcriptional activator MarA  34.51 
 
 
127 aa  68.9  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0011  transcriptional regulator, AraC family  32 
 
 
285 aa  68.2  0.0000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000871788  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4566  AraC family transcriptional regulator  32.28 
 
 
290 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.017881  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3867  transcriptional regulator, AraC family  36.73 
 
 
295 aa  68.6  0.0000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.0000535009  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1683  AraC family transcriptional regulator  34.55 
 
 
221 aa  68.6  0.0000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4724  AraC family transcriptional regulator  32.28 
 
 
290 aa  67.8  0.0000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.440387  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5086  AraC family transcriptional regulator  32.28 
 
 
290 aa  67.8  0.0000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1931  AraC family transcriptional regulator  29.41 
 
 
118 aa  67.8  0.0000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0129269  hitchhiker  0.0018191 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0371  AraC family transcriptional regulator  27.69 
 
 
288 aa  67.8  0.0000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0266  DNA-binding transcriptional regulator SoxS  33.67 
 
 
108 aa  67.8  0.0000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1078  AraC family transcriptional regulator  32.65 
 
 
113 aa  67.8  0.0000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.531138 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003322  hypothetical protein  35.71 
 
 
310 aa  67.4  0.0000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.757084  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4609  DNA-binding transcriptional regulator SoxS  34.69 
 
 
107 aa  67.4  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.917171  normal  0.375209 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4610  DNA-binding transcriptional regulator SoxS  34.69 
 
 
107 aa  67.4  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0547666  normal  0.902957 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4660  DNA-binding transcriptional regulator SoxS  34.69 
 
 
107 aa  67.4  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3609  AraC family transcriptional regulator  35.71 
 
 
288 aa  67.4  0.0000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0814  right origin-binding protein  35.71 
 
 
288 aa  67.4  0.0000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4524  DNA-binding transcriptional regulator SoxS  34.69 
 
 
107 aa  67.4  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3481  right origin-binding protein  35.71 
 
 
288 aa  67.4  0.0000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3417  transcriptional regulator, AraC family  42.55 
 
 
279 aa  67.4  0.0000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.27768  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4516  DNA-binding transcriptional regulator SoxS  34.69 
 
 
107 aa  67.4  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01490  DNA-binding transcriptional dual activator of multiple antibiotic resistance  33.96 
 
 
127 aa  67  0.0000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0187741  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2115  transcriptional regulator, AraC family  33.96 
 
 
127 aa  67  0.0000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000178307  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2145  DNA-binding transcriptional activator MarA  33.96 
 
 
127 aa  67  0.0000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.883582  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2127  DNA-binding transcriptional activator MarA  33.96 
 
 
127 aa  67  0.0000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.299134  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1733  DNA-binding transcriptional activator MarA  33.96 
 
 
127 aa  67  0.0000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1639  DNA-binding transcriptional activator MarA  33.96 
 
 
127 aa  67  0.0000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01501  hypothetical protein  33.96 
 
 
127 aa  67  0.0000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0218777  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4947  transcriptional regulator, AraC family  31.93 
 
 
290 aa  67  0.0000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0261  AraC family transcriptional regulator  33.66 
 
 
281 aa  67  0.0000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1674  DNA-binding transcriptional activator MarA  33.96 
 
 
127 aa  67  0.0000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3425  transcription activator, effector binding  31.78 
 
 
288 aa  66.6  0.0000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2797  transcription activator effector binding  34.85 
 
 
279 aa  67  0.0000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.338998 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3431  transcription activator, effector binding  31.78 
 
 
288 aa  66.6  0.0000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1472  AraC family transcriptional regulator  35.71 
 
 
294 aa  66.6  0.0000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.102681  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3715  transcriptional regulator, AraC family  42.22 
 
 
279 aa  66.2  0.0000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.424878 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4053  AraC family transcriptional regulator  27.32 
 
 
277 aa  66.2  0.0000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03934  DNA-binding transcriptional dual regulator  34.69 
 
 
107 aa  66.2  0.0000000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0326041  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3930  transcriptional regulator, AraC family  34.69 
 
 
107 aa  66.2  0.0000000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03894  hypothetical protein  34.69 
 
 
107 aa  66.2  0.0000000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0334168  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3356  transcription activator, effector binding  32.56 
 
 
288 aa  66.2  0.0000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5565  DNA-binding transcriptional regulator SoxS  34.69 
 
 
107 aa  66.2  0.0000000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.601347  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3965  DNA-binding transcriptional regulator SoxS  34.69 
 
 
107 aa  66.2  0.0000000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.105984 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4304  DNA-binding transcriptional regulator SoxS  34.69 
 
 
107 aa  66.2  0.0000000009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4524  DNA-binding transcriptional regulator SoxS  34.69 
 
 
107 aa  66.2  0.0000000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4615  DNA-binding transcriptional regulator SoxS  34.69 
 
 
107 aa  66.2  0.0000000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4580  DNA-binding transcriptional regulator SoxS  34.69 
 
 
107 aa  66.2  0.0000000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4957  transcriptional regulator, AraC family  33.33 
 
 
290 aa  65.9  0.000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4973  transcriptional regulator, AraC family  30.4 
 
 
290 aa  65.9  0.000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1798  transcriptional regulator, AraC family  32.35 
 
 
200 aa  65.9  0.000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2238  AraC family transcriptional regulator  34.69 
 
 
297 aa  65.5  0.000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000454466 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3482  AraC family transcriptional regulator  33.66 
 
 
140 aa  65.1  0.000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.119803  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1271  transcriptional regulator, AraC family  30.7 
 
 
300 aa  64.7  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.121916  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>