More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeAg_B3356 on replicon NC_011149
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011149  SeAg_B3356  transcription activator, effector binding  100 
 
 		 288 aa  595  1e-169  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3431  transcription activator, effector binding  98.96 
 
 		 288 aa  591  1e-168  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3425  transcription activator, effector binding  98.61 
 
 		 288 aa  589  1e-167  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3526  transcription activator, effector binding  97.92 
 
 		 288 aa  579  1e-164  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1474  transcriptional regulator, AraC family  56.89 
 
 		 286 aa  346  3e-94  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1217  transcription activator, effector binding  55.17 
 
 		 288 aa  339  2.9999999999999998e-92  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0371  AraC family transcriptional regulator  50.69 
 
 		 288 aa  327  1.0000000000000001e-88  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4046  AraC family transcriptional regulator  54.77 
 
 		 289 aa  320  1.9999999999999998e-86  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0076  transcription activator, effector binding  52.67 
 
 		 288 aa  298  6e-80  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1224  AraC family transcriptional regulator  46.79 
 
 		 288 aa  285  5.999999999999999e-76  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0494811  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3013  transcription activator, effector binding  48.74 
 
 		 289 aa  285  8e-76  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1774  AraC family transcriptional regulator  47.86 
 
 		 289 aa  278  5e-74  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.524324  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4381  transcription activator effector binding  46.79 
 
 		 286 aa  276  3e-73  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.134609  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2158  AraC family transcriptional regulator  46.1 
 
 		 294 aa  273  2.0000000000000002e-72  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3564  AraC family transcriptional regulator  46.4 
 
 		 279 aa  269  5e-71  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.236142  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2173  AraC family transcriptional regulator  45.91 
 
 		 289 aa  268  1e-70  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.671765  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4566  transcriptional regulator, AraC family  45.64 
 
 		 293 aa  244  1.9999999999999999e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.683768 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1354  AraC family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 293 aa  243  3e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.558119  normal  0.215319 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0028  transcriptional regulator, AraC family  44.04 
 
 		 279 aa  241  1e-62  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1398  AraC family transcriptional regulator  44.83 
 
 		 296 aa  238  8e-62  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.584508  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1644  transcriptional regulator, AraC family  44.95 
 
 		 293 aa  237  1e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0930139  normal  0.386203 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0034  transcriptional regulator, AraC family  43.68 
 
 		 279 aa  236  3e-61  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.255751 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0132  transcription regulator protein  44.87 
 
 		 265 aa  229  5e-59  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0853  transcriptional regulator, AraC family  39.86 
 
 		 284 aa  225  5.0000000000000005e-58  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04745  transcriptional regulator  44.64 
 
 		 255 aa  217  2e-55  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02895  predicted transcriptional regulator  54.84 
 
 		 160 aa  185  8e-46  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.468717  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0677  transcription activator effector binding protein  54.84 
 
 		 160 aa  185  8e-46  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3201  transcription activator effector binding domain/DNA gyrase inhibitor domain-containing protein  54.84 
 
 		 160 aa  185  8e-46  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3488  transcription activator effector binding domain/DNA gyrase inhibitor domain-containing protein  54.84 
 
 		 160 aa  185  8e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0674  transcription activator effector binding  54.84 
 
 		 160 aa  185  8e-46  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.112574 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02845  hypothetical protein  54.84 
 
 		 160 aa  185  8e-46  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.429305  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3312  transcription activator effector binding domain/DNA gyrase inhibitor domain-containing protein  53.55 
 
 		 160 aa  184  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.735437  normal  0.0832613 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3457  transcription activator effector binding domain/DNA gyrase inhibitor domain protein  54.19 
 
 		 160 aa  183  3e-45  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.29584  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4332  transcription activator effector binding domain/DNA gyrase inhibitor domain protein  53.55 
 
 		 160 aa  183  3e-45  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2489  transcription activator, effector binding  33.56 
 
 		 297 aa  181  1e-44  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1272  AraC family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 350 aa  173  2.9999999999999996e-42  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.702716  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0771  AraC family transcriptional regulator  39.45 
 
 		 288 aa  172  6.999999999999999e-42  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.472166 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3503  transcription activator, effector binding  36.27 
 
 		 294 aa  161  1e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00111619  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2590  transcription activator, effector binding  29.63 
 
 		 301 aa  149  4e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3099  AraC family transcriptional regulator  31.13 
 
 		 326 aa  147  2.0000000000000003e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3702  transcriptional regulator, AraC type  32.21 
 
 		 308 aa  140  1.9999999999999998e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2167  transcriptional regulator, AraC family  32.51 
 
 		 283 aa  140  3e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.273156  normal  0.0865176 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1956  transcriptional regulator, AraC family  31.45 
 
 		 283 aa  134  3e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0993473  normal  0.479782 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2703  transcription activator, effector binding  29.65 
 
 		 326 aa  129  4.0000000000000003e-29  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.268178 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0019  transcriptional regulator, AraC family  31.25 
 
 		 314 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7295  AraC family transcriptional regulator  30.85 
 
 		 277 aa  122  8e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.158014  normal  0.567517 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0540  transcriptional regulator, AraC family  27.49 
 
 		 289 aa  120  1.9999999999999998e-26  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.516999  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3306  AraC family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 292 aa  119  7e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2843  AraC family transcriptional regulator  28.67 
 
 		 296 aa  115  8.999999999999998e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.538425  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3057  AraC family transcriptional regulator  28.67 
 
 		 296 aa  115  8.999999999999998e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.118978  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3069  transcriptional regulator, AraC family  27.97 
 
 		 296 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2929  AraC family transcriptional regulator  31.12 
 
 		 293 aa  113  3e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0126  AraC family transcriptional regulator  31.12 
 
 		 293 aa  113  3e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.436666  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3086  transcriptional regulator, AraC family  28.92 
 
 		 296 aa  113  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.164604  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3953  AraC family transcriptional regulator  30.2 
 
 		 287 aa  113  4.0000000000000004e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0509927  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3088  AraC family transcriptional regulator  29.27 
 
 		 296 aa  112  5e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.530109  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0077  HTH-type transcriptional regulator, AraC-family  30.03 
 
 		 289 aa  112  5e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0140  AraC family transcriptional regulator  31.12 
 
 		 293 aa  112  6e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.877598  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2836  AraC family transcriptional regulator  28.42 
 
 		 296 aa  112  7.000000000000001e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00254989  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2816  AraC family transcriptional regulator  28.32 
 
 		 296 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0946  transcriptional regulator, AraC family  30.6 
 
 		 286 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.584518  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3161  AraC family transcriptional regulator  30.66 
 
 		 277 aa  109  7.000000000000001e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2776  AraC family transcriptional regulator  27.62 
 
 		 296 aa  108  1e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06471  hypothetical protein  29.9 
 
 		 289 aa  108  1e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2193  transcriptional regulator, AraC family  27.97 
 
 		 296 aa  107  2e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000412725 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000611  AraC-type DNA-binding domain-containing protein  29.9 
 
 		 289 aa  105  1e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0208776  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3983  transcriptional regulator, AraC family  29.43 
 
 		 291 aa  104  1e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3053  transcriptional regulator, AraC family  28.77 
 
 		 296 aa  103  3e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03191  transcription regulator protein  28.28 
 
 		 310 aa  100  2e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2323  transcriptional regulator, AraC family  28.47 
 
 		 289 aa  91.7  1e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.614848  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001047  transcriptional regulator AraC family  27.53 
 
 		 299 aa  90.9  2e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4053  AraC family transcriptional regulator  29.71 
 
 		 277 aa  90.9  2e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0011  transcriptional regulator, AraC family  26.67 
 
 		 285 aa  90.1  3e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000871788  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6275  AraC family transcriptional regulator  29.3 
 
 		 279 aa  89.7  4e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2938  AraC family transcriptional regulator  28.18 
 
 		 279 aa  89  1e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.487848  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0186  transcriptional regulator, AraC family  26.17 
 
 		 452 aa  87.8  2e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1952  AraC family transcriptional regulator  28.24 
 
 		 271 aa  87  3e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0598764  normal  0.641899 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5359  transcriptional regulator, AraC family  27.87 
 
 		 297 aa  86.7  4e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.6789  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1641  transcription activator effector binding protein  27.72 
 
 		 287 aa  86.7  4e-16  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3181  AraC family transcriptional regulator  25.17 
 
 		 292 aa  85.1  0.000000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3627  DNA gyrase inhibitor  26.83 
 
 		 300 aa  84  0.000000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000240584  hitchhiker  0.00747313 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3867  transcriptional regulator, AraC family  26.98 
 
 		 295 aa  82.8  0.000000000000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.0000535009  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12290  Transcriptional regulator, AraC family  27.94 
 
 		 325 aa  82.4  0.000000000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4973  transcriptional regulator, AraC family  31.21 
 
 		 290 aa  82  0.00000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3846  transcriptional regulator, AraC family  24.57 
 
 		 287 aa  81.6  0.00000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4986  AraC family transcriptional regulator  33.08 
 
 		 290 aa  82  0.00000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1271  transcriptional regulator, AraC family  39.05 
 
 		 300 aa  80.9  0.00000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.121916  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4724  AraC family transcriptional regulator  31.21 
 
 		 290 aa  81.3  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.440387  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5086  AraC family transcriptional regulator  31.21 
 
 		 290 aa  81.3  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4171  transcriptional regulator, AraC family  40 
 
 		 300 aa  81.3  0.00000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1216  AraC family transcriptional regulator  39.05 
 
 		 300 aa  80.5  0.00000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1036  AraC family transcriptional regulator  39.05 
 
 		 300 aa  80.5  0.00000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.139629  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1013  AraC family transcriptional regulator  39.05 
 
 		 300 aa  80.9  0.00000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.126228  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1194  transcriptional regulator, AraC family  39.05 
 
 		 300 aa  80.5  0.00000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.926126 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3417  transcriptional regulator, AraC family  25.27 
 
 		 279 aa  80.5  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.27768  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1114  AraC family transcriptional regulator  39.05 
 
 		 300 aa  80.5  0.00000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3715  transcriptional regulator, AraC family  24.81 
 
 		 279 aa  80.5  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.424878 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1021  AraC family transcriptional regulator  40 
 
 		 300 aa  80.5  0.00000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1170  transcriptional regulator, AraC family  40 
 
 		 300 aa  80.9  0.00000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00906983  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0165  AraC family transcriptional regulator  23.47 
 
 		 298 aa  80.1  0.00000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>