More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_1683 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_1683  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 		 221 aa  465  9.999999999999999e-131  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1484  transcriptional regulator  34.34 
 
 		 236 aa  110  2.0000000000000002e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000331721  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0814  right origin-binding protein  38.1 
 
 		 288 aa  94.4  1e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3609  AraC family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 288 aa  94.4  1e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3481  right origin-binding protein  38.1 
 
 		 288 aa  94.4  1e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0679  AraC family transcriptional regulator  36.96 
 
 		 289 aa  93.6  2e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0014238  normal  0.551474 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0529  transcriptional regulator, AraC family  39.68 
 
 		 288 aa  92.4  5e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1271  transcriptional regulator, AraC family  30.7 
 
 		 300 aa  92  6e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.121916  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3867  transcriptional regulator, AraC family  38.71 
 
 		 295 aa  92  7e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.0000535009  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0568  transcriptional regulator, AraC family  36.96 
 
 		 293 aa  91.3  1e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.117041  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1216  AraC family transcriptional regulator  30.7 
 
 		 300 aa  91.3  1e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1013  AraC family transcriptional regulator  30.7 
 
 		 300 aa  90.9  1e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.126228  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1014  AraC family transcriptional regulator  30.7 
 
 		 300 aa  90.9  1e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.210728  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1170  transcriptional regulator, AraC family  30.23 
 
 		 300 aa  90.9  1e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00906983  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0557  AraC family transcriptional regulator  36.23 
 
 		 289 aa  91.3  1e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3673  transcriptional regulator, AraC family  38.89 
 
 		 295 aa  90.9  1e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1036  AraC family transcriptional regulator  30.7 
 
 		 300 aa  90.9  2e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.139629  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1114  AraC family transcriptional regulator  30.7 
 
 		 300 aa  90.9  2e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1194  transcriptional regulator, AraC family  30.7 
 
 		 300 aa  90.9  2e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.926126 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1021  AraC family transcriptional regulator  30.23 
 
 		 300 aa  90.1  3e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4171  transcriptional regulator, AraC family  34.94 
 
 		 300 aa  89.7  3e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5910  right origin-binding protein  39.17 
 
 		 289 aa  89  5e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04272  DNA-binding transcriptional activator  39.17 
 
 		 289 aa  89  5e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3601  transcriptional regulator, AraC family  39.17 
 
 		 289 aa  89  5e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04237  hypothetical protein  39.17 
 
 		 289 aa  89  5e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3660  AraC family transcriptional regulator  39.17 
 
 		 289 aa  89  5e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4943  right origin-binding protein  39.17 
 
 		 289 aa  89  5e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4946  right origin-binding protein  39.17 
 
 		 289 aa  89  5e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.96055 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4994  right origin-binding protein  39.17 
 
 		 289 aa  89  5e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4632  right origin-binding protein  39.17 
 
 		 289 aa  89  5e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4998  right origin-binding protein  39.81 
 
 		 289 aa  89  6e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4837  right origin-binding protein  39.81 
 
 		 289 aa  89  6e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4996  right origin-binding protein  39.81 
 
 		 289 aa  89  6e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4944  right origin-binding protein  39.81 
 
 		 289 aa  89  6e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4910  right origin-binding protein  39.81 
 
 		 289 aa  89  6e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1523  AraC family transcriptional regulator  39.6 
 
 		 152 aa  86.7  2e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00364512  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2387  AraC family transcriptional regulator  37.27 
 
 		 128 aa  83.2  0.000000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000368739  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2484  AraC family transcriptional regulator  37.27 
 
 		 128 aa  83.2  0.000000000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.151206  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2755  transcriptional regulator, AraC family  42.86 
 
 		 300 aa  83.2  0.000000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2238  AraC family transcriptional regulator  34.71 
 
 		 297 aa  83.2  0.000000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000454466 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13590  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  56.45 
 
 		 71 aa  82  0.000000000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4672  AraC family transcriptional regulator  34.85 
 
 		 290 aa  81.3  0.00000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06300  methylphosphotriester-DNA alkyltransferase  32.52 
 
 		 302 aa  80.5  0.00000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1078  AraC family transcriptional regulator  40.22 
 
 		 113 aa  80.1  0.00000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.531138 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1931  AraC family transcriptional regulator  42.39 
 
 		 118 aa  80.5  0.00000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0129269  hitchhiker  0.0018191 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2833  AraC family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 128 aa  79  0.00000000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.360969  hitchhiker  0.00326998 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3482  AraC family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 140 aa  79  0.00000000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.119803  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0739  transposon Tn10 TetD protein  38.04 
 
 		 113 aa  79  0.00000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.899902  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0620  transposon Tn10 TetD protein  38.04 
 
 		 113 aa  79  0.00000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0677  transposon Tn10 TetD protein  38.04 
 
 		 113 aa  79  0.00000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.198694  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4973  transcriptional regulator, AraC family  32.58 
 
 		 290 aa  77  0.0000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4582  AraC family transcriptional regulator  33.82 
 
 		 290 aa  76.3  0.0000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.763033  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4947  transcriptional regulator, AraC family  32.58 
 
 		 290 aa  76.6  0.0000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4957  transcriptional regulator, AraC family  33.82 
 
 		 290 aa  76.6  0.0000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2797  transcription activator effector binding  34.75 
 
 		 279 aa  76.3  0.0000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.338998 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4724  AraC family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 290 aa  76.3  0.0000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.440387  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5086  AraC family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 290 aa  76.3  0.0000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0278  transcriptional regulator, AraC family  32.58 
 
 		 290 aa  76.3  0.0000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0634  transposon Tn10 TetD protein  36.96 
 
 		 113 aa  75.5  0.0000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4610  DNA-binding transcriptional regulator SoxS  39.18 
 
 		 107 aa  75.9  0.0000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0547666  normal  0.902957 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0693  transposon Tn10 TetD protein  36.96 
 
 		 113 aa  75.5  0.0000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.808673  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4609  DNA-binding transcriptional regulator SoxS  39.18 
 
 		 107 aa  75.9  0.0000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.917171  normal  0.375209 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4660  DNA-binding transcriptional regulator SoxS  39.18 
 
 		 107 aa  75.9  0.0000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4516  DNA-binding transcriptional regulator SoxS  39.18 
 
 		 107 aa  75.9  0.0000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4524  DNA-binding transcriptional regulator SoxS  39.18 
 
 		 107 aa  75.9  0.0000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4986  AraC family transcriptional regulator  33.09 
 
 		 290 aa  75.1  0.0000000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1897  AraC family transcriptional regulator  40.45 
 
 		 297 aa  75.5  0.0000000000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0436968  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2009  AraC family transcriptional regulator  40.45 
 
 		 297 aa  75.5  0.0000000000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.532444  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2466  transcriptional regulator, AraC family  37.36 
 
 		 313 aa  74.3  0.000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6884  transcriptional regulator, AraC family  38.1 
 
 		 301 aa  74.3  0.000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2360  AraC family transcriptional regulator  28.66 
 
 		 367 aa  74.7  0.000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000000000555626  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3702  transcriptional regulator, AraC type  33.33 
 
 		 308 aa  74.7  0.000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0597  AraC family transcriptional regulator  38.4 
 
 		 292 aa  74.7  0.000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1890  AraC family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 120 aa  74.7  0.000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.520011  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2406  AraC family transcriptional regulator  34.26 
 
 		 367 aa  73.9  0.000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.280616  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2326  AraC family transcriptional regulator  28.03 
 
 		 367 aa  74.3  0.000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2582  AraC family transcriptional regulator  34.26 
 
 		 364 aa  73.9  0.000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.147074  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1576  transcriptional regulator, AraC family  39.8 
 
 		 436 aa  73.9  0.000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0971  AraC family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 136 aa  73.6  0.000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000205729  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03934  DNA-binding transcriptional dual regulator  38.14 
 
 		 107 aa  73.2  0.000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0326041  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3930  transcriptional regulator, AraC family  38.14 
 
 		 107 aa  73.2  0.000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2413  transcriptional regulator, AraC family  38.95 
 
 		 322 aa  73.2  0.000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.333457  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3965  DNA-binding transcriptional regulator SoxS  38.14 
 
 		 107 aa  73.2  0.000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.105984 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4524  DNA-binding transcriptional regulator SoxS  38.14 
 
 		 107 aa  73.2  0.000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0182  AraC family transcriptional regulator  35 
 
 		 299 aa  73.2  0.000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6068  AraC family transcriptional regulator  37.76 
 
 		 287 aa  73.2  0.000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03894  hypothetical protein  38.14 
 
 		 107 aa  73.2  0.000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0334168  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4615  DNA-binding transcriptional regulator SoxS  38.14 
 
 		 107 aa  73.2  0.000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3715  transcriptional regulator, AraC family  41.05 
 
 		 279 aa  73.2  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.424878 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5565  DNA-binding transcriptional regulator SoxS  38.14 
 
 		 107 aa  73.2  0.000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.601347  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4580  DNA-binding transcriptional regulator SoxS  38.14 
 
 		 107 aa  73.2  0.000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4304  DNA-binding transcriptional regulator SoxS  38.14 
 
 		 107 aa  73.2  0.000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0009  helix-turn-helix domain-containing protein  34.26 
 
 		 306 aa  73.2  0.000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000070115 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0192  AraC family transcriptional regulator  35 
 
 		 299 aa  72.8  0.000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0179  AraC family transcriptional regulator  35 
 
 		 299 aa  72.8  0.000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0147136  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0191  AraC family transcriptional regulator  35 
 
 		 299 aa  72.8  0.000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0211  transcriptional regulator, AraC family  35 
 
 		 299 aa  72.8  0.000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2934  helix-turn-helix domain-containing protein  38.71 
 
 		 310 aa  72.8  0.000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0219137  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4566  AraC family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 290 aa  72.4  0.000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.017881  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0332  AraC family transcriptional regulator  36.08 
 
 		 285 aa  72.4  0.000000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>