More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_1576 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_1576  transcriptional regulator, AraC family  100 
 
 		 436 aa  885    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2703  transcription activator, effector binding  47.72 
 
 		 326 aa  323  4e-87  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.268178 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3099  AraC family transcriptional regulator  33.42 
 
 		 326 aa  168  2e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3627  DNA gyrase inhibitor  30.68 
 
 		 300 aa  149  1.0000000000000001e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000240584  hitchhiker  0.00747313 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001047  transcriptional regulator AraC family  30.41 
 
 		 299 aa  146  7.0000000000000006e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0077  HTH-type transcriptional regulator, AraC-family  46.55 
 
 		 289 aa  111  3e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3503  transcription activator, effector binding  31.49 
 
 		 294 aa  109  1e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00111619  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000611  AraC-type DNA-binding domain-containing protein  47.32 
 
 		 289 aa  106  1e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0208776  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06471  hypothetical protein  46.43 
 
 		 289 aa  106  1e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3702  transcriptional regulator, AraC type  44.64 
 
 		 308 aa  103  5e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0771  AraC family transcriptional regulator  35.56 
 
 		 288 aa  102  2e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.472166 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3088  AraC family transcriptional regulator  42.72 
 
 		 296 aa  100  3e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.530109  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1271  transcriptional regulator, AraC family  44.44 
 
 		 300 aa  100  5e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.121916  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1013  AraC family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 300 aa  100  5e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.126228  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1170  transcriptional regulator, AraC family  45.37 
 
 		 300 aa  100  5e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00906983  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1021  AraC family transcriptional regulator  45.37 
 
 		 300 aa  100  5e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3053  transcriptional regulator, AraC family  40 
 
 		 296 aa  100  6e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1216  AraC family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 300 aa  100  7e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1036  AraC family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 300 aa  100  7e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.139629  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4171  transcriptional regulator, AraC family  45.37 
 
 		 300 aa  100  7e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1114  AraC family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 300 aa  100  7e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1194  transcriptional regulator, AraC family  44.44 
 
 		 300 aa  100  7e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.926126 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1014  AraC family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 300 aa  99.8  8e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.210728  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3086  transcriptional regulator, AraC family  40.78 
 
 		 296 aa  99  1e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.164604  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0371  AraC family transcriptional regulator  42.72 
 
 		 288 aa  97.1  5e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2193  transcriptional regulator, AraC family  40 
 
 		 296 aa  96.7  7e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000412725 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1644  transcriptional regulator, AraC family  44.86 
 
 		 293 aa  96.3  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0930139  normal  0.386203 
 
 
-
 
NC_003296  RS03191  transcription regulator protein  42.5 
 
 		 310 aa  95.1  2e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5359  transcriptional regulator, AraC family  44.44 
 
 		 297 aa  95.5  2e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.6789  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3069  transcriptional regulator, AraC family  39.81 
 
 		 296 aa  94.4  4e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1398  AraC family transcriptional regulator  42.06 
 
 		 296 aa  93.6  6e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.584508  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2843  AraC family transcriptional regulator  38.83 
 
 		 296 aa  92.8  1e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.538425  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3057  AraC family transcriptional regulator  38.83 
 
 		 296 aa  92.8  1e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.118978  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1641  transcription activator effector binding protein  36.28 
 
 		 287 aa  92.4  1e-17  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1224  AraC family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 288 aa  92  2e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0494811  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2133  transcription activator effector binding  34.78 
 
 		 152 aa  92  2e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.774789  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2776  AraC family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 296 aa  91.3  3e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2836  AraC family transcriptional regulator  37.86 
 
 		 296 aa  91.3  3e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00254989  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1354  AraC family transcriptional regulator  42.99 
 
 		 293 aa  90.9  4e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.558119  normal  0.215319 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2816  AraC family transcriptional regulator  38.38 
 
 		 296 aa  89.4  1e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1217  transcription activator, effector binding  38.53 
 
 		 288 aa  89.4  1e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0621  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 291 aa  88.2  2e-16  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0019  transcriptional regulator, AraC family  27.63 
 
 		 314 aa  89  2e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2158  AraC family transcriptional regulator  39.62 
 
 		 294 aa  88.2  3e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4046  AraC family transcriptional regulator  36.75 
 
 		 289 aa  87  5e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6068  AraC family transcriptional regulator  47 
 
 		 287 aa  86.3  9e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3953  AraC family transcriptional regulator  42.73 
 
 		 287 aa  86.3  0.000000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0509927  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0540  transcriptional regulator, AraC family  33.83 
 
 		 289 aa  85.9  0.000000000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.516999  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4566  transcriptional regulator, AraC family  43.93 
 
 		 293 aa  86.3  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.683768 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7295  AraC family transcriptional regulator  26.96 
 
 		 277 aa  84  0.000000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.158014  normal  0.567517 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3161  AraC family transcriptional regulator  42.2 
 
 		 277 aa  83.6  0.000000000000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4381  transcription activator effector binding  36.11 
 
 		 286 aa  83.6  0.000000000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.134609  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2764  hypothetical protein  32.1 
 
 		 166 aa  83.2  0.000000000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000234477  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04745  transcriptional regulator  37.5 
 
 		 255 aa  82.4  0.00000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2788  hypothetical protein  32.72 
 
 		 166 aa  82.4  0.00000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.0000000178794  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2547  transcriptional regulator, AraC family  30.63 
 
 		 156 aa  81.3  0.00000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0684742  hitchhiker  0.0000000036137 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0758  AraC family transcriptional regulator  35.51 
 
 		 299 aa  81.3  0.00000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0853  transcriptional regulator, AraC family  34.31 
 
 		 284 aa  81.6  0.00000000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1474  transcriptional regulator, AraC family  37.61 
 
 		 286 aa  81.3  0.00000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3425  transcription activator, effector binding  36.84 
 
 		 288 aa  80.5  0.00000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3526  transcription activator, effector binding  37.72 
 
 		 288 aa  80.5  0.00000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2502  hypothetical protein  29.38 
 
 		 159 aa  80.5  0.00000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000359333  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1472  AraC family transcriptional regulator  41 
 
 		 292 aa  80.5  0.00000000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.327977  normal  0.780269 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3356  transcription activator, effector binding  37.72 
 
 		 288 aa  80.1  0.00000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3417  AraC family transcriptional regulator  45 
 
 		 299 aa  80.5  0.00000000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.138414  normal  0.441033 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3431  transcription activator, effector binding  36.84 
 
 		 288 aa  80.1  0.00000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1148  transcriptional regulator, AraC family  40.4 
 
 		 309 aa  80.1  0.00000000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0716  AraC family transcriptional regulator  42.57 
 
 		 296 aa  79.3  0.0000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00193737 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0192  AraC family transcriptional regulator  35.58 
 
 		 299 aa  79  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0179  AraC family transcriptional regulator  35.58 
 
 		 299 aa  79.3  0.0000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0147136  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0191  AraC family transcriptional regulator  35.58 
 
 		 299 aa  79  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1272  AraC family transcriptional regulator  22.61 
 
 		 350 aa  79.7  0.0000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.702716  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0211  transcriptional regulator, AraC family  35.58 
 
 		 299 aa  79.3  0.0000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0076  transcription activator, effector binding  37.62 
 
 		 288 aa  79.3  0.0000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0182  AraC family transcriptional regulator  35.58 
 
 		 299 aa  78.2  0.0000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0009  helix-turn-helix domain-containing protein  35.92 
 
 		 306 aa  78.2  0.0000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000070115 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2467  hypothetical protein  29.38 
 
 		 159 aa  77.8  0.0000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0149967  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2274  AraC family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 307 aa  77.8  0.0000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.348217  normal  0.470943 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0216  transcriptional regulator, AraC family  35.58 
 
 		 299 aa  77.4  0.0000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6041  transcriptional regulator, AraC family  40.2 
 
 		 303 aa  77.4  0.0000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.331066 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2745  transcriptional regulator, AraC family  29.63 
 
 		 158 aa  77.4  0.0000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.611146  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0132  transcription regulator protein  38.83 
 
 		 265 aa  77  0.0000000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1365  AraC family transcriptional regulator  39.81 
 
 		 353 aa  77  0.0000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.122979  normal  0.036458 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3013  transcription activator, effector binding  35 
 
 		 289 aa  76.6  0.0000000000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0176  AraC family transcriptional regulator  33.65 
 
 		 299 aa  76.6  0.0000000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2546  hypothetical protein  28.12 
 
 		 159 aa  75.9  0.000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000652694  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2733  hypothetical protein  28.12 
 
 		 159 aa  75.9  0.000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000951736  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2413  transcriptional regulator, AraC family  40.37 
 
 		 322 aa  76.3  0.000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.333457  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1650  AraC family transcriptional regulator  38.18 
 
 		 316 aa  75.9  0.000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2042  AraC family transcriptional regulator  41 
 
 		 301 aa  75.1  0.000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2708  transcriptional activator MltR  38.61 
 
 		 301 aa  75.5  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.215541  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2926  transcriptional regulator MtlR  38.61 
 
 		 287 aa  74.7  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.795893  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2173  AraC family transcriptional regulator  35.58 
 
 		 289 aa  74.3  0.000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.671765  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0971  AraC family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 136 aa  74.7  0.000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000205729  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34440  transcriptional regulator MtlR  38.61 
 
 		 301 aa  74.7  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000688741  normal  0.560291 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1956  transcriptional regulator, AraC family  36.54 
 
 		 283 aa  74.3  0.000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0993473  normal  0.479782 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2641  AraC family transcriptional regulator  38.61 
 
 		 301 aa  73.9  0.000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1683  AraC family transcriptional regulator  39.8 
 
 		 221 aa  73.9  0.000000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1440  helix-turn-helix, AraC type  36.45 
 
 		 209 aa  73.6  0.000000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2441  helix-turn-helix, AraC type  38.61 
 
 		 307 aa  73.6  0.000000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.0002572  decreased coverage  0.000290212 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>