90 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcer98_2133 on replicon NC_009674
Organism: Bacillus cytotoxicus NVH 391-98



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009674  Bcer98_2133  transcription activator effector binding  100 
 
 		 152 aa  317  3.9999999999999996e-86  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.774789  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2703  transcription activator, effector binding  38.06 
 
 		 326 aa  110  6e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.268178 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3099  AraC family transcriptional regulator  32.48 
 
 		 326 aa  93.2  1e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001047  transcriptional regulator AraC family  34.44 
 
 		 299 aa  92  3e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1576  transcriptional regulator, AraC family  34.78 
 
 		 436 aa  92  3e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3627  DNA gyrase inhibitor  38.84 
 
 		 300 aa  83.6  0.000000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000240584  hitchhiker  0.00747313 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0338  hypothetical protein  33.33 
 
 		 154 aa  78.6  0.00000000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.3398  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2798  transcription activator effector binding  30.77 
 
 		 156 aa  74.7  0.0000000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3503  transcription activator, effector binding  26.62 
 
 		 294 aa  72.8  0.000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00111619  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2502  hypothetical protein  35.16 
 
 		 159 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000359333  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2547  transcriptional regulator, AraC family  32.28 
 
 		 156 aa  67  0.00000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0684742  hitchhiker  0.0000000036137 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2733  hypothetical protein  34.38 
 
 		 159 aa  67  0.00000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000951736  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2546  hypothetical protein  34.38 
 
 		 159 aa  67  0.00000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000652694  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2764  hypothetical protein  33.59 
 
 		 166 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000234477  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0771  AraC family transcriptional regulator  28.24 
 
 		 288 aa  65.9  0.0000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.472166 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2745  transcriptional regulator, AraC family  33.07 
 
 		 158 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.611146  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2741  hypothetical protein  33.59 
 
 		 159 aa  63.9  0.0000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.19844e-25 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2788  hypothetical protein  31.5 
 
 		 166 aa  61.2  0.000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.0000000178794  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2753  hypothetical protein  27.54 
 
 		 156 aa  61.2  0.000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2467  hypothetical protein  32.03 
 
 		 159 aa  60.5  0.000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0149967  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2865  DNA gyrase inhibitor  27.03 
 
 		 157 aa  59.7  0.00000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.114813 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3349  transcription activator, effector binding  25.89 
 
 		 160 aa  59.7  0.00000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.808619  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01912  DNA gyrase inhibitor  27.03 
 
 		 157 aa  59.7  0.00000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01898  hypothetical protein  27.03 
 
 		 157 aa  59.7  0.00000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1631  DNA gyrase inhibitor  27.03 
 
 		 157 aa  59.3  0.00000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0493763 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1052  DNA gyrase inhibitor  27.03 
 
 		 157 aa  59.3  0.00000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.170354 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2147  DNA gyrase inhibitor  28.47 
 
 		 157 aa  58.9  0.00000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3702  transcriptional regulator, AraC type  33.33 
 
 		 308 aa  58.9  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2209  transcription activator, effector binding  25.55 
 
 		 156 aa  57  0.00000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.796256 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2300  DNA gyrase inhibitor  26.35 
 
 		 157 aa  56.6  0.0000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1226  DNA gyrase inhibitor  26.35 
 
 		 157 aa  56.2  0.0000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0804022  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1648  transcription activator effector binding protein  26.35 
 
 		 157 aa  56.2  0.0000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2480  transcription activator, effector binding  28.48 
 
 		 154 aa  54.7  0.0000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.540117  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2184  DNA gyrase inhibitor  27.39 
 
 		 155 aa  54.3  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2284  DNA gyrase inhibitor  26.28 
 
 		 155 aa  54.3  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0569461 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2238  DNA gyrase inhibitor  26.28 
 
 		 155 aa  54.3  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.478709  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2231  DNA gyrase inhibitor  26.28 
 
 		 155 aa  54.3  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.107411  normal  0.171145 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2397  DNA gyrase inhibitor  26.28 
 
 		 155 aa  54.3  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2816  AraC family transcriptional regulator  29.3 
 
 		 296 aa  53.1  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3086  transcriptional regulator, AraC family  29.45 
 
 		 296 aa  53.1  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.164604  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2577  DNA gyrase inhibitor  28.4 
 
 		 157 aa  53.1  0.000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0670847 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0946  transcriptional regulator, AraC family  27.45 
 
 		 286 aa  52.8  0.000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.584518  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1774  AraC family transcriptional regulator  24.53 
 
 		 289 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.524324  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3057  AraC family transcriptional regulator  29.3 
 
 		 296 aa  52.8  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.118978  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2843  AraC family transcriptional regulator  29.3 
 
 		 296 aa  52.8  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.538425  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3069  transcriptional regulator, AraC family  30.14 
 
 		 296 aa  52.8  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3053  transcriptional regulator, AraC family  29.45 
 
 		 296 aa  52  0.000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0540  transcriptional regulator, AraC family  25.32 
 
 		 289 aa  52  0.000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.516999  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2836  AraC family transcriptional regulator  29.93 
 
 		 296 aa  52  0.000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00254989  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06471  hypothetical protein  28.99 
 
 		 289 aa  51.6  0.000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6018  hypothetical protein  27.03 
 
 		 156 aa  51.6  0.000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000611  AraC-type DNA-binding domain-containing protein  26.09 
 
 		 289 aa  51.6  0.000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0208776  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0853  transcriptional regulator, AraC family  29.77 
 
 		 284 aa  51.2  0.000005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0418  transcription activator, effector binding  27.03 
 
 		 154 aa  51.2  0.000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3356  transcription activator, effector binding  27.22 
 
 		 288 aa  50.8  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0621  AraC family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 291 aa  50.8  0.000006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3431  transcription activator, effector binding  27.22 
 
 		 288 aa  50.8  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3425  transcription activator, effector binding  27.22 
 
 		 288 aa  50.8  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3564  AraC family transcriptional regulator  24.53 
 
 		 279 aa  50.8  0.000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.236142  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3088  AraC family transcriptional regulator  30.14 
 
 		 296 aa  50.4  0.000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.530109  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0077  HTH-type transcriptional regulator, AraC-family  27.01 
 
 		 289 aa  49.7  0.00001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3526  transcription activator, effector binding  27.22 
 
 		 288 aa  49.3  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0124  transcription activator effector binding  27.27 
 
 		 159 aa  48.9  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2776  AraC family transcriptional regulator  30.14 
 
 		 296 aa  48.9  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2173  AraC family transcriptional regulator  23.9 
 
 		 289 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.671765  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2193  transcriptional regulator, AraC family  29.45 
 
 		 296 aa  48.1  0.00005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000412725 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0116  transcription activator, effector binding  24.68 
 
 		 159 aa  46.2  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0140  AraC family transcriptional regulator  25.32 
 
 		 293 aa  46.2  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.877598  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4446  putative DNA gyrase inhibitor  25.17 
 
 		 160 aa  45.4  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.823142  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0472  transcription activator effector binding  27.27 
 
 		 156 aa  45.1  0.0004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.506351  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1641  transcription activator effector binding protein  24.07 
 
 		 287 aa  44.7  0.0005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2929  AraC family transcriptional regulator  24.68 
 
 		 293 aa  44.3  0.0005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0126  AraC family transcriptional regulator  24.68 
 
 		 293 aa  44.3  0.0005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.436666  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02895  predicted transcriptional regulator  33.33 
 
 		 160 aa  43.9  0.0008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.468717  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0677  transcription activator effector binding protein  33.33 
 
 		 160 aa  43.9  0.0008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02845  hypothetical protein  33.33 
 
 		 160 aa  43.9  0.0008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.429305  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0674  transcription activator effector binding  33.33 
 
 		 160 aa  43.9  0.0008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.112574 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3201  transcription activator effector binding domain/DNA gyrase inhibitor domain-containing protein  33.33 
 
 		 160 aa  43.9  0.0008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4366  transcription activator, effector binding  24.36 
 
 		 155 aa  43.1  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0866896  normal  0.40672 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3306  AraC family transcriptional regulator  23.38 
 
 		 292 aa  43.5  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3312  transcription activator effector binding domain/DNA gyrase inhibitor domain-containing protein  33.33 
 
 		 160 aa  43.5  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.735437  normal  0.0832613 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0019  transcriptional regulator, AraC family  23.24 
 
 		 314 aa  43.5  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4332  transcription activator effector binding domain/DNA gyrase inhibitor domain protein  33.33 
 
 		 160 aa  43.5  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3457  transcription activator effector binding domain/DNA gyrase inhibitor domain protein  31.94 
 
 		 160 aa  42.4  0.002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.29584  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0126  transcription activator effector binding  22.78 
 
 		 159 aa  41.2  0.004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1272  AraC family transcriptional regulator  24.81 
 
 		 350 aa  41.2  0.005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.702716  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3488  transcription activator effector binding domain/DNA gyrase inhibitor domain-containing protein  31.94 
 
 		 160 aa  40.8  0.007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2654  transcriptional regulator, AraC family  20.77 
 
 		 297 aa  40.8  0.007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2167  transcriptional regulator, AraC family  25.58 
 
 		 283 aa  40.4  0.009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.273156  normal  0.0865176 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1956  transcriptional regulator, AraC family  24.75 
 
 		 283 aa  40  0.01  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0993473  normal  0.479782 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>