52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeHA_C2284 on replicon NC_011083
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011205  SeD_A2397  DNA gyrase inhibitor  100 
 
 		 155 aa  322  1e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2231  DNA gyrase inhibitor  100 
 
 		 155 aa  322  1e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.107411  normal  0.171145 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2284  DNA gyrase inhibitor  100 
 
 		 155 aa  322  1e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0569461 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2238  DNA gyrase inhibitor  100 
 
 		 155 aa  322  1e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.478709  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2184  DNA gyrase inhibitor  99.35 
 
 		 155 aa  321  2e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01912  DNA gyrase inhibitor  71.61 
 
 		 157 aa  241  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1631  DNA gyrase inhibitor  71.61 
 
 		 157 aa  241  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0493763 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01898  hypothetical protein  71.61 
 
 		 157 aa  241  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2865  DNA gyrase inhibitor  71.61 
 
 		 157 aa  241  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.114813 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1052  DNA gyrase inhibitor  70.97 
 
 		 157 aa  241  3e-63  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.170354 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2577  DNA gyrase inhibitor  69.68 
 
 		 157 aa  239  1e-62  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0670847 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1648  transcription activator effector binding protein  70.97 
 
 		 157 aa  238  2e-62  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1226  DNA gyrase inhibitor  70.97 
 
 		 157 aa  238  2e-62  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0804022  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2300  DNA gyrase inhibitor  70.97 
 
 		 157 aa  238  2.9999999999999997e-62  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2147  DNA gyrase inhibitor  70.32 
 
 		 157 aa  236  9e-62  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3021  DNA gyrase inhibitor  35.56 
 
 		 156 aa  97.8  5e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1593  transcription activator effector binding  31.17 
 
 		 154 aa  84  7e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.350855  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2798  transcription activator effector binding  25.9 
 
 		 156 aa  61.6  0.000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2703  transcription activator, effector binding  28.3 
 
 		 326 aa  61.6  0.000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.268178 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3306  AraC family transcriptional regulator  25.76 
 
 		 292 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001047  transcriptional regulator AraC family  23.87 
 
 		 299 aa  54.7  0.0000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2133  transcription activator effector binding  26.28 
 
 		 152 aa  54.3  0.0000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.774789  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1576  transcriptional regulator, AraC family  23.27 
 
 		 436 aa  53.1  0.000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0019  transcriptional regulator, AraC family  27.04 
 
 		 314 aa  53.1  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0116  transcription activator, effector binding  25 
 
 		 159 aa  52.8  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0140  AraC family transcriptional regulator  27.61 
 
 		 293 aa  52.8  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.877598  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4446  putative DNA gyrase inhibitor  26.92 
 
 		 160 aa  51.6  0.000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.823142  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2209  transcription activator, effector binding  26.62 
 
 		 156 aa  50.8  0.000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.796256 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3099  AraC family transcriptional regulator  25.48 
 
 		 326 aa  50.4  0.000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0126  AraC family transcriptional regulator  26.87 
 
 		 293 aa  50.8  0.000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.436666  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2929  AraC family transcriptional regulator  26.87 
 
 		 293 aa  50.8  0.000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3503  transcription activator, effector binding  24.64 
 
 		 294 aa  50.4  0.000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00111619  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3627  DNA gyrase inhibitor  25.2 
 
 		 300 aa  49.3  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000240584  hitchhiker  0.00747313 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2167  transcriptional regulator, AraC family  30.28 
 
 		 283 aa  49.7  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.273156  normal  0.0865176 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0126  transcription activator effector binding  22.73 
 
 		 159 aa  47.8  0.00006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1956  transcriptional regulator, AraC family  30.43 
 
 		 283 aa  47  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0993473  normal  0.479782 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3702  transcriptional regulator, AraC type  24.65 
 
 		 308 aa  45.8  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2788  hypothetical protein  25.78 
 
 		 166 aa  46.2  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.0000000178794  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2546  hypothetical protein  24.22 
 
 		 159 aa  45.4  0.0003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000652694  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2741  hypothetical protein  24.22 
 
 		 159 aa  45.4  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.19844e-25 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2733  hypothetical protein  24.22 
 
 		 159 aa  45.4  0.0003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000951736  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4381  transcription activator effector binding  30.09 
 
 		 286 aa  45.4  0.0003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.134609  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2764  hypothetical protein  24.22 
 
 		 166 aa  45.1  0.0004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000234477  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0124  transcription activator effector binding  25 
 
 		 159 aa  45.1  0.0004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0771  AraC family transcriptional regulator  24.03 
 
 		 288 aa  44.3  0.0006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.472166 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2467  hypothetical protein  24.22 
 
 		 159 aa  43.9  0.0008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0149967  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2502  hypothetical protein  24.22 
 
 		 159 aa  43.9  0.0008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000359333  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0540  transcriptional regulator, AraC family  29.5 
 
 		 289 aa  43.9  0.0009  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.516999  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1224  AraC family transcriptional regulator  24.05 
 
 		 288 aa  43.5  0.001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0494811  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2745  transcriptional regulator, AraC family  23.44 
 
 		 158 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.611146  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2753  hypothetical protein  23.08 
 
 		 156 aa  42.4  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0621  AraC family transcriptional regulator  24.62 
 
 		 291 aa  42.4  0.002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>