122 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_2798 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_2798  transcription activator effector binding  100 
 
 		 156 aa  312  9.999999999999999e-85  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2753  hypothetical protein  50 
 
 		 156 aa  157  6e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2209  transcription activator, effector binding  49.36 
 
 		 156 aa  154  3e-37  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.796256 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3702  transcriptional regulator, AraC type  43.23 
 
 		 308 aa  132  1.9999999999999998e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0771  AraC family transcriptional regulator  40.94 
 
 		 288 aa  108  2.0000000000000002e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.472166 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3503  transcription activator, effector binding  35.06 
 
 		 294 aa  103  8e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00111619  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2703  transcription activator, effector binding  34.81 
 
 		 326 aa  88.6  3e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.268178 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2929  AraC family transcriptional regulator  37.18 
 
 		 293 aa  88.2  4e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0126  AraC family transcriptional regulator  37.18 
 
 		 293 aa  88.2  4e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.436666  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0126  transcription activator effector binding  36.54 
 
 		 159 aa  87.8  5e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0140  AraC family transcriptional regulator  36.54 
 
 		 293 aa  86.3  1e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.877598  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0116  transcription activator, effector binding  35.48 
 
 		 159 aa  86.3  2e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1956  transcriptional regulator, AraC family  35.06 
 
 		 283 aa  85.5  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0993473  normal  0.479782 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0019  transcriptional regulator, AraC family  33.12 
 
 		 314 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3349  transcription activator, effector binding  33.1 
 
 		 160 aa  82.4  0.000000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.808619  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2167  transcriptional regulator, AraC family  33.99 
 
 		 283 aa  82  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.273156  normal  0.0865176 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3306  AraC family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 292 aa  81.3  0.000000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4446  putative DNA gyrase inhibitor  32.05 
 
 		 160 aa  80.9  0.000000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.823142  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0124  transcription activator effector binding  34.84 
 
 		 159 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0946  transcriptional regulator, AraC family  36.18 
 
 		 286 aa  79.3  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.584518  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3526  transcription activator, effector binding  35.71 
 
 		 288 aa  77.8  0.00000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3953  AraC family transcriptional regulator  33.55 
 
 		 287 aa  76.6  0.0000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0509927  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3425  transcription activator, effector binding  35.06 
 
 		 288 aa  76.6  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3431  transcription activator, effector binding  35.06 
 
 		 288 aa  76.3  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3356  transcription activator, effector binding  35.06 
 
 		 288 aa  76.3  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3099  AraC family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 326 aa  75.5  0.0000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2133  transcription activator effector binding  30.77 
 
 		 152 aa  74.7  0.0000000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.774789  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7295  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 277 aa  73.6  0.000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.158014  normal  0.567517 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2745  transcriptional regulator, AraC family  28.93 
 
 		 158 aa  70.5  0.000000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.611146  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3086  transcriptional regulator, AraC family  30 
 
 		 296 aa  70.1  0.00000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.164604  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3161  AraC family transcriptional regulator  36.69 
 
 		 277 aa  68.9  0.00000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2547  transcriptional regulator, AraC family  30.77 
 
 		 156 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0684742  hitchhiker  0.0000000036137 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2776  AraC family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 296 aa  67.8  0.00000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2324  hypothetical protein  30.13 
 
 		 321 aa  67.8  0.00000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0188345  normal  0.69843 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2816  AraC family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 296 aa  65.5  0.0000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3069  transcriptional regulator, AraC family  29.19 
 
 		 296 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0853  transcriptional regulator, AraC family  30.13 
 
 		 284 aa  65.5  0.0000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3053  transcriptional regulator, AraC family  29.19 
 
 		 296 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2843  AraC family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 296 aa  65.5  0.0000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.538425  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1224  AraC family transcriptional regulator  31.45 
 
 		 288 aa  65.1  0.0000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0494811  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3057  AraC family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 296 aa  65.5  0.0000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.118978  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1052  DNA gyrase inhibitor  29.5 
 
 		 157 aa  64.3  0.0000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.170354 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2764  hypothetical protein  28.3 
 
 		 166 aa  63.9  0.0000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000234477  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2836  AraC family transcriptional regulator  29.81 
 
 		 296 aa  64.3  0.0000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00254989  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1631  DNA gyrase inhibitor  28.78 
 
 		 157 aa  64.3  0.0000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0493763 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3088  AraC family transcriptional regulator  29.81 
 
 		 296 aa  63.9  0.0000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.530109  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2147  DNA gyrase inhibitor  29.45 
 
 		 157 aa  63.9  0.0000000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01912  DNA gyrase inhibitor  28.78 
 
 		 157 aa  63.5  0.0000000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01898  hypothetical protein  28.78 
 
 		 157 aa  63.5  0.0000000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2865  DNA gyrase inhibitor  28.78 
 
 		 157 aa  63.5  0.0000000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.114813 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2193  transcriptional regulator, AraC family  29.81 
 
 		 296 aa  63.5  0.000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000412725 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1774  AraC family transcriptional regulator  29.87 
 
 		 289 aa  62.8  0.000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.524324  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2788  hypothetical protein  28.3 
 
 		 166 aa  62.8  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.0000000178794  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2546  hypothetical protein  28.21 
 
 		 159 aa  62.4  0.000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000652694  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2733  hypothetical protein  28.21 
 
 		 159 aa  62.4  0.000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000951736  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2502  hypothetical protein  28.21 
 
 		 159 aa  61.6  0.000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000359333  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2238  DNA gyrase inhibitor  25.9 
 
 		 155 aa  61.6  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.478709  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2284  DNA gyrase inhibitor  25.9 
 
 		 155 aa  61.6  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0569461 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2231  DNA gyrase inhibitor  25.9 
 
 		 155 aa  61.6  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.107411  normal  0.171145 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2397  DNA gyrase inhibitor  25.9 
 
 		 155 aa  61.6  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2480  transcription activator, effector binding  27.46 
 
 		 154 aa  61.2  0.000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.540117  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1576  transcriptional regulator, AraC family  30.71 
 
 		 436 aa  61.2  0.000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1648  transcription activator effector binding protein  28.78 
 
 		 157 aa  60.8  0.000000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2300  DNA gyrase inhibitor  28.78 
 
 		 157 aa  60.8  0.000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1226  DNA gyrase inhibitor  28.78 
 
 		 157 aa  60.8  0.000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0804022  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2184  DNA gyrase inhibitor  25.18 
 
 		 155 aa  60.5  0.000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0132  transcription regulator protein  30.99 
 
 		 265 aa  59.3  0.00000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2741  hypothetical protein  27.56 
 
 		 159 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.19844e-25 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6018  hypothetical protein  25.83 
 
 		 156 aa  59.3  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0418  transcription activator, effector binding  25.83 
 
 		 154 aa  59.3  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4381  transcription activator effector binding  33.63 
 
 		 286 aa  59.3  0.00000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.134609  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2577  DNA gyrase inhibitor  24.65 
 
 		 157 aa  58.9  0.00000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0670847 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1474  transcriptional regulator, AraC family  30.32 
 
 		 286 aa  58.5  0.00000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3564  AraC family transcriptional regulator  29.22 
 
 		 279 aa  57.4  0.00000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.236142  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2467  hypothetical protein  26.92 
 
 		 159 aa  56.6  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0149967  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2173  AraC family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 289 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.671765  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0371  AraC family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 288 aa  55.5  0.0000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4046  AraC family transcriptional regulator  32.54 
 
 		 289 aa  54.7  0.0000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1217  transcription activator, effector binding  30.52 
 
 		 288 aa  54.3  0.0000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3013  transcription activator, effector binding  31.73 
 
 		 289 aa  53.1  0.000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2116  transcriptional regulator, AraC family  28.1 
 
 		 287 aa  52.4  0.000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0918782  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3627  DNA gyrase inhibitor  35.37 
 
 		 300 aa  52.8  0.000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000240584  hitchhiker  0.00747313 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3021  DNA gyrase inhibitor  33.57 
 
 		 156 aa  52.8  0.000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0540  transcriptional regulator, AraC family  26.19 
 
 		 289 aa  52  0.000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.516999  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12290  Transcriptional regulator, AraC family  28.93 
 
 		 325 aa  51.2  0.000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4332  transcription activator effector binding domain/DNA gyrase inhibitor domain protein  32.08 
 
 		 160 aa  51.6  0.000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0684  MerR family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 279 aa  50.8  0.000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001047  transcriptional regulator AraC family  27.68 
 
 		 299 aa  50.8  0.000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02895  predicted transcriptional regulator  32.08 
 
 		 160 aa  50.1  0.00001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.468717  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0677  transcription activator effector binding protein  32.08 
 
 		 160 aa  50.1  0.00001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02845  hypothetical protein  32.08 
 
 		 160 aa  50.1  0.00001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.429305  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0076  transcription activator, effector binding  27.85 
 
 		 288 aa  50.1  0.00001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3201  transcription activator effector binding domain/DNA gyrase inhibitor domain-containing protein  32.08 
 
 		 160 aa  50.1  0.00001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3488  transcription activator effector binding domain/DNA gyrase inhibitor domain-containing protein  32.08 
 
 		 160 aa  49.7  0.00001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0674  transcription activator effector binding  32.08 
 
 		 160 aa  50.1  0.00001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.112574 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3312  transcription activator effector binding domain/DNA gyrase inhibitor domain-containing protein  32.08 
 
 		 160 aa  50.1  0.00001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.735437  normal  0.0832613 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3457  transcription activator effector binding domain/DNA gyrase inhibitor domain protein  31.13 
 
 		 160 aa  48.5  0.00003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.29584  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1593  transcription activator effector binding  29.58 
 
 		 154 aa  48.5  0.00004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.350855  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1641  transcription activator effector binding protein  25.74 
 
 		 287 aa  47.8  0.00005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0296  transcription activator effector binding  30.7 
 
 		 120 aa  47.8  0.00006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.285639 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>