More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BcerKBAB4_2836 on replicon NC_010184
Organism: Bacillus weihenstephanensis KBAB4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010184  BcerKBAB4_2836  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 
296 aa  617  1e-176  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00254989  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3088  AraC family transcriptional regulator  89.53 
 
 
296 aa  558  1e-158  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.530109  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2193  transcriptional regulator, AraC family  89.53 
 
 
296 aa  560  1e-158  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000412725 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3053  transcriptional regulator, AraC family  88.51 
 
 
296 aa  556  1e-157  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3086  transcriptional regulator, AraC family  87.84 
 
 
296 aa  552  1e-156  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.164604  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3069  transcriptional regulator, AraC family  86.49 
 
 
296 aa  548  1e-155  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2776  AraC family transcriptional regulator  86.15 
 
 
296 aa  543  1e-153  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2843  AraC family transcriptional regulator  85.14 
 
 
296 aa  538  9.999999999999999e-153  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.538425  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2816  AraC family transcriptional regulator  85.47 
 
 
296 aa  539  9.999999999999999e-153  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3057  AraC family transcriptional regulator  85.14 
 
 
296 aa  538  9.999999999999999e-153  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.118978  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2703  transcription activator, effector binding  29.04 
 
 
326 aa  155  7e-37  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.268178 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0771  AraC family transcriptional regulator  29.66 
 
 
288 aa  146  5e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.472166 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3702  transcriptional regulator, AraC type  29.53 
 
 
308 aa  146  5e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3953  AraC family transcriptional regulator  32.04 
 
 
287 aa  143  3e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0509927  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3099  AraC family transcriptional regulator  28.35 
 
 
326 aa  139  7e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3503  transcription activator, effector binding  32.09 
 
 
294 aa  137  3.0000000000000003e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00111619  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0540  transcriptional regulator, AraC family  30.41 
 
 
289 aa  136  5e-31  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.516999  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0019  transcriptional regulator, AraC family  28.86 
 
 
314 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1956  transcriptional regulator, AraC family  30.1 
 
 
283 aa  129  4.0000000000000003e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0993473  normal  0.479782 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2173  AraC family transcriptional regulator  29.97 
 
 
289 aa  129  6e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.671765  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2167  transcriptional regulator, AraC family  28.52 
 
 
283 aa  129  7.000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.273156  normal  0.0865176 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1217  transcription activator, effector binding  30.88 
 
 
288 aa  128  1.0000000000000001e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1224  AraC family transcriptional regulator  30.67 
 
 
288 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0494811  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1641  transcription activator effector binding protein  28.14 
 
 
287 aa  124  1e-27  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7295  AraC family transcriptional regulator  27.49 
 
 
277 aa  122  8e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.158014  normal  0.567517 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0034  transcriptional regulator, AraC family  29.47 
 
 
279 aa  121  9.999999999999999e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.255751 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001047  transcriptional regulator AraC family  29.63 
 
 
299 aa  120  3e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3627  DNA gyrase inhibitor  28.91 
 
 
300 aa  120  3e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000240584  hitchhiker  0.00747313 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3564  AraC family transcriptional regulator  28.92 
 
 
279 aa  119  7e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.236142  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1774  AraC family transcriptional regulator  29.19 
 
 
289 aa  119  7e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.524324  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3526  transcription activator, effector binding  28.18 
 
 
288 aa  118  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0028  transcriptional regulator, AraC family  28.92 
 
 
279 aa  118  9.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3425  transcription activator, effector binding  29.27 
 
 
288 aa  116  3.9999999999999997e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0853  transcriptional regulator, AraC family  30.83 
 
 
284 aa  115  1.0000000000000001e-24  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3431  transcription activator, effector binding  28.77 
 
 
288 aa  114  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4046  AraC family transcriptional regulator  27.03 
 
 
289 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3306  AraC family transcriptional regulator  26.92 
 
 
292 aa  113  3e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3161  AraC family transcriptional regulator  28.67 
 
 
277 aa  114  3e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3356  transcription activator, effector binding  28.42 
 
 
288 aa  112  7.000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0132  transcription regulator protein  30.11 
 
 
265 aa  111  1.0000000000000001e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0076  transcription activator, effector binding  27.89 
 
 
288 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0371  AraC family transcriptional regulator  28.24 
 
 
288 aa  109  5e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2929  AraC family transcriptional regulator  25.26 
 
 
293 aa  109  6e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0126  AraC family transcriptional regulator  25.26 
 
 
293 aa  109  6e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.436666  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1474  transcriptional regulator, AraC family  29.05 
 
 
286 aa  108  8.000000000000001e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0140  AraC family transcriptional regulator  25.61 
 
 
293 aa  108  1e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.877598  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0946  transcriptional regulator, AraC family  26.99 
 
 
286 aa  107  2e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.584518  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4381  transcription activator effector binding  28.47 
 
 
286 aa  107  2e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.134609  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000611  AraC-type DNA-binding domain-containing protein  28.38 
 
 
289 aa  106  5e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0208776  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3013  transcription activator, effector binding  29.14 
 
 
289 aa  105  7e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06471  hypothetical protein  27.12 
 
 
289 aa  105  8e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03191  transcription regulator protein  25.5 
 
 
310 aa  105  9e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2158  AraC family transcriptional regulator  26.56 
 
 
294 aa  104  2e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1644  transcriptional regulator, AraC family  25.6 
 
 
293 aa  102  8e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0930139  normal  0.386203 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0077  HTH-type transcriptional regulator, AraC-family  26.8 
 
 
289 aa  101  1e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5359  transcriptional regulator, AraC family  25.97 
 
 
297 aa  101  2e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.6789  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1398  AraC family transcriptional regulator  26.94 
 
 
296 aa  101  2e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.584508  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2678  transcriptional regulator, AraC family  24.24 
 
 
284 aa  99.4  7e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1354  AraC family transcriptional regulator  25.42 
 
 
293 aa  99  9e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.558119  normal  0.215319 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4566  transcriptional regulator, AraC family  25.51 
 
 
293 aa  92.4  7e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.683768 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1216  AraC family transcriptional regulator  25.08 
 
 
300 aa  91.3  2e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1194  transcriptional regulator, AraC family  24.62 
 
 
300 aa  91.3  2e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.926126 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1576  transcriptional regulator, AraC family  37.86 
 
 
436 aa  91.3  2e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06300  methylphosphotriester-DNA alkyltransferase  28 
 
 
302 aa  90.5  3e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1036  AraC family transcriptional regulator  24.1 
 
 
300 aa  90.1  4e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.139629  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1114  AraC family transcriptional regulator  24.1 
 
 
300 aa  90.1  4e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1013  AraC family transcriptional regulator  24.1 
 
 
300 aa  89.4  6e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.126228  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1014  AraC family transcriptional regulator  24.43 
 
 
300 aa  89.7  6e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.210728  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4171  transcriptional regulator, AraC family  24.1 
 
 
300 aa  89.4  7e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2323  transcriptional regulator, AraC family  27.76 
 
 
289 aa  89.4  7e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.614848  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1271  transcriptional regulator, AraC family  24.39 
 
 
300 aa  89.4  7e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.121916  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1170  transcriptional regulator, AraC family  24.43 
 
 
300 aa  89  9e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00906983  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6041  transcriptional regulator, AraC family  44.55 
 
 
303 aa  88.2  2e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.331066 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1021  AraC family transcriptional regulator  25.85 
 
 
300 aa  87.8  2e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0621  AraC family transcriptional regulator  23.69 
 
 
291 aa  86.7  4e-16  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2274  AraC family transcriptional regulator  44.55 
 
 
307 aa  86.7  4e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.348217  normal  0.470943 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1922  transcriptional regulator, AraC family  24.32 
 
 
291 aa  85.5  0.000000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.890213  normal  0.89853 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0990  AraC family transcriptional regulator  23.03 
 
 
281 aa  83.6  0.000000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2210  transcriptional regulator, AraC family  23 
 
 
291 aa  82.4  0.000000000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3983  transcriptional regulator, AraC family  27.05 
 
 
291 aa  81.6  0.00000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5265  transcriptional regulator, AraC family  24.33 
 
 
281 aa  80.9  0.00000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0009  helix-turn-helix domain-containing protein  23.78 
 
 
306 aa  81.3  0.00000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000070115 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1472  AraC family transcriptional regulator  28.28 
 
 
294 aa  80.1  0.00000000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.102681  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4138  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 
311 aa  79.7  0.00000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0205  transcriptional activator, AraC family  23.26 
 
 
281 aa  79.7  0.00000000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000524418 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3170  transcriptional regulator, AraC family  35.78 
 
 
332 aa  79  0.00000000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.777646  normal 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0223  transcriptional activator, AraC family  23.26 
 
 
281 aa  79  0.0000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000178737 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6995  AraC/XylS family transcriptional regulator  38 
 
 
255 aa  78.6  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00467693 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2759  AraC family transcriptional regulator  23.31 
 
 
292 aa  79  0.0000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0315  transcriptional regulator, AraC family  32.11 
 
 
168 aa  78.2  0.0000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7634  transcriptional regulator AraC family  36.36 
 
 
304 aa  78.2  0.0000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.63081  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3996  helix-turn-helix domain-containing protein  35 
 
 
289 aa  77.8  0.0000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04745  transcriptional regulator  33.01 
 
 
255 aa  77  0.0000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5122  transcriptional regulator AraC family  33.65 
 
 
314 aa  76.6  0.0000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.962416  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0526  transcriptional regulator, AraC family  35.24 
 
 
129 aa  76.6  0.0000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000198595  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4119  transcriptional regulator, AraC family  24.12 
 
 
262 aa  76.6  0.0000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.840918  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0937  transcriptional regulator, AraC family  37 
 
 
291 aa  76.3  0.0000000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.127184  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2157  two component AraC family transcriptional regulator  42.11 
 
 
250 aa  76.3  0.0000000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0322408 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3159  AraC family transcriptional regulator  35.65 
 
 
296 aa  76.3  0.0000000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4367  transcriptional regulator, AraC family  41 
 
 
286 aa  75.5  0.0000000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0906731 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>