More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BCB4264_A3053 on replicon NC_011725
Organism: Bacillus cereus B4264



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011725  BCB4264_A3053  transcriptional regulator, AraC family  100 
 
 
296 aa  616  1e-175  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3088  AraC family transcriptional regulator  92.23 
 
 
296 aa  571  1.0000000000000001e-162  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.530109  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3086  transcriptional regulator, AraC family  90.54 
 
 
296 aa  567  1e-161  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.164604  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3069  transcriptional regulator, AraC family  91.55 
 
 
296 aa  564  1e-160  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2843  AraC family transcriptional regulator  89.86 
 
 
296 aa  553  1e-157  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.538425  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2816  AraC family transcriptional regulator  90.2 
 
 
296 aa  555  1e-157  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2776  AraC family transcriptional regulator  89.19 
 
 
296 aa  554  1e-157  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3057  AraC family transcriptional regulator  89.86 
 
 
296 aa  553  1e-157  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.118978  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2193  transcriptional regulator, AraC family  89.53 
 
 
296 aa  556  1e-157  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000412725 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2836  AraC family transcriptional regulator  88.51 
 
 
296 aa  556  1e-157  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00254989  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2703  transcription activator, effector binding  27.49 
 
 
326 aa  152  5.9999999999999996e-36  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.268178 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3503  transcription activator, effector binding  32.2 
 
 
294 aa  144  2e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00111619  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3953  AraC family transcriptional regulator  31.34 
 
 
287 aa  142  5e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0509927  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3702  transcriptional regulator, AraC type  29.53 
 
 
308 aa  141  9.999999999999999e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0771  AraC family transcriptional regulator  29.31 
 
 
288 aa  140  1.9999999999999998e-32  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.472166 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1641  transcription activator effector binding protein  31.19 
 
 
287 aa  137  2e-31  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3627  DNA gyrase inhibitor  30.61 
 
 
300 aa  135  7.000000000000001e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000240584  hitchhiker  0.00747313 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0540  transcriptional regulator, AraC family  29.97 
 
 
289 aa  135  9e-31  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.516999  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0019  transcriptional regulator, AraC family  28.04 
 
 
314 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3099  AraC family transcriptional regulator  27.86 
 
 
326 aa  133  3e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1224  AraC family transcriptional regulator  31.44 
 
 
288 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0494811  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2167  transcriptional regulator, AraC family  27.52 
 
 
283 aa  127  3e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.273156  normal  0.0865176 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1956  transcriptional regulator, AraC family  27.27 
 
 
283 aa  125  8.000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0993473  normal  0.479782 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001047  transcriptional regulator AraC family  29.29 
 
 
299 aa  125  9e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1217  transcription activator, effector binding  30.34 
 
 
288 aa  122  7e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2173  AraC family transcriptional regulator  27.96 
 
 
289 aa  120  3e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.671765  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3161  AraC family transcriptional regulator  29.69 
 
 
277 aa  118  9.999999999999999e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7295  AraC family transcriptional regulator  26.74 
 
 
277 aa  115  7.999999999999999e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.158014  normal  0.567517 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0028  transcriptional regulator, AraC family  27.87 
 
 
279 aa  115  8.999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0034  transcriptional regulator, AraC family  28.07 
 
 
279 aa  115  1.0000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.255751 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3564  AraC family transcriptional regulator  27.55 
 
 
279 aa  114  3e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.236142  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0946  transcriptional regulator, AraC family  27.43 
 
 
286 aa  113  4.0000000000000004e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.584518  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1774  AraC family transcriptional regulator  28.19 
 
 
289 aa  112  6e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.524324  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3306  AraC family transcriptional regulator  26.26 
 
 
292 aa  112  6e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000611  AraC-type DNA-binding domain-containing protein  28.14 
 
 
289 aa  112  8.000000000000001e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0208776  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0853  transcriptional regulator, AraC family  30.59 
 
 
284 aa  112  1.0000000000000001e-23  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0132  transcription regulator protein  29.2 
 
 
265 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0371  AraC family transcriptional regulator  26.97 
 
 
288 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4046  AraC family transcriptional regulator  27.96 
 
 
289 aa  110  3e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2929  AraC family transcriptional regulator  25.78 
 
 
293 aa  110  3e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0126  AraC family transcriptional regulator  25.78 
 
 
293 aa  110  3e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.436666  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0140  AraC family transcriptional regulator  25.78 
 
 
293 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.877598  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3526  transcription activator, effector binding  28.57 
 
 
288 aa  109  6e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06471  hypothetical protein  27.8 
 
 
289 aa  108  1e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0077  HTH-type transcriptional regulator, AraC-family  27.15 
 
 
289 aa  107  2e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3425  transcription activator, effector binding  29.11 
 
 
288 aa  107  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4381  transcription activator effector binding  29.63 
 
 
286 aa  107  2e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.134609  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2158  AraC family transcriptional regulator  26.77 
 
 
294 aa  106  5e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3431  transcription activator, effector binding  29.11 
 
 
288 aa  105  7e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS03191  transcription regulator protein  24.83 
 
 
310 aa  105  9e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3356  transcription activator, effector binding  28.77 
 
 
288 aa  103  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1474  transcriptional regulator, AraC family  28.91 
 
 
286 aa  103  4e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0076  transcription activator, effector binding  27.52 
 
 
288 aa  102  9e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1576  transcriptional regulator, AraC family  40 
 
 
436 aa  100  3e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3013  transcription activator, effector binding  28.33 
 
 
289 aa  100  3e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2678  transcriptional regulator, AraC family  25.93 
 
 
284 aa  99.8  4e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5359  transcriptional regulator, AraC family  24.84 
 
 
297 aa  99.4  6e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.6789  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06300  methylphosphotriester-DNA alkyltransferase  29.19 
 
 
302 aa  99.8  6e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1644  transcriptional regulator, AraC family  24.75 
 
 
293 aa  99.4  7e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0930139  normal  0.386203 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1354  AraC family transcriptional regulator  24.41 
 
 
293 aa  95.5  9e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.558119  normal  0.215319 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1398  AraC family transcriptional regulator  27.02 
 
 
296 aa  95.5  1e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.584508  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1216  AraC family transcriptional regulator  27.18 
 
 
300 aa  94.4  2e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6041  transcriptional regulator, AraC family  47.52 
 
 
303 aa  94.4  2e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.331066 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1170  transcriptional regulator, AraC family  25.82 
 
 
300 aa  93.2  4e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00906983  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1013  AraC family transcriptional regulator  26.69 
 
 
300 aa  93.6  4e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.126228  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1036  AraC family transcriptional regulator  26.69 
 
 
300 aa  93.2  5e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.139629  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1114  AraC family transcriptional regulator  26.69 
 
 
300 aa  93.2  5e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2274  AraC family transcriptional regulator  47.52 
 
 
307 aa  93.2  5e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.348217  normal  0.470943 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1271  transcriptional regulator, AraC family  26.86 
 
 
300 aa  93.2  5e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.121916  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1014  AraC family transcriptional regulator  26.54 
 
 
300 aa  92.8  6e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.210728  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1194  transcriptional regulator, AraC family  26.69 
 
 
300 aa  92.4  8e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.926126 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0990  AraC family transcriptional regulator  25.74 
 
 
281 aa  92  1e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4171  transcriptional regulator, AraC family  25.16 
 
 
300 aa  91.3  2e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1021  AraC family transcriptional regulator  25.32 
 
 
300 aa  90.5  3e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0621  AraC family transcriptional regulator  23.28 
 
 
291 aa  87.8  2e-16  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003322  hypothetical protein  25.67 
 
 
310 aa  87.8  2e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.757084  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0205  transcriptional activator, AraC family  25.64 
 
 
281 aa  87  3e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000524418 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4566  transcriptional regulator, AraC family  24.5 
 
 
293 aa  87.4  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.683768 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1922  transcriptional regulator, AraC family  23 
 
 
291 aa  86.7  4e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.890213  normal  0.89853 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5265  transcriptional regulator, AraC family  25.67 
 
 
281 aa  85.5  9e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0223  transcriptional activator, AraC family  25 
 
 
281 aa  84.3  0.000000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000178737 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0009  helix-turn-helix domain-containing protein  24.43 
 
 
306 aa  84.3  0.000000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000070115 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6995  AraC/XylS family transcriptional regulator  32.56 
 
 
255 aa  84.3  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00467693 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2210  transcriptional regulator, AraC family  22.79 
 
 
291 aa  84  0.000000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2323  transcriptional regulator, AraC family  25.42 
 
 
289 aa  82.4  0.000000000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.614848  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0526  transcriptional regulator, AraC family  35.24 
 
 
129 aa  81.6  0.00000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000198595  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04745  transcriptional regulator  35.29 
 
 
255 aa  80.9  0.00000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1220  AraC family transcriptional regulator  36.63 
 
 
267 aa  80.9  0.00000000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.21436  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2556  AraC family transcriptional regulator  27.08 
 
 
290 aa  80.5  0.00000000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000000235949  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1549  transcriptional regulator, AraC family  36.63 
 
 
316 aa  79.7  0.00000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0143415  hitchhiker  0.00302933 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4138  AraC family transcriptional regulator  34.91 
 
 
311 aa  79.7  0.00000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0071  transcriptional regulator, AraC family  39.6 
 
 
308 aa  79.3  0.00000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.462194  normal  0.509071 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1472  AraC family transcriptional regulator  29.25 
 
 
294 aa  79  0.00000000000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.102681  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3983  transcriptional regulator, AraC family  26.13 
 
 
291 aa  79  0.00000000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2058  transcriptional regulator, AraC family  38.24 
 
 
286 aa  78.6  0.0000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4119  transcriptional regulator, AraC family  28.57 
 
 
262 aa  78.2  0.0000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.840918  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2759  AraC family transcriptional regulator  24.5 
 
 
292 aa  78.6  0.0000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2157  two component AraC family transcriptional regulator  43.01 
 
 
250 aa  78.2  0.0000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0322408 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5122  transcriptional regulator AraC family  34.31 
 
 
314 aa  77.4  0.0000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.962416  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0315  transcriptional regulator, AraC family  31.78 
 
 
168 aa  77.8  0.0000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>