More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_4119 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_4119  transcriptional regulator, AraC family  100 
 
 		 262 aa  514  1.0000000000000001e-145  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.840918  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6995  AraC/XylS family transcriptional regulator  53.56 
 
 		 255 aa  253  2.0000000000000002e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00467693 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2693  helix-turn-helix domain-containing protein  51.57 
 
 		 261 aa  230  2e-59  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.129803  normal  0.168058 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0560  AraC family transcriptional regulator  50.58 
 
 		 281 aa  224  8e-58  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000376127 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2090  AraC family transcriptional regulator  45.28 
 
 		 261 aa  195  6e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00753492 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4104  transcriptional regulator, AraC family  43.08 
 
 		 250 aa  167  2e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6355  transcriptional regulator, AraC family  38.89 
 
 		 265 aa  158  6e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0247335 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6374  transcriptional regulator, AraC family  39.61 
 
 		 255 aa  155  9e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.169212 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6385  transcriptional regulator, AraC family  38.43 
 
 		 256 aa  141  9.999999999999999e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00774423 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0874  AraC family transcriptional regulator  32.82 
 
 		 296 aa  125  6e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2180  helix-turn-helix domain-containing protein  34.52 
 
 		 281 aa  121  9.999999999999999e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.971115  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0872  AraC family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 292 aa  111  1.0000000000000001e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12670  DNA-binding domain-containing protein, AraC-type  34.4 
 
 		 250 aa  110  2.0000000000000002e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2175  AraC family transcriptional regulator  44.83 
 
 		 281 aa  102  6e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0644092  normal  0.0265794 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2057  helix-turn-helix domain-containing protein  43.12 
 
 		 291 aa  101  1e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0315  transcriptional regulator, AraC family  44.95 
 
 		 168 aa  100  2e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1650  AraC family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 316 aa  94.7  1e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0600  helix-turn-helix domain-containing protein  42.42 
 
 		 297 aa  90.9  2e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2634  AraC family transcriptional regulator  39 
 
 		 204 aa  88.2  1e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0610  helix-turn-helix domain-containing protein  37.5 
 
 		 305 aa  87.4  2e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2157  two component AraC family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 250 aa  84.7  0.000000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0322408 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3129  AraC family transcriptional regulator  40.21 
 
 		 299 aa  85.1  0.000000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2736  AraC family transcriptional regulator  40.21 
 
 		 154 aa  83.6  0.000000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.66637 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3628  transcriptional regulator, AraC family  40.43 
 
 		 156 aa  83.2  0.000000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2274  AraC family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 307 aa  82.8  0.000000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.348217  normal  0.470943 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6041  transcriptional regulator, AraC family  37.96 
 
 		 303 aa  82.8  0.000000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.331066 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2469  AraC family transcriptional regulator  39.58 
 
 		 361 aa  81.6  0.00000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3417  AraC family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 299 aa  80.9  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.138414  normal  0.441033 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3740  helix-turn-helix domain-containing protein  39.18 
 
 		 301 aa  80.1  0.00000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.436963  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4744  transcriptional regulator, AraC family  41.24 
 
 		 157 aa  79.7  0.00000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.235772  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3361  helix-turn-helix domain-containing protein  37.59 
 
 		 160 aa  79.7  0.00000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1189  AraC family transcriptional regulator  37.68 
 
 		 550 aa  79.7  0.00000000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.459992  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3702  transcriptional regulator, AraC type  29.44 
 
 		 308 aa  79.7  0.00000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0013  AraC family transcriptional regulator  37.06 
 
 		 485 aa  79  0.00000000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.344073  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1151  AraC family transcriptional regulator  37.68 
 
 		 342 aa  79  0.00000000000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0648007  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3053  transcriptional regulator, AraC family  28.57 
 
 		 296 aa  78.2  0.0000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0149  AraC family transcriptional regulator  37.96 
 
 		 331 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.511163  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0427  AraC family transcriptional regulator  37.96 
 
 		 331 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.459699  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1411  AraC family transcriptional regulator  37.32 
 
 		 337 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.439169  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2986  transcriptional regulator, AraC family  42.71 
 
 		 148 aa  77.8  0.0000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2707  transcriptional regulator, AraC family  42.72 
 
 		 150 aa  77.4  0.0000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.766259  normal  0.0137536 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2836  AraC family transcriptional regulator  24.12 
 
 		 296 aa  76.6  0.0000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00254989  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1365  AraC family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 353 aa  76.3  0.0000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.122979  normal  0.036458 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2326  transcriptional regulator, AraC family  37.37 
 
 		 295 aa  75.9  0.0000000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0937352 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6955  transcriptional regulator, AraC family  35.05 
 
 		 346 aa  75.9  0.0000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.737934  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1497  AraC family transcription regulator  36.62 
 
 		 337 aa  75.9  0.0000000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.141505  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3159  AraC family transcriptional regulator  33.71 
 
 		 296 aa  74.7  0.000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2413  transcriptional regulator, AraC family  38.14 
 
 		 322 aa  75.1  0.000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.333457  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0071  transcriptional regulator, AraC family  29.9 
 
 		 308 aa  74.7  0.000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.462194  normal  0.509071 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3170  transcriptional regulator, AraC family  32.04 
 
 		 332 aa  74.3  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.777646  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3186  AraC family transcriptional regulator  31.31 
 
 		 333 aa  73.9  0.000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3232  transcriptional regulator, AraC family  38.95 
 
 		 296 aa  73.9  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0599312  hitchhiker  0.0000105754 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0540  transcriptional regulator, AraC family  32 
 
 		 289 aa  73.9  0.000000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.516999  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3482  AraC family transcriptional regulator  32.32 
 
 		 299 aa  73.6  0.000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.675068  normal  0.589184 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0224  response regulator receiver protein  29.52 
 
 		 537 aa  73.6  0.000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4236  transcriptional regulator, AraC family  32.71 
 
 		 325 aa  73.6  0.000000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1111  transcriptional regulator, AraC family  33.33 
 
 		 312 aa  73.2  0.000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2327  transcriptional regulator  33.33 
 
 		 316 aa  73.2  0.000000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.223293  normal  0.02817 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5215  helix-turn-helix domain-containing protein  34.02 
 
 		 331 aa  72.4  0.000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4139  ThiJ/PfpI domain protein  33.33 
 
 		 321 aa  72.8  0.000000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1528  AraC family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 284 aa  72.4  0.000000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2193  transcriptional regulator, AraC family  26.43 
 
 		 296 aa  72.4  0.000000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000412725 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2337  AraC family transcriptional regulator  38.14 
 
 		 289 aa  72.4  0.000000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000580503  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1399  transcriptional regulator, AraC family  39 
 
 		 158 aa  71.6  0.00000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0971  AraC family transcriptional regulator  31.31 
 
 		 136 aa  71.2  0.00000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000205729  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2507  transcriptional regulator, AraC family  35.05 
 
 		 291 aa  71.2  0.00000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1472  AraC family transcriptional regulator  34 
 
 		 292 aa  71.6  0.00000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.327977  normal  0.780269 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2463  transcriptional regulator, AraC family  33.02 
 
 		 162 aa  71.6  0.00000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.400735  normal  0.926275 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0659  AraC family transcriptional regulator  35.87 
 
 		 290 aa  71.2  0.00000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2776  AraC family transcriptional regulator  22.17 
 
 		 296 aa  70.9  0.00000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1958  response regulator receiver protein  26.73 
 
 		 530 aa  71.2  0.00000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000471781  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4617  transcriptional regulator, AraC family  36.84 
 
 		 296 aa  71.2  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.107807 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1711  transcriptional regulator, AraC family  32.69 
 
 		 307 aa  70.9  0.00000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.78026  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2058  transcriptional regulator, AraC family  26.73 
 
 		 286 aa  70.9  0.00000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1543  transcriptional regulator, AraC family  33.67 
 
 		 300 aa  71.2  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3335  AraC family transcriptional regulator  39.05 
 
 		 150 aa  71.2  0.00000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.602589  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3086  transcriptional regulator, AraC family  26.43 
 
 		 296 aa  70.9  0.00000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.164604  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3397  AraC family transcriptional regulator  39.05 
 
 		 150 aa  71.2  0.00000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.287817 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0516  PAS sensor protein  35.42 
 
 		 255 aa  70.9  0.00000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3346  AraC family transcriptional regulator  39.05 
 
 		 150 aa  71.2  0.00000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.143712  normal  0.196941 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0798  AraC family transcriptional regulator  34.02 
 
 		 311 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1482  transcriptional regulator, AraC family  30.91 
 
 		 345 aa  70.5  0.00000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2914  methylphosphotriester-DNA alkyltransferase  31.73 
 
 		 198 aa  70.1  0.00000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.431589  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7439  transcriptional regulator, AraC family  38.3 
 
 		 291 aa  70.5  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.753701 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2899  helix-turn-helix domain-containing protein  40.62 
 
 		 140 aa  70.1  0.00000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.555623  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3983  transcriptional regulator, AraC family  32.67 
 
 		 291 aa  70.5  0.00000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4258  AraC family transcriptional regulator  34.02 
 
 		 327 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1284  AraC family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 168 aa  70.5  0.00000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2691  DNA-O6-methylguanine--protein-cysteine S-methyltransferase / transcriptional regulator Ada  32.67 
 
 		 297 aa  70.1  0.00000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0276  helix-turn-helix domain-containing protein  36.08 
 
 		 291 aa  70.5  0.00000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0415  AraC family transcriptional regulator  35.58 
 
 		 288 aa  70.1  0.00000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.547266  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0347  AraC family transcriptional regulator  35.58 
 
 		 288 aa  70.1  0.00000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3042  putative transcriptional regulator, AraC family, isolated domain protein  38.68 
 
 		 141 aa  69.7  0.00000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.319564  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3869  AraC family transcriptional regulator  31.96 
 
 		 304 aa  69.7  0.00000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3069  transcriptional regulator, AraC family  22.17 
 
 		 296 aa  69.7  0.00000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0345  AraC family transcriptional regulator  34.02 
 
 		 311 aa  69.7  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0829  AraC family transcriptional regulator  34.02 
 
 		 311 aa  69.7  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0210284  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2101  putative DNA-binding protein  29.09 
 
 		 286 aa  69.7  0.00000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.326102  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3221  transcriptional regulator, AraC family  31.73 
 
 		 198 aa  70.1  0.00000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06300  methylphosphotriester-DNA alkyltransferase  27.54 
 
 		 302 aa  69.7  0.00000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>