More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcryo_1220 on replicon NC_007969
Organism: Psychrobacter cryohalolentis K5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007969  Pcryo_1220  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 
267 aa  551  1e-156  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.21436  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4602  AraC family transcriptional regulator  43.2 
 
 
279 aa  227  2e-58  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0287774  normal  0.364439 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1287  AraC family transcriptional regulator  43.2 
 
 
260 aa  226  3e-58  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.400393 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4131  AraC family transcriptional regulator  42.86 
 
 
260 aa  221  9e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.696726  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2310  AraC family transcriptional regulator  41.27 
 
 
256 aa  217  1e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.141971  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4130  putative transcriptional regulator  42.86 
 
 
265 aa  202  3e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1839  AraC family transcriptional regulator  41.99 
 
 
281 aa  198  7.999999999999999e-50  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47910  putative transcriptional regulator  42.27 
 
 
224 aa  195  6e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00926121  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4671  AraC family transcriptional regulator  40 
 
 
279 aa  189  5.999999999999999e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3416  AraC family transcriptional regulator  39.66 
 
 
279 aa  189  5.999999999999999e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0904858  normal  0.667905 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0878  AraC family transcriptional regulator  40.09 
 
 
256 aa  188  7e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.776666  normal  0.396396 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4563  transcriptional regulator, AraC family  40.09 
 
 
255 aa  188  7e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0238722  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0341  AraC family transcriptional regulator  39.22 
 
 
264 aa  187  1e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.729431 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2063  AraC family transcriptional regulator  37.5 
 
 
311 aa  188  1e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5196  AraC family transcriptional regulator  39.66 
 
 
264 aa  187  1e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.82206  normal  0.599062 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4668  AraC family transcriptional regulator  39.66 
 
 
264 aa  187  1e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.622787 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3060  AraC family transcriptional regulator  39.66 
 
 
264 aa  187  2e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4961  AraC family transcriptional regulator  39.66 
 
 
264 aa  187  2e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0263791 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5307  AraC family transcriptional regulator  39.66 
 
 
264 aa  187  2e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0914956 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1415  AraC family transcriptional regulator  37.5 
 
 
290 aa  186  3e-46  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.172682  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0477  AraC family transcriptional regulator  37.5 
 
 
290 aa  186  3e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.555067  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1891  AraC family transcriptional regulator  37.5 
 
 
294 aa  186  3e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0885  AraC family transcriptional regulator  37.5 
 
 
290 aa  186  3e-46  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2199  AraC family transcriptional regulator  37.5 
 
 
290 aa  186  3e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0574  AraC family transcriptional regulator  37.5 
 
 
290 aa  186  3e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.389496  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2498  AraC family transcriptional regulator  38.43 
 
 
245 aa  174  1.9999999999999998e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01433  transcriptional regulator  37.56 
 
 
242 aa  155  8e-37  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.738294  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3003  transcriptional regulator, AraC family  35.29 
 
 
240 aa  150  2e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00723875 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02106  transcriptional regulator AraC/xylS family  37.22 
 
 
241 aa  149  3e-35  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1669  PAS fold-4 domain protein  31.11 
 
 
261 aa  132  7.999999999999999e-30  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0361  AraC family transcriptional regulator  31.3 
 
 
245 aa  128  1.0000000000000001e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1157  AraC family transcriptional regulator  30.92 
 
 
248 aa  126  3e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2851  transcriptional regulator with PAS/PAC sensors, AraC family  31.76 
 
 
256 aa  116  3.9999999999999997e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.595855 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0516  PAS sensor protein  24.89 
 
 
255 aa  110  2.0000000000000002e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3088  AraC family transcriptional regulator  36.36 
 
 
296 aa  83.2  0.000000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.530109  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3053  transcriptional regulator, AraC family  36.63 
 
 
296 aa  80.9  0.00000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0540  transcriptional regulator, AraC family  37.37 
 
 
289 aa  79.7  0.00000000000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.516999  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3086  transcriptional regulator, AraC family  36 
 
 
296 aa  79.7  0.00000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.164604  n/a   
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4172  AraC family transcriptional regulator  38.46 
 
 
295 aa  78.6  0.0000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0833223  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3170  transcriptional regulator, AraC family  31 
 
 
332 aa  77.8  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.777646  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1100  AraC family transcriptional regulator  34.68 
 
 
334 aa  77.8  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0397278 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2799  AraC family transcriptional regulator  41.05 
 
 
365 aa  77  0.0000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.469303  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1330  transcriptional regulator, AraC family  29.31 
 
 
326 aa  77  0.0000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.521973  normal  0.989615 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1365  AraC family transcriptional regulator  35.64 
 
 
353 aa  76.6  0.0000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.122979  normal  0.036458 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1148  transcriptional regulator, AraC family  35 
 
 
309 aa  75.9  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2922  transcriptional regulator  33.87 
 
 
337 aa  75.9  0.0000000000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1567  AraC family transcriptional regulator  33.87 
 
 
337 aa  75.9  0.0000000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.226821  normal  0.377129 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2872  AraC family transcriptional regulator  33.67 
 
 
259 aa  75.9  0.0000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.895019 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2672  AraC family transcriptional regulator  34.07 
 
 
270 aa  75.5  0.0000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2664  AraC family transcriptional regulator  38.61 
 
 
368 aa  75.5  0.0000000000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0165303  normal  0.567946 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2843  AraC family transcriptional regulator  34 
 
 
296 aa  74.7  0.000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.538425  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2390  AraC family transcriptional regulator  31.37 
 
 
196 aa  75.1  0.000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.245348  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3069  transcriptional regulator, AraC family  33.66 
 
 
296 aa  74.7  0.000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3057  AraC family transcriptional regulator  34 
 
 
296 aa  74.7  0.000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.118978  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2765  transcriptional regulator, AraC family  35.16 
 
 
270 aa  74.7  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0588178  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1004  AraC family transcriptional regulator  46.59 
 
 
351 aa  73.9  0.000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.429935  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1268  transcriptional regulator, AraC family  36.46 
 
 
300 aa  73.9  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2193  transcriptional regulator, AraC family  33.66 
 
 
296 aa  74.3  0.000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000412725 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0773  AraC family transcriptional regulator  40.21 
 
 
237 aa  74.3  0.000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1549  transcriptional regulator, AraC family  30.77 
 
 
316 aa  73.6  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0143415  hitchhiker  0.00302933 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1252  AraC family transcriptional regulator  23.21 
 
 
388 aa  73.6  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00385086 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0276  helix-turn-helix domain-containing protein  34.69 
 
 
291 aa  73.2  0.000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01004  Transcriptional regulator containing an amidase domain and an AraC-type DNA-binding HTH domain  35.51 
 
 
329 aa  73.2  0.000000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0283206  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6068  AraC family transcriptional regulator  36 
 
 
287 aa  72.8  0.000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3702  transcriptional regulator, AraC type  33.04 
 
 
308 aa  72.8  0.000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42360  transcriptional regulator, AraC family  37.36 
 
 
318 aa  72.8  0.000000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0071  transcriptional regulator, AraC family  34.69 
 
 
308 aa  72.8  0.000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.462194  normal  0.509071 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2157  two component AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 
250 aa  72.4  0.000000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0322408 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2236  AraC family transcriptional regulator  37.11 
 
 
272 aa  72.8  0.000000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2340  helix-turn-helix domain-containing protein  36.27 
 
 
290 aa  72.8  0.000000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.581264  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6833  transcriptional regulator, AraC family  32.65 
 
 
259 aa  72.4  0.000000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.540277 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2816  AraC family transcriptional regulator  34.02 
 
 
296 aa  72.4  0.000000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2776  AraC family transcriptional regulator  34.38 
 
 
296 aa  72.4  0.000000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3467  AraC family transcriptional regulator  39.18 
 
 
323 aa  72.4  0.000000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3740  helix-turn-helix domain-containing protein  40.45 
 
 
301 aa  72.4  0.000000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.436963  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1853  transcriptional regulator, AraC family  34.86 
 
 
294 aa  72  0.000000000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.801816 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1318  AraC family transcriptional regulator  34.02 
 
 
294 aa  72.4  0.000000000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.761239  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1980  AraC family transcriptional regulator  35.71 
 
 
293 aa  72.4  0.000000000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.949603 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3933  AraC family transcriptional regulator  32.8 
 
 
337 aa  72.4  0.000000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1525  HTH-type transcriptional regulator  32.03 
 
 
339 aa  72.4  0.000000000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.199497 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1596  transcriptional regulator, AraC family  30 
 
 
287 aa  72  0.000000000009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5122  transcriptional regulator AraC family  29.09 
 
 
314 aa  72  0.00000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.962416  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1163  AraC-type transcriptional regulator domain protein  37.08 
 
 
300 aa  72  0.00000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.0000040891  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2858  transcriptional regulator, AraC family  36.47 
 
 
270 aa  71.6  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.141433  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2444  transcriptional regulator  32.03 
 
 
331 aa  71.6  0.00000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0668048  hitchhiker  0.000772272 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2356  transcriptional regulator, AraC family  33.65 
 
 
296 aa  72  0.00000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1270  transcriptional regulator  33.88 
 
 
334 aa  71.2  0.00000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.314543  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2723  transcriptional regulator, AraC family  40 
 
 
331 aa  71.6  0.00000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.844059  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1435  AraC family transcriptional regulator  35 
 
 
324 aa  70.9  0.00000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1399  helix-turn-helix domain-containing protein  35 
 
 
324 aa  71.2  0.00000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.953379  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9084  transcriptional regulator AraC family  37.76 
 
 
315 aa  70.9  0.00000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4230  transcriptional regulator, AraC family  34.44 
 
 
363 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5544  transcriptional regulator, AraC family  39 
 
 
463 aa  70.9  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.258636  normal  0.142482 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2634  AraC family transcriptional regulator  27.73 
 
 
204 aa  71.2  0.00000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2946  transcriptional regulator, AraC family  35 
 
 
324 aa  70.9  0.00000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1408  helix-turn-helix domain-containing protein  35 
 
 
324 aa  70.9  0.00000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4236  AraC family transcriptional regulator  38.04 
 
 
285 aa  70.9  0.00000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.457979 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1687  AraC family transcriptional regulator  32.5 
 
 
345 aa  70.9  0.00000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0447832  normal  0.915417 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4587  AraC family transcriptional regulator  29.86 
 
 
291 aa  70.9  0.00000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.213128  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0359  transcriptional regulator, AraC family  34.82 
 
 
405 aa  70.1  0.00000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.524425  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>