More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GBAA_3057 on replicon NC_007530
Organism: Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_005945  BAS2843  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 
296 aa  616  1e-175  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.538425  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3057  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 
296 aa  616  1e-175  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.118978  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2816  AraC family transcriptional regulator  98.31 
 
 
296 aa  604  9.999999999999999e-173  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3069  transcriptional regulator, AraC family  97.3 
 
 
296 aa  600  1.0000000000000001e-171  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2776  AraC family transcriptional regulator  93.92 
 
 
296 aa  582  1.0000000000000001e-165  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3088  AraC family transcriptional regulator  90.88 
 
 
296 aa  566  1e-160  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.530109  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2193  transcriptional regulator, AraC family  89.53 
 
 
296 aa  559  1e-158  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000412725 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3053  transcriptional regulator, AraC family  89.86 
 
 
296 aa  553  1e-157  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3086  transcriptional regulator, AraC family  88.85 
 
 
296 aa  552  1e-156  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.164604  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2836  AraC family transcriptional regulator  85.14 
 
 
296 aa  538  9.999999999999999e-153  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00254989  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2703  transcription activator, effector binding  27.25 
 
 
326 aa  148  1.0000000000000001e-34  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.268178 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0771  AraC family transcriptional regulator  28.62 
 
 
288 aa  144  2e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.472166 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1641  transcription activator effector binding protein  30.85 
 
 
287 aa  142  6e-33  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3953  AraC family transcriptional regulator  30.99 
 
 
287 aa  142  7e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0509927  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3503  transcription activator, effector binding  30.93 
 
 
294 aa  142  9e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00111619  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3702  transcriptional regulator, AraC type  28.81 
 
 
308 aa  139  6e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0019  transcriptional regulator, AraC family  28.38 
 
 
314 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2167  transcriptional regulator, AraC family  27.27 
 
 
283 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.273156  normal  0.0865176 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3099  AraC family transcriptional regulator  26.71 
 
 
326 aa  133  3.9999999999999996e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3627  DNA gyrase inhibitor  29.93 
 
 
300 aa  132  5e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000240584  hitchhiker  0.00747313 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1956  transcriptional regulator, AraC family  27.85 
 
 
283 aa  132  6e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0993473  normal  0.479782 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0540  transcriptional regulator, AraC family  29.17 
 
 
289 aa  131  1.0000000000000001e-29  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.516999  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001047  transcriptional regulator AraC family  29.47 
 
 
299 aa  130  2.0000000000000002e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1217  transcription activator, effector binding  30.03 
 
 
288 aa  128  1.0000000000000001e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1224  AraC family transcriptional regulator  29.24 
 
 
288 aa  126  4.0000000000000003e-28  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0494811  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2173  AraC family transcriptional regulator  27.61 
 
 
289 aa  122  7e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.671765  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3161  AraC family transcriptional regulator  28.62 
 
 
277 aa  121  9.999999999999999e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0034  transcriptional regulator, AraC family  27.92 
 
 
279 aa  120  1.9999999999999998e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.255751 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3526  transcription activator, effector binding  29.02 
 
 
288 aa  120  3.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0028  transcriptional regulator, AraC family  28.07 
 
 
279 aa  119  4.9999999999999996e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3425  transcription activator, effector binding  29.02 
 
 
288 aa  119  4.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3431  transcription activator, effector binding  29.02 
 
 
288 aa  117  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7295  AraC family transcriptional regulator  25.78 
 
 
277 aa  117  3e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.158014  normal  0.567517 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3306  AraC family transcriptional regulator  26.3 
 
 
292 aa  116  5e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0371  AraC family transcriptional regulator  27.61 
 
 
288 aa  116  5e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3564  AraC family transcriptional regulator  27.18 
 
 
279 aa  115  8.999999999999998e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.236142  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3356  transcription activator, effector binding  28.67 
 
 
288 aa  115  8.999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4381  transcription activator effector binding  28.23 
 
 
286 aa  115  8.999999999999998e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.134609  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2929  AraC family transcriptional regulator  25.61 
 
 
293 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0126  AraC family transcriptional regulator  25.61 
 
 
293 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.436666  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1774  AraC family transcriptional regulator  26.94 
 
 
289 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.524324  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0140  AraC family transcriptional regulator  25.61 
 
 
293 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.877598  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0853  transcriptional regulator, AraC family  31.03 
 
 
284 aa  114  2.0000000000000002e-24  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000611  AraC-type DNA-binding domain-containing protein  27.8 
 
 
289 aa  113  4.0000000000000004e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0208776  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0132  transcription regulator protein  28.31 
 
 
265 aa  112  6e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0077  HTH-type transcriptional regulator, AraC-family  27.21 
 
 
289 aa  109  4.0000000000000004e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1474  transcriptional regulator, AraC family  27.12 
 
 
286 aa  109  6e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06471  hypothetical protein  27.46 
 
 
289 aa  109  6e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4046  AraC family transcriptional regulator  26.76 
 
 
289 aa  108  1e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0946  transcriptional regulator, AraC family  26.39 
 
 
286 aa  108  1e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.584518  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3013  transcription activator, effector binding  28.67 
 
 
289 aa  105  1e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2158  AraC family transcriptional regulator  26.38 
 
 
294 aa  104  2e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0076  transcription activator, effector binding  24.91 
 
 
288 aa  102  7e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2678  transcriptional regulator, AraC family  26.76 
 
 
284 aa  101  2e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1354  AraC family transcriptional regulator  25.93 
 
 
293 aa  99.4  7e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.558119  normal  0.215319 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1644  transcriptional regulator, AraC family  24.03 
 
 
293 aa  99  9e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0930139  normal  0.386203 
 
 
-
 
NC_003296  RS03191  transcription regulator protein  24.83 
 
 
310 aa  97.1  3e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5359  transcriptional regulator, AraC family  24.1 
 
 
297 aa  96.7  5e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.6789  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1398  AraC family transcriptional regulator  25 
 
 
296 aa  96.7  5e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.584508  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0621  AraC family transcriptional regulator  24.01 
 
 
291 aa  94.7  1e-18  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2323  transcriptional regulator, AraC family  26.85 
 
 
289 aa  94  3e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.614848  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1922  transcriptional regulator, AraC family  25.91 
 
 
291 aa  92.8  6e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.890213  normal  0.89853 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1576  transcriptional regulator, AraC family  38.83 
 
 
436 aa  92.8  6e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4566  transcriptional regulator, AraC family  25 
 
 
293 aa  90.9  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.683768 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0205  transcriptional activator, AraC family  26.25 
 
 
281 aa  90.1  3e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000524418 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06300  methylphosphotriester-DNA alkyltransferase  25.33 
 
 
302 aa  90.1  4e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2210  transcriptional regulator, AraC family  25.42 
 
 
291 aa  87.4  3e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0990  AraC family transcriptional regulator  24.75 
 
 
281 aa  86.3  6e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5265  transcriptional regulator, AraC family  25.5 
 
 
281 aa  86.3  6e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2759  AraC family transcriptional regulator  25.08 
 
 
292 aa  85.1  0.000000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0223  transcriptional activator, AraC family  24.92 
 
 
281 aa  84.3  0.000000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000178737 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1216  AraC family transcriptional regulator  25.99 
 
 
300 aa  83.2  0.000000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1271  transcriptional regulator, AraC family  25.66 
 
 
300 aa  83.2  0.000000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.121916  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1194  transcriptional regulator, AraC family  25 
 
 
300 aa  81.6  0.00000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.926126 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1013  AraC family transcriptional regulator  25.89 
 
 
300 aa  82  0.00000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.126228  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1014  AraC family transcriptional regulator  25.73 
 
 
300 aa  81.6  0.00000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.210728  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1036  AraC family transcriptional regulator  25.89 
 
 
300 aa  81.3  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.139629  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6041  transcriptional regulator, AraC family  41.58 
 
 
303 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.331066 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1114  AraC family transcriptional regulator  25.89 
 
 
300 aa  81.3  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0937  transcriptional regulator, AraC family  39 
 
 
291 aa  81.3  0.00000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.127184  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4171  transcriptional regulator, AraC family  25.41 
 
 
300 aa  80.1  0.00000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2274  AraC family transcriptional regulator  41.58 
 
 
307 aa  80.1  0.00000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.348217  normal  0.470943 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1170  transcriptional regulator, AraC family  25.08 
 
 
300 aa  80.1  0.00000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00906983  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3983  transcriptional regulator, AraC family  26.87 
 
 
291 aa  79.7  0.00000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0009  helix-turn-helix domain-containing protein  23.45 
 
 
306 aa  79.3  0.00000000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000070115 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1528  AraC family transcriptional regulator  35.14 
 
 
284 aa  79  0.00000000000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3170  transcriptional regulator, AraC family  35.78 
 
 
332 aa  78.2  0.0000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.777646  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04745  transcriptional regulator  33.01 
 
 
255 aa  77  0.0000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1784  AraC family transcriptional regulator  23.94 
 
 
280 aa  77  0.0000000000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000275244  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1472  AraC family transcriptional regulator  28.57 
 
 
294 aa  76.6  0.0000000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.102681  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3181  AraC family transcriptional regulator  26.9 
 
 
292 aa  76.6  0.0000000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3203  transcriptional regulator  36.45 
 
 
343 aa  76.6  0.0000000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.123314  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3846  transcriptional regulator, AraC family  25.56 
 
 
287 aa  76.3  0.0000000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1021  AraC family transcriptional regulator  34.95 
 
 
300 aa  76.3  0.0000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3942  AraC family transcriptional regulator  36.45 
 
 
336 aa  76.3  0.0000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.466068  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0165  AraC family transcriptional regulator  26.52 
 
 
298 aa  76.3  0.0000000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3159  AraC family transcriptional regulator  35.71 
 
 
296 aa  75.9  0.0000000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5122  transcriptional regulator AraC family  33.33 
 
 
314 aa  75.5  0.000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.962416  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3104  response regulator receiver protein  33.33 
 
 
266 aa  75.1  0.000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1220  AraC family transcriptional regulator  34 
 
 
267 aa  74.7  0.000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.21436  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>