More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_3203 on replicon NC_007494
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009050  Rsph17029_3942  AraC family transcriptional regulator  99.4 
 
 		 336 aa  678    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.466068  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3203  transcriptional regulator  100 
 
 		 343 aa  696    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.123314  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1528  transcriptional regulator  45 
 
 		 335 aa  287  2e-76  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.755279  normal  0.310325 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1687  AraC family transcriptional regulator  42.35 
 
 		 345 aa  267  2e-70  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0447832  normal  0.915417 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2922  transcriptional regulator  42.81 
 
 		 337 aa  262  6.999999999999999e-69  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1567  AraC family transcriptional regulator  42.81 
 
 		 337 aa  262  6.999999999999999e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.226821  normal  0.377129 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1100  AraC family transcriptional regulator  42.81 
 
 		 334 aa  262  6.999999999999999e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0397278 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3578  AraC family transcriptional regulator  45.07 
 
 		 314 aa  258  1e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.54425 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3933  AraC family transcriptional regulator  40.73 
 
 		 337 aa  257  2e-67  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0829  transcriptional regulator  44.37 
 
 		 317 aa  252  6e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.351289 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5064  AraC family transcriptional regulator  44.74 
 
 		 314 aa  251  1e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5220  AraC family transcriptional regulator  44.74 
 
 		 314 aa  251  1e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.974611 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3303  AraC family transcriptional regulator  44.74 
 
 		 314 aa  251  1e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2444  transcriptional regulator  40.63 
 
 		 331 aa  250  3e-65  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0668048  hitchhiker  0.000772272 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1270  transcriptional regulator  39.55 
 
 		 334 aa  249  5e-65  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.314543  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4511  transcriptional regulator, AraC family  44.04 
 
 		 341 aa  247  2e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.88084  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0599  transcriptional regulator  45.07 
 
 		 326 aa  245  6.999999999999999e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.703076 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2126  AraC family transcriptional regulator  43.27 
 
 		 361 aa  245  9e-64  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1960  AraC family transcriptional regulator  43.27 
 
 		 314 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0692  AraC family transcriptional regulator  43.27 
 
 		 314 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0848  AraC family transcriptional regulator  43.27 
 
 		 361 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0759  AraC family transcriptional regulator  43.27 
 
 		 314 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1850  AraC family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 314 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.999636  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0988  AraC family transcriptional regulator  43.27 
 
 		 314 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0489  AraC family transcriptional regulator  43.27 
 
 		 336 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71170  AraC family transcriptional regulator  42.67 
 
 		 336 aa  243  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6176  putative transcriptional regulator  42.67 
 
 		 336 aa  243  3e-63  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4999  AraC family transcriptional regulator  44.08 
 
 		 314 aa  242  5e-63  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.258482  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3287  AraC family transcriptional regulator  42.05 
 
 		 331 aa  243  5e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.242748  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4474  AraC family transcriptional regulator  44.08 
 
 		 314 aa  242  5e-63  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0498  transcriptional regulator  39.87 
 
 		 316 aa  242  7e-63  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4903  AraC family transcriptional regulator  43.28 
 
 		 315 aa  237  2e-61  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.208419 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0305  AraC family transcriptional regulator  42.14 
 
 		 319 aa  236  4e-61  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00276318 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1865  AraC family transcriptional regulator  38.44 
 
 		 332 aa  236  4e-61  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0329  AraC family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 314 aa  235  8e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0325  AraC family transcriptional regulator  42.36 
 
 		 315 aa  235  8e-61  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.416285 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1794  AraC family transcriptional regulator  39.57 
 
 		 338 aa  234  1.0000000000000001e-60  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.112719  hitchhiker  0.00342809 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5229  transcriptional regulator  41.31 
 
 		 314 aa  233  3e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.35662  normal  0.0289181 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1525  HTH-type transcriptional regulator  40.2 
 
 		 339 aa  231  1e-59  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.199497 
 
 
-
 
NC_004310  BR1319  AraC family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 332 aa  230  3e-59  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2915  helix-turn-helix, AraC type:ThiJ/PfpI  40.97 
 
 		 325 aa  229  6e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.904255  normal  0.163293 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6166  putative transcriptional regulator  38.23 
 
 		 367 aa  228  8e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.165565  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71070  AraC family transcriptional regulator  38.23 
 
 		 367 aa  228  1e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2152  transcriptional regulator, AraC family  39.17 
 
 		 340 aa  227  2e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.49496 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0490  transcriptional regulator  39.8 
 
 		 364 aa  227  2e-58  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2406  transcriptional regulator, AraC family  39.3 
 
 		 339 aa  228  2e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0277312 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3394  transcriptional regulator, AraC family  40.57 
 
 		 334 aa  228  2e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4021  AraC family transcriptional regulator  37.46 
 
 		 353 aa  226  5.0000000000000005e-58  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.322888  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2590  transcriptional regulator AraC family  38.22 
 
 		 337 aa  225  7e-58  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0987  transcriptional regulator  39.53 
 
 		 375 aa  224  1e-57  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2367  AraC family transcriptional regulator  39.87 
 
 		 311 aa  224  2e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.923255  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3170  transcriptional regulator  39.87 
 
 		 327 aa  223  4.9999999999999996e-57  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1140  AraC family transcriptional regulator  40.53 
 
 		 322 aa  222  7e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0567003 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0298  AraC family transcriptional regulator  38.41 
 
 		 368 aa  221  9.999999999999999e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000218642 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0465  transcriptional regulator, AraC family  38.82 
 
 		 367 aa  221  9.999999999999999e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0318  AraC family transcriptional regulator  38.41 
 
 		 368 aa  221  9.999999999999999e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.120478 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0323  AraC family transcriptional regulator  38.41 
 
 		 368 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4910  AraC family transcriptional regulator  38.41 
 
 		 368 aa  220  3e-56  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00942326 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4708  helix-turn-helix, AraC type:ThiJ/PfpI  38.82 
 
 		 367 aa  219  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5236  transcriptional regulator  38.16 
 
 		 367 aa  218  1e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.59007  normal  0.0230056 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5747  transcriptional regulator AraC family  40.72 
 
 		 317 aa  217  2.9999999999999998e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.807364  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2664  AraC family transcriptional regulator  34.92 
 
 		 368 aa  216  2.9999999999999998e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0165303  normal  0.567946 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1950  transcriptional regulator  39.24 
 
 		 341 aa  215  7e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3312  AraC family transcriptional regulator  41.72 
 
 		 318 aa  215  7e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001535  transcriptional regulator AraC family  35.95 
 
 		 318 aa  214  1.9999999999999998e-54  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3997  transcriptional regulator  38.78 
 
 		 316 aa  213  4.9999999999999996e-54  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.564896  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2488  AraC family transcriptional regulator  38.11 
 
 		 344 aa  211  1e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3735  helix-turn-helix domain-containing protein  38.75 
 
 		 343 aa  211  1e-53  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.43988 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5636  transcriptional regulator, AraC family  39.68 
 
 		 319 aa  211  1e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4030  transcriptional regulator, AraC family  38.75 
 
 		 343 aa  211  2e-53  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.364388 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3290  AraC family transcriptional regulator  40.95 
 
 		 324 aa  210  3e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3487  AraC family transcriptional regulator  38.05 
 
 		 332 aa  210  4e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.1866 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0457  transcriptional regulator  37.74 
 
 		 332 aa  209  8e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.99008  normal  0.0292699 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5109  AraC family transcriptional regulator  37.74 
 
 		 332 aa  207  2e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.771046  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5090  AraC family transcriptional regulator  37.74 
 
 		 332 aa  207  2e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.893585 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4565  AraC family transcriptional regulator  37.74 
 
 		 332 aa  207  2e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.644708 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3197  AraC family transcriptional regulator  37.74 
 
 		 355 aa  207  2e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5170  AraC family transcriptional regulator  37.74 
 
 		 355 aa  207  2e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0119945  normal  0.398909 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4498  AraC family transcriptional regulator  38.85 
 
 		 340 aa  206  7e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02029  transcriptional regulator transcription regulator protein  37.25 
 
 		 343 aa  204  2e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.130887 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5023  AraC family transcriptional regulator  38.54 
 
 		 341 aa  204  2e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0570  transcriptional regulator  38.54 
 
 		 371 aa  203  3e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0968  AraC family transcriptional regulator  38.22 
 
 		 332 aa  203  4e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3990  transcriptional regulator, AraC family  38.64 
 
 		 344 aa  202  5e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1655  ThiJ/PfpI domain-containing protein  40.96 
 
 		 332 aa  202  5e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.491569  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5086  AraC family transcriptional regulator  38.34 
 
 		 371 aa  202  5e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.754601 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3282  AraC family transcriptional regulator  38.34 
 
 		 371 aa  202  5e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0448  AraC family transcriptional regulator  37.9 
 
 		 332 aa  202  6e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5199  AraC family transcriptional regulator  38.34 
 
 		 341 aa  202  6e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1931  AraC family transcriptional regulator  37.9 
 
 		 332 aa  202  6e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.746291  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0566  AraC family transcriptional regulator  37.9 
 
 		 332 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.207783  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2025  AraC family transcriptional regulator  37.9 
 
 		 332 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4893  AraC family transcriptional regulator  35.37 
 
 		 340 aa  201  9.999999999999999e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0901  AraC family transcriptional regulator  37.9 
 
 		 332 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1868  AraC family transcriptional regulator  37.9 
 
 		 332 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5062  transcriptional regulator, AraC family  37.97 
 
 		 331 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.652687  normal  0.0215007 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3545  AraC family transcriptional regulator  38.02 
 
 		 341 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1586  transcriptional regulator  37.66 
 
 		 333 aa  200  3e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4809  transcriptional regulator  36.5 
 
 		 331 aa  200  3.9999999999999996e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.193614  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02043  transcriptional regulator transcription regulator protein  35.9 
 
 		 334 aa  199  5e-50  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>