More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BCG9842_B4171 on replicon NC_011772
Organism: Bacillus cereus G9842



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011772  BCG9842_B4171  transcriptional regulator, AraC family  100 
 
 
300 aa  630  1e-180  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1170  transcriptional regulator, AraC family  99 
 
 
300 aa  627  1e-179  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00906983  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1014  AraC family transcriptional regulator  98.33 
 
 
300 aa  624  1e-178  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.210728  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1216  AraC family transcriptional regulator  97.33 
 
 
300 aa  617  1e-176  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1036  AraC family transcriptional regulator  97 
 
 
300 aa  616  1e-175  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.139629  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1013  AraC family transcriptional regulator  96.67 
 
 
300 aa  614  1e-175  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.126228  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1194  transcriptional regulator, AraC family  96.67 
 
 
300 aa  614  1e-175  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.926126 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1114  AraC family transcriptional regulator  97 
 
 
300 aa  616  1e-175  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1021  AraC family transcriptional regulator  96.67 
 
 
300 aa  616  1e-175  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1271  transcriptional regulator, AraC family  97.33 
 
 
300 aa  616  1e-175  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.121916  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0165  AraC family transcriptional regulator  34.75 
 
 
298 aa  179  5.999999999999999e-44  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6275  AraC family transcriptional regulator  32.32 
 
 
279 aa  155  6e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3983  transcriptional regulator, AraC family  30 
 
 
291 aa  149  7e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2797  transcription activator effector binding  31.67 
 
 
279 aa  146  4.0000000000000006e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.338998 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7157  transcriptional regulator, AraC family  31.51 
 
 
277 aa  144  2e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.367426 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0261  AraC family transcriptional regulator  30.1 
 
 
281 aa  144  2e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2107  AraC family transcriptional regulator  31.33 
 
 
313 aa  143  3e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.342925  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0011  transcriptional regulator, AraC family  30.77 
 
 
285 aa  143  4e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000871788  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3174  AraC family transcriptional regulator  31.97 
 
 
280 aa  142  5e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.626893  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2210  transcriptional regulator, AraC family  30.23 
 
 
291 aa  140  3e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1922  transcriptional regulator, AraC family  30.46 
 
 
291 aa  139  3.9999999999999997e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.890213  normal  0.89853 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2678  transcriptional regulator, AraC family  30.69 
 
 
284 aa  139  4.999999999999999e-32  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4986  AraC family transcriptional regulator  30.49 
 
 
290 aa  139  6e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4973  transcriptional regulator, AraC family  30.49 
 
 
290 aa  139  7.999999999999999e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4724  AraC family transcriptional regulator  30.46 
 
 
290 aa  138  1e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.440387  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5086  AraC family transcriptional regulator  30.46 
 
 
290 aa  138  1e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0424  transcriptional regulator, AraC family  31.65 
 
 
281 aa  136  3.0000000000000003e-31  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4947  transcriptional regulator, AraC family  30.46 
 
 
290 aa  136  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4582  AraC family transcriptional regulator  30.13 
 
 
290 aa  136  4e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.763033  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1784  AraC family transcriptional regulator  31.1 
 
 
280 aa  134  1.9999999999999998e-30  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000275244  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2556  AraC family transcriptional regulator  29.63 
 
 
290 aa  134  1.9999999999999998e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000000235949  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4672  AraC family transcriptional regulator  29.61 
 
 
290 aa  133  3e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3846  transcriptional regulator, AraC family  29.87 
 
 
287 aa  134  3e-30  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0278  transcriptional regulator, AraC family  29.14 
 
 
290 aa  134  3e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4957  transcriptional regulator, AraC family  29.22 
 
 
290 aa  133  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3715  transcriptional regulator, AraC family  30.07 
 
 
279 aa  132  5e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.424878 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4566  AraC family transcriptional regulator  29.47 
 
 
290 aa  132  6e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.017881  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1790  transcriptional regulator, AraC family  29.29 
 
 
282 aa  132  6.999999999999999e-30  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.191731  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3417  transcriptional regulator, AraC family  30.41 
 
 
279 aa  131  1.0000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.27768  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4053  AraC family transcriptional regulator  29.55 
 
 
277 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5265  transcriptional regulator, AraC family  28.62 
 
 
281 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0223  transcriptional activator, AraC family  27.51 
 
 
281 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000178737 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0205  transcriptional activator, AraC family  28.16 
 
 
281 aa  127  3e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000524418 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0990  AraC family transcriptional regulator  28.66 
 
 
281 aa  126  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2759  AraC family transcriptional regulator  29.33 
 
 
292 aa  123  3e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2938  AraC family transcriptional regulator  28.52 
 
 
279 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.487848  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2251  transcriptional regulator, AraC family  30.52 
 
 
287 aa  121  1.9999999999999998e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3264  transcriptional regulator, AraC family  26.69 
 
 
287 aa  120  3.9999999999999996e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3138  AraC family transcriptional regulator  29.77 
 
 
281 aa  119  6e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3181  AraC family transcriptional regulator  27.54 
 
 
292 aa  119  7.999999999999999e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1952  AraC family transcriptional regulator  30.54 
 
 
271 aa  119  7.999999999999999e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0598764  normal  0.641899 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3142  AraC family transcriptional regulator  29.22 
 
 
301 aa  119  9e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2323  transcriptional regulator, AraC family  26.47 
 
 
289 aa  118  9.999999999999999e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.614848  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3503  transcription activator, effector binding  29.1 
 
 
294 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00111619  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1802  transcriptional regulator, AraC family  29.24 
 
 
286 aa  116  3.9999999999999997e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3564  transcriptional regulator, AraC family  27.12 
 
 
285 aa  113  3e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2780  transcriptional regulator, AraC family  26.16 
 
 
285 aa  111  2.0000000000000002e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0531003  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06300  methylphosphotriester-DNA alkyltransferase  27.96 
 
 
302 aa  110  3e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000611  AraC-type DNA-binding domain-containing protein  26.23 
 
 
289 aa  107  2e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0208776  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003322  hypothetical protein  27.27 
 
 
310 aa  107  2e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.757084  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0077  HTH-type transcriptional regulator, AraC-family  25.41 
 
 
289 aa  107  3e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3702  transcriptional regulator, AraC type  25.25 
 
 
308 aa  106  5e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1472  AraC family transcriptional regulator  24.83 
 
 
294 aa  106  6e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.102681  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1127  transcriptional regulator, AraC family  26.23 
 
 
288 aa  105  6e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06471  hypothetical protein  26.23 
 
 
289 aa  105  7e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0216  transcriptional regulator, AraC family  48.57 
 
 
299 aa  104  2e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2127  transcription activator effector binding protein  29.28 
 
 
290 aa  104  2e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0771  AraC family transcriptional regulator  27.42 
 
 
288 aa  103  3e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.472166 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0329  transcription activator effector binding protein  26.89 
 
 
288 aa  103  3e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0236652  normal  0.0105288 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0176  AraC family transcriptional regulator  47.62 
 
 
299 aa  103  4e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0192  AraC family transcriptional regulator  46.67 
 
 
299 aa  102  5e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0179  AraC family transcriptional regulator  46.67 
 
 
299 aa  102  5e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0147136  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0211  transcriptional regulator, AraC family  46.67 
 
 
299 aa  102  5e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0191  AraC family transcriptional regulator  46.67 
 
 
299 aa  102  5e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0182  AraC family transcriptional regulator  46.67 
 
 
299 aa  102  1e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1576  transcriptional regulator, AraC family  45.37 
 
 
436 aa  100  4e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0853  transcriptional regulator, AraC family  27.5 
 
 
284 aa  98.6  1e-19  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0371  AraC family transcriptional regulator  30.24 
 
 
288 aa  97.4  2e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1474  transcriptional regulator, AraC family  29.08 
 
 
286 aa  97.1  4e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3099  AraC family transcriptional regulator  28.27 
 
 
326 aa  95.9  7e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1217  transcription activator, effector binding  28.21 
 
 
288 aa  94  3e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0009  helix-turn-helix domain-containing protein  26.6 
 
 
306 aa  93.2  4e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000070115 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2158  AraC family transcriptional regulator  28.17 
 
 
294 aa  92.8  5e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04745  transcriptional regulator  37.96 
 
 
255 aa  92.8  7e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0186  transcriptional regulator, AraC family  44.34 
 
 
452 aa  92.8  7e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0526  transcriptional regulator, AraC family  38.83 
 
 
129 aa  92.4  8e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000198595  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5359  transcriptional regulator, AraC family  25.82 
 
 
297 aa  91.7  1e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.6789  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1266  AraC family transcriptional regulator  27.96 
 
 
300 aa  92  1e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.23796  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3086  transcriptional regulator, AraC family  25.08 
 
 
296 aa  92  1e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.164604  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1798  transcriptional regulator, AraC family  30.12 
 
 
200 aa  91.3  2e-17  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3053  transcriptional regulator, AraC family  25.16 
 
 
296 aa  91.3  2e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2173  AraC family transcriptional regulator  29.47 
 
 
289 aa  90.5  3e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.671765  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0137  AraC family transcriptional regulator  34.23 
 
 
315 aa  89.7  5e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.10009 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1683  AraC family transcriptional regulator  34.94 
 
 
221 aa  89.7  5e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3564  AraC family transcriptional regulator  29.61 
 
 
279 aa  89.7  5e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.236142  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0910  HTH-type transcription regulator, AraC-family  27.94 
 
 
298 aa  89.4  6e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.576456  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2836  AraC family transcriptional regulator  24.1 
 
 
296 aa  89.4  7e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00254989  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0568  transcriptional regulator, AraC family  28.84 
 
 
293 aa  88.6  1e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.117041  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3088  AraC family transcriptional regulator  24.92 
 
 
296 aa  89  1e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.530109  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3013  transcription activator, effector binding  28.21 
 
 
289 aa  87.8  2e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>