More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BCE_0990 on replicon NC_003909
Organism: Bacillus cereus ATCC 10987



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003909  BCE_0990  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 		 281 aa  584  1e-166  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0205  transcriptional activator, AraC family  93.95 
 
 		 281 aa  558  1e-158  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000524418 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0223  transcriptional activator, AraC family  92.88 
 
 		 281 aa  553  1e-157  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000178737 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5265  transcriptional regulator, AraC family  92.17 
 
 		 281 aa  545  1e-154  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2678  transcriptional regulator, AraC family  45.24 
 
 		 284 aa  239  4e-62  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2323  transcriptional regulator, AraC family  42.91 
 
 		 289 aa  231  1e-59  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.614848  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4582  AraC family transcriptional regulator  43.84 
 
 		 290 aa  230  2e-59  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.763033  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3181  AraC family transcriptional regulator  43.69 
 
 		 292 aa  230  2e-59  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0278  transcriptional regulator, AraC family  43.54 
 
 		 290 aa  226  4e-58  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3846  transcriptional regulator, AraC family  43.64 
 
 		 287 aa  225  7e-58  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4947  transcriptional regulator, AraC family  43.05 
 
 		 290 aa  225  8e-58  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4973  transcriptional regulator, AraC family  43.34 
 
 		 290 aa  224  1e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4986  AraC family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 290 aa  223  3e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2759  AraC family transcriptional regulator  43.25 
 
 		 292 aa  222  4.9999999999999996e-57  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4724  AraC family transcriptional regulator  42.52 
 
 		 290 aa  222  7e-57  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.440387  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5086  AraC family transcriptional regulator  42.52 
 
 		 290 aa  222  7e-57  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4566  AraC family transcriptional regulator  42.03 
 
 		 290 aa  221  9.999999999999999e-57  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.017881  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3142  AraC family transcriptional regulator  42.18 
 
 		 301 aa  219  3.9999999999999997e-56  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4957  transcriptional regulator, AraC family  42.03 
 
 		 290 aa  219  5e-56  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4672  AraC family transcriptional regulator  41.98 
 
 		 290 aa  218  8.999999999999998e-56  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3174  AraC family transcriptional regulator  40.2 
 
 		 280 aa  212  4.9999999999999996e-54  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.626893  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3264  transcriptional regulator, AraC family  39.31 
 
 		 287 aa  210  2e-53  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2556  AraC family transcriptional regulator  39.46 
 
 		 290 aa  210  2e-53  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000000235949  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3138  AraC family transcriptional regulator  36.24 
 
 		 281 aa  193  3e-48  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2107  AraC family transcriptional regulator  37.46 
 
 		 313 aa  188  7e-47  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.342925  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1922  transcriptional regulator, AraC family  38.44 
 
 		 291 aa  187  2e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.890213  normal  0.89853 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2210  transcriptional regulator, AraC family  36.43 
 
 		 291 aa  183  3e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3564  transcriptional regulator, AraC family  35.15 
 
 		 285 aa  178  1e-43  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2780  transcriptional regulator, AraC family  35.42 
 
 		 285 aa  177  2e-43  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0531003  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1266  AraC family transcriptional regulator  32.66 
 
 		 300 aa  165  9e-40  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.23796  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0011  transcriptional regulator, AraC family  32.44 
 
 		 285 aa  164  2.0000000000000002e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000871788  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1802  transcriptional regulator, AraC family  32.53 
 
 		 286 aa  160  2e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2251  transcriptional regulator, AraC family  34.48 
 
 		 287 aa  157  2e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3344  helix-turn-helix domain-containing protein  45.21 
 
 		 232 aa  153  4e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.388455  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0137  AraC family transcriptional regulator  49.3 
 
 		 315 aa  149  5e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.10009 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1790  transcriptional regulator, AraC family  34.93 
 
 		 282 aa  146  3e-34  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.191731  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2127  transcription activator effector binding protein  31.86 
 
 		 290 aa  144  2e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1127  transcriptional regulator, AraC family  28.28 
 
 		 288 aa  136  3.0000000000000003e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1798  transcriptional regulator, AraC family  46.3 
 
 		 200 aa  135  9e-31  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0674  AraC family transcriptional regulator  51.26 
 
 		 265 aa  130  3e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1784  AraC family transcriptional regulator  31.85 
 
 		 280 aa  128  1.0000000000000001e-28  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000275244  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1013  AraC family transcriptional regulator  28.16 
 
 		 300 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.126228  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1170  transcriptional regulator, AraC family  28.66 
 
 		 300 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00906983  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4171  transcriptional regulator, AraC family  28.66 
 
 		 300 aa  126  3e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1036  AraC family transcriptional regulator  28.16 
 
 		 300 aa  126  3e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.139629  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1114  AraC family transcriptional regulator  28.16 
 
 		 300 aa  126  3e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1021  AraC family transcriptional regulator  28.48 
 
 		 300 aa  127  3e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1014  AraC family transcriptional regulator  28.16 
 
 		 300 aa  126  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.210728  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1194  transcriptional regulator, AraC family  29.32 
 
 		 300 aa  126  5e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.926126 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1216  AraC family transcriptional regulator  28.71 
 
 		 300 aa  125  6e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1271  transcriptional regulator, AraC family  28.66 
 
 		 300 aa  125  8.000000000000001e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.121916  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0329  transcription activator effector binding protein  28.57 
 
 		 288 aa  124  2e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0236652  normal  0.0105288 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0424  transcriptional regulator, AraC family  31.21 
 
 		 281 aa  119  3.9999999999999996e-26  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0086  transcriptional regulator, AraC family  31.05 
 
 		 313 aa  110  3e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.353006  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0853  transcriptional regulator, AraC family  28.62 
 
 		 284 aa  107  2e-22  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3503  transcription activator, effector binding  29.29 
 
 		 294 aa  104  2e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00111619  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4053  AraC family transcriptional regulator  28.82 
 
 		 277 aa  101  1e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2797  transcription activator effector binding  27.05 
 
 		 279 aa  101  1e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.338998 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3715  transcriptional regulator, AraC family  27.59 
 
 		 279 aa  100  3e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.424878 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0540  transcriptional regulator, AraC family  26.1 
 
 		 289 aa  97.8  2e-19  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.516999  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1069  AraC family transcriptional regulator  28.27 
 
 		 293 aa  96.7  4e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.689445  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0526  transcriptional regulator, AraC family  36.29 
 
 		 129 aa  96.7  4e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000198595  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0186  transcriptional regulator, AraC family  43.4 
 
 		 452 aa  96.3  6e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0261  AraC family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 281 aa  94  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003322  hypothetical protein  27.8 
 
 		 310 aa  93.6  3e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.757084  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3417  transcriptional regulator, AraC family  26.55 
 
 		 279 aa  93.6  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.27768  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0009  helix-turn-helix domain-containing protein  27.27 
 
 		 306 aa  94  3e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000070115 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7157  transcriptional regulator, AraC family  28.37 
 
 		 277 aa  94  3e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.367426 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3099  AraC family transcriptional regulator  25.57 
 
 		 326 aa  93.2  4e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0771  AraC family transcriptional regulator  24.08 
 
 		 288 aa  92.8  5e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.472166 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3053  transcriptional regulator, AraC family  25.74 
 
 		 296 aa  92  1e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3088  AraC family transcriptional regulator  25 
 
 		 296 aa  90.5  2e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.530109  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0176  AraC family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 299 aa  90.1  3e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3983  transcriptional regulator, AraC family  41.9 
 
 		 291 aa  89.7  4e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0211  transcriptional regulator, AraC family  35.81 
 
 		 299 aa  89.7  5e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0192  AraC family transcriptional regulator  35.81 
 
 		 299 aa  89.7  5e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0179  AraC family transcriptional regulator  35.81 
 
 		 299 aa  89.7  5e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0147136  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0191  AraC family transcriptional regulator  35.81 
 
 		 299 aa  89.7  5e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3086  transcriptional regulator, AraC family  25 
 
 		 296 aa  89  7e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.164604  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6275  AraC family transcriptional regulator  27.15 
 
 		 279 aa  89.4  7e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0216  transcriptional regulator, AraC family  35.14 
 
 		 299 aa  89  9e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0182  AraC family transcriptional regulator  35.81 
 
 		 299 aa  88.6  1e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3069  transcriptional regulator, AraC family  25.57 
 
 		 296 aa  87.8  2e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1563  transcription activator, effector binding  26.6 
 
 		 297 aa  87.8  2e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1594  transcription activator effector binding  26.6 
 
 		 297 aa  87.8  2e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.630007  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0165  AraC family transcriptional regulator  23.26 
 
 		 298 aa  87  3e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2843  AraC family transcriptional regulator  24.75 
 
 		 296 aa  86.3  6e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.538425  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3057  AraC family transcriptional regulator  24.75 
 
 		 296 aa  86.3  6e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.118978  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06300  methylphosphotriester-DNA alkyltransferase  24.67 
 
 		 302 aa  85.9  7e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2816  AraC family transcriptional regulator  24.75 
 
 		 296 aa  85.5  9e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2938  AraC family transcriptional regulator  27.68 
 
 		 279 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.487848  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1956  transcriptional regulator, AraC family  25 
 
 		 283 aa  84.7  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0993473  normal  0.479782 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3627  DNA gyrase inhibitor  25.42 
 
 		 300 aa  84.3  0.000000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000240584  hitchhiker  0.00747313 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3482  AraC family transcriptional regulator  40.82 
 
 		 140 aa  84.7  0.000000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.119803  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1523  AraC family transcriptional regulator  40.38 
 
 		 152 aa  84.3  0.000000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00364512  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001047  transcriptional regulator AraC family  34.29 
 
 		 299 aa  84  0.000000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1472  AraC family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 294 aa  84.3  0.000000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.102681  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3702  transcriptional regulator, AraC type  22.74 
 
 		 308 aa  84  0.000000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3161  AraC family transcriptional regulator  24.54 
 
 		 277 aa  83.6  0.000000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2836  AraC family transcriptional regulator  23.03 
 
 		 296 aa  83.6  0.000000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00254989  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>