More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_6041 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010676  Bphyt_6041  transcriptional regulator, AraC family  100 
 
 		 303 aa  608  1e-173  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.331066 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2274  AraC family transcriptional regulator  89.9 
 
 		 307 aa  554  1e-157  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.348217  normal  0.470943 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5215  helix-turn-helix domain-containing protein  30.33 
 
 		 331 aa  149  4e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1650  AraC family transcriptional regulator  36.69 
 
 		 316 aa  142  5e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3129  AraC family transcriptional regulator  30.41 
 
 		 299 aa  132  5e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0085  transcriptional regulator, AraC family  35.86 
 
 		 296 aa  132  6.999999999999999e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0195711 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3869  AraC family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 304 aa  127  2.0000000000000002e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3417  AraC family transcriptional regulator  32 
 
 		 299 aa  127  3e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.138414  normal  0.441033 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3740  helix-turn-helix domain-containing protein  28.43 
 
 		 301 aa  127  3e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.436963  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2469  AraC family transcriptional regulator  34.32 
 
 		 361 aa  126  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1148  transcriptional regulator, AraC family  27.97 
 
 		 309 aa  120  3.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2282  putative transcriptional regulator  29.62 
 
 		 294 aa  117  1.9999999999999998e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3232  transcriptional regulator, AraC family  31.16 
 
 		 296 aa  116  5e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0599312  hitchhiker  0.0000105754 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4617  transcriptional regulator, AraC family  33.21 
 
 		 296 aa  115  8.999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.107807 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7634  transcriptional regulator AraC family  29.05 
 
 		 304 aa  114  2.0000000000000002e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.63081  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0027  AraC family transcriptional regulator  43.17 
 
 		 299 aa  113  4.0000000000000004e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.618912  normal  0.0626425 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1543  transcriptional regulator, AraC family  27.87 
 
 		 300 aa  113  4.0000000000000004e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1365  AraC family transcriptional regulator  29.45 
 
 		 353 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.122979  normal  0.036458 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0536  AraC family transcriptional regulator  35.74 
 
 		 304 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0716  AraC family transcriptional regulator  29.05 
 
 		 296 aa  109  6e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00193737 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1472  AraC family transcriptional regulator  31.27 
 
 		 292 aa  107  3e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.327977  normal  0.780269 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0624  AraC family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 299 aa  107  3e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.401422 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1524  transcriptional regulator, AraC family  34.13 
 
 		 301 aa  106  4e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.753144  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0798  AraC family transcriptional regulator  39.18 
 
 		 311 aa  105  1e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3921  AraC family transcriptional regulator  39.18 
 
 		 311 aa  103  2e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.892105 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0345  AraC family transcriptional regulator  39.18 
 
 		 311 aa  104  2e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0829  AraC family transcriptional regulator  39.18 
 
 		 311 aa  104  2e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0210284  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3996  helix-turn-helix domain-containing protein  30.59 
 
 		 289 aa  104  2e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3975  helix-turn-helix domain-containing protein  35.75 
 
 		 302 aa  104  2e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4258  AraC family transcriptional regulator  39.18 
 
 		 327 aa  103  3e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3327  AraC family transcriptional regulator  42.14 
 
 		 279 aa  102  8e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.414693  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2413  transcriptional regulator, AraC family  42.66 
 
 		 322 aa  102  8e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.333457  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4632  AraC family transcriptional regulator  30.29 
 
 		 316 aa  101  1e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.569454  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0810  AraC family transcriptional regulator  40.88 
 
 		 306 aa  101  1e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7037  AraC family transcriptional regulator  32.55 
 
 		 301 aa  100  2e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.283867  normal  0.289972 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1458  AraC family transcriptional regulator  32.55 
 
 		 301 aa  100  2e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6370  AraC family transcriptional regulator  32.55 
 
 		 301 aa  100  2e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1980  AraC family transcriptional regulator  34.63 
 
 		 293 aa  100  4e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.949603 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2932  transcriptional regulator, AraC family  34.83 
 
 		 293 aa  99.4  7e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0583  AraC family transcriptional regulator  29.5 
 
 		 312 aa  99.4  7e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.98908  normal  0.54842 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5475  transcriptional regulator, AraC family  30.81 
 
 		 305 aa  99  9e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.59164  n/a   
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4172  AraC family transcriptional regulator  35.68 
 
 		 295 aa  98.6  1e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0833223  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0574  AraC family transcriptional regulator  31.29 
 
 		 311 aa  97.8  2e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0798057  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5827  helix-turn-helix domain-containing protein  27.76 
 
 		 316 aa  97.1  3e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.112164  normal  0.283627 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2046  AraC family transcriptional regulator  37.79 
 
 		 291 aa  96.7  4e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0173792  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0540  transcriptional regulator, AraC family  44 
 
 		 289 aa  96.7  5e-19  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.516999  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1909  AraC family transcriptional regulator  37.79 
 
 		 315 aa  96.3  6e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.190572  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2701  AraC family transcriptional regulator  37.79 
 
 		 315 aa  96.3  6e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.137316  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0867  AraC family transcriptional regulator  37.79 
 
 		 315 aa  96.3  6e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000394258  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3203  AraC family transcriptional regulator  37.79 
 
 		 315 aa  95.9  7e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.10279  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3164  AraC family transcriptional regulator  37.79 
 
 		 332 aa  95.9  8e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0245945  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1318  AraC family transcriptional regulator  28.85 
 
 		 294 aa  95.9  8e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.761239  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4587  AraC family transcriptional regulator  36.21 
 
 		 291 aa  95.5  9e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.213128  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0276  helix-turn-helix domain-containing protein  44.33 
 
 		 291 aa  95.1  1e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1041  helix-turn-helix, AraC type:Arac protein, arabinose-binding/dimerisation  35.63 
 
 		 291 aa  95.5  1e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.29946 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0134  AraC family transcriptional regulator  40.14 
 
 		 322 aa  95.1  1e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2507  transcriptional regulator, AraC family  39.73 
 
 		 291 aa  95.5  1e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1405  AraC family transcriptional regulator  35.67 
 
 		 251 aa  94.7  2e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000697123  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3482  AraC family transcriptional regulator  45.28 
 
 		 299 aa  94.7  2e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.675068  normal  0.589184 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3053  transcriptional regulator, AraC family  47.52 
 
 		 296 aa  94.4  2e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3086  transcriptional regulator, AraC family  47.52 
 
 		 296 aa  94.4  2e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.164604  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0608  AraC family transcriptional regulator  32.74 
 
 		 305 aa  93.6  3e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2736  AraC family transcriptional regulator  36.69 
 
 		 154 aa  93.6  3e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.66637 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2907  transcriptional regulator, AraC family  35.18 
 
 		 289 aa  94  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0560618  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2058  transcriptional regulator, AraC family  31.48 
 
 		 286 aa  93.6  4e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6955  transcriptional regulator, AraC family  37.79 
 
 		 346 aa  93.2  5e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.737934  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4464  helix-turn-helix domain-containing protein  31.74 
 
 		 291 aa  93.2  5e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3088  AraC family transcriptional regulator  48.51 
 
 		 296 aa  92.8  6e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.530109  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1268  transcriptional regulator, AraC family  35.56 
 
 		 300 aa  92.8  6e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2337  AraC family transcriptional regulator  33.61 
 
 		 289 aa  92.8  7e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000580503  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4605  AraC family transcriptional regulator  31.3 
 
 		 291 aa  92.4  8e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2981  AraC family transcriptional regulator  35.21 
 
 		 305 aa  92.4  9e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2413  AraC family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 305 aa  92.4  9e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4318  AraC family transcriptional regulator  35.21 
 
 		 305 aa  92  1e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00219342 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42360  transcriptional regulator, AraC family  30.81 
 
 		 318 aa  91.7  1e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1881  transcriptional regulator, AraC family  33.2 
 
 		 305 aa  92  1e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.831794  normal  0.0117859 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3218  AraC family transcriptional regulator  37.79 
 
 		 678 aa  91.3  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000051538  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1537  transcriptional regulator, AraC family  36.99 
 
 		 282 aa  91.3  2e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.164062  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2555  AraC family transcriptional regulator  39.18 
 
 		 311 aa  91.3  2e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3089  helix-turn-helix domain-containing protein  34.12 
 
 		 297 aa  91.3  2e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.830597 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5332  AraC family transcriptional regulator  37.79 
 
 		 301 aa  90.5  3e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5694  AraC family transcriptional regulator  28.51 
 
 		 319 aa  90.5  3e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.730665  normal  0.260224 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5000  AraC family transcriptional regulator  34.74 
 
 		 305 aa  90.5  3e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9084  transcriptional regulator AraC family  43.12 
 
 		 315 aa  90.5  3e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5860  AraC family transcriptional regulator  34.74 
 
 		 305 aa  90.5  3e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.499461  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4732  helix-turn-helix domain-containing protein  46.94 
 
 		 293 aa  90.1  4e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0052536 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3646  AraC family transcriptional regulator  35.89 
 
 		 275 aa  90.1  4e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2193  transcriptional regulator, AraC family  45.54 
 
 		 296 aa  90.1  5e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000412725 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5245  AraC family transcriptional regulator  33.95 
 
 		 312 aa  89.4  6e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4229  transcriptional regulator, AraC family  35.85 
 
 		 278 aa  89.4  7e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4111  transcriptional regulator, AraC family  34.12 
 
 		 299 aa  89  9e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.596036  normal  0.240547 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1732  transcriptional regulator, AraC family  37.96 
 
 		 288 aa  89  9e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0803469 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4223  transcriptional regulator, AraC family  34.12 
 
 		 299 aa  89  9e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1213  transcriptional regulator, AraC family  35.95 
 
 		 291 aa  89  1e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2326  transcriptional regulator, AraC family  37.89 
 
 		 295 aa  89  1e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0937352 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3244  AraC family transcriptional regulator  35.21 
 
 		 301 aa  88.6  1e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.432164 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2836  AraC family transcriptional regulator  44.55 
 
 		 296 aa  88.2  2e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00254989  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2379  AraC family transcriptional regulator  33.54 
 
 		 304 aa  87.8  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0538221  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0142  transcriptional regulator, AraC family  40.82 
 
 		 760 aa  88.2  2e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1895  AraC family transcriptional regulator  30.92 
 
 		 277 aa  88.2  2e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>