More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_0019 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010681  Bphyt_0019  transcriptional regulator, AraC family  100 
 
 		 314 aa  646    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1956  transcriptional regulator, AraC family  53.82 
 
 		 283 aa  315  6e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0993473  normal  0.479782 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2167  transcriptional regulator, AraC family  51.57 
 
 		 283 aa  305  9.000000000000001e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.273156  normal  0.0865176 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4446  putative DNA gyrase inhibitor  88.68 
 
 		 160 aa  298  7e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.823142  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3306  AraC family transcriptional regulator  49.82 
 
 		 292 aa  289  4e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0140  AraC family transcriptional regulator  49.82 
 
 		 293 aa  287  2e-76  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.877598  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2929  AraC family transcriptional regulator  50.18 
 
 		 293 aa  286  4e-76  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0126  AraC family transcriptional regulator  50.18 
 
 		 293 aa  286  4e-76  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.436666  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0946  transcriptional regulator, AraC family  50 
 
 		 286 aa  285  5e-76  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.584518  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3161  AraC family transcriptional regulator  42.29 
 
 		 277 aa  204  1e-51  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3953  AraC family transcriptional regulator  40.34 
 
 		 287 aa  201  9.999999999999999e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0509927  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3503  transcription activator, effector binding  38 
 
 		 294 aa  197  1.0000000000000001e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00111619  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7295  AraC family transcriptional regulator  37.99 
 
 		 277 aa  189  5e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.158014  normal  0.567517 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0771  AraC family transcriptional regulator  40.71 
 
 		 288 aa  188  1e-46  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.472166 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3702  transcriptional regulator, AraC type  36.55 
 
 		 308 aa  181  1e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0116  transcription activator, effector binding  50.31 
 
 		 159 aa  162  8.000000000000001e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0126  transcription activator effector binding  49.06 
 
 		 159 aa  159  6e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03191  transcription regulator protein  34.49 
 
 		 310 aa  148  1.0000000000000001e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0540  transcriptional regulator, AraC family  30.71 
 
 		 289 aa  146  5e-34  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.516999  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0124  transcription activator effector binding  48.43 
 
 		 159 aa  144  2e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3086  transcriptional regulator, AraC family  28.72 
 
 		 296 aa  137  2e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.164604  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1224  AraC family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 288 aa  137  2e-31  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0494811  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2703  transcription activator, effector binding  29.15 
 
 		 326 aa  137  3.0000000000000003e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.268178 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0853  transcriptional regulator, AraC family  31.32 
 
 		 284 aa  135  6.0000000000000005e-31  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3053  transcriptional regulator, AraC family  28.04 
 
 		 296 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2843  AraC family transcriptional regulator  28.38 
 
 		 296 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.538425  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3057  AraC family transcriptional regulator  28.38 
 
 		 296 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.118978  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3069  transcriptional regulator, AraC family  28.38 
 
 		 296 aa  133  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4381  transcription activator effector binding  30.58 
 
 		 286 aa  132  9e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.134609  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2836  AraC family transcriptional regulator  28.86 
 
 		 296 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00254989  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1474  transcriptional regulator, AraC family  33.57 
 
 		 286 aa  130  2.0000000000000002e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2776  AraC family transcriptional regulator  28.04 
 
 		 296 aa  130  3e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2193  transcriptional regulator, AraC family  27.85 
 
 		 296 aa  130  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000412725 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3088  AraC family transcriptional regulator  28.04 
 
 		 296 aa  129  9.000000000000001e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.530109  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3099  AraC family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 326 aa  129  9.000000000000001e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2816  AraC family transcriptional regulator  28.04 
 
 		 296 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3431  transcription activator, effector binding  31.6 
 
 		 288 aa  128  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3526  transcription activator, effector binding  31.25 
 
 		 288 aa  128  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5359  transcriptional regulator, AraC family  33.94 
 
 		 297 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.6789  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3425  transcription activator, effector binding  31.36 
 
 		 288 aa  127  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3356  transcription activator, effector binding  31.25 
 
 		 288 aa  126  4.0000000000000003e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2158  AraC family transcriptional regulator  31.49 
 
 		 294 aa  126  5e-28  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0371  AraC family transcriptional regulator  30.38 
 
 		 288 aa  123  3e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1217  transcription activator, effector binding  32.31 
 
 		 288 aa  123  4e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0076  transcription activator, effector binding  29.47 
 
 		 288 aa  119  6e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0028  transcriptional regulator, AraC family  29.72 
 
 		 279 aa  116  3.9999999999999997e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3013  transcription activator, effector binding  28.9 
 
 		 289 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1398  AraC family transcriptional regulator  28.67 
 
 		 296 aa  114  2.0000000000000002e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.584508  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0132  transcription regulator protein  30.34 
 
 		 265 aa  114  3e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4046  AraC family transcriptional regulator  28.14 
 
 		 289 aa  114  3e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001047  transcriptional regulator AraC family  28.57 
 
 		 299 aa  112  6e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0034  transcriptional regulator, AraC family  29.37 
 
 		 279 aa  112  1.0000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.255751 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06300  methylphosphotriester-DNA alkyltransferase  28.81 
 
 		 302 aa  107  2e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1354  AraC family transcriptional regulator  29.86 
 
 		 293 aa  107  3e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.558119  normal  0.215319 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1644  transcriptional regulator, AraC family  28.97 
 
 		 293 aa  104  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0930139  normal  0.386203 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6018  hypothetical protein  34.59 
 
 		 156 aa  103  3e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1774  AraC family transcriptional regulator  28.91 
 
 		 289 aa  103  4e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.524324  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2489  transcription activator, effector binding  29.25 
 
 		 297 aa  102  9e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0418  transcription activator, effector binding  34.39 
 
 		 154 aa  102  1e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0621  AraC family transcriptional regulator  22.83 
 
 		 291 aa  100  4e-20  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2173  AraC family transcriptional regulator  27.74 
 
 		 289 aa  99.8  6e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.671765  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1641  transcription activator effector binding protein  25.72 
 
 		 287 aa  99.4  7e-20  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2480  transcription activator, effector binding  34.39 
 
 		 154 aa  98.6  1e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.540117  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3627  DNA gyrase inhibitor  26.92 
 
 		 300 aa  99  1e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000240584  hitchhiker  0.00747313 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0077  HTH-type transcriptional regulator, AraC-family  26.87 
 
 		 289 aa  95.9  9e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2759  AraC family transcriptional regulator  26.48 
 
 		 292 aa  95.9  9e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4566  transcriptional regulator, AraC family  27.43 
 
 		 293 aa  95.1  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.683768 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3564  AraC family transcriptional regulator  27.82 
 
 		 279 aa  94  3e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.236142  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06471  hypothetical protein  27.34 
 
 		 289 aa  94  3e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000611  AraC-type DNA-binding domain-containing protein  27.44 
 
 		 289 aa  93.6  4e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0208776  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3417  transcriptional regulator, AraC family  28.18 
 
 		 279 aa  90.1  4e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.27768  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0261  AraC family transcriptional regulator  28.03 
 
 		 281 aa  89.4  8e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1013  AraC family transcriptional regulator  40.38 
 
 		 300 aa  88.6  1e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.126228  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1576  transcriptional regulator, AraC family  27.63 
 
 		 436 aa  89  1e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1271  transcriptional regulator, AraC family  40.38 
 
 		 300 aa  88.6  1e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.121916  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7157  transcriptional regulator, AraC family  28.03 
 
 		 277 aa  88.2  2e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.367426 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1216  AraC family transcriptional regulator  40.38 
 
 		 300 aa  87.4  3e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1036  AraC family transcriptional regulator  40.38 
 
 		 300 aa  87.4  3e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.139629  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1014  AraC family transcriptional regulator  40.38 
 
 		 300 aa  87.4  3e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.210728  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1114  AraC family transcriptional regulator  40.38 
 
 		 300 aa  87.4  3e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2116  transcriptional regulator, AraC family  28.95 
 
 		 287 aa  87.4  3e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0918782  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1194  transcriptional regulator, AraC family  40.38 
 
 		 300 aa  87.4  3e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.926126 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3715  transcriptional regulator, AraC family  27.74 
 
 		 279 aa  87.4  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.424878 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12290  Transcriptional regulator, AraC family  26.42 
 
 		 325 aa  87  4e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4171  transcriptional regulator, AraC family  39.42 
 
 		 300 aa  87  4e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4986  AraC family transcriptional regulator  23.18 
 
 		 290 aa  86.3  5e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1365  AraC family transcriptional regulator  41.23 
 
 		 353 aa  86.7  5e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.122979  normal  0.036458 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1021  AraC family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 300 aa  86.3  7e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4724  AraC family transcriptional regulator  24.57 
 
 		 290 aa  85.9  8e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.440387  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5086  AraC family transcriptional regulator  24.57 
 
 		 290 aa  85.9  8e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1170  transcriptional regulator, AraC family  38.46 
 
 		 300 aa  85.9  8e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00906983  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3344  helix-turn-helix domain-containing protein  39.29 
 
 		 232 aa  85.1  0.000000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.388455  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3846  transcriptional regulator, AraC family  24.03 
 
 		 287 aa  84.7  0.000000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4973  transcriptional regulator, AraC family  23.18 
 
 		 290 aa  85.1  0.000000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0526  transcriptional regulator, AraC family  36.89 
 
 		 129 aa  84  0.000000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000198595  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3142  AraC family transcriptional regulator  22.94 
 
 		 301 aa  84  0.000000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0009  helix-turn-helix domain-containing protein  27.55 
 
 		 306 aa  84  0.000000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000070115 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4957  transcriptional regulator, AraC family  23.88 
 
 		 290 aa  84  0.000000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1952  AraC family transcriptional regulator  29.62 
 
 		 271 aa  83.6  0.000000000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0598764  normal  0.641899 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4672  AraC family transcriptional regulator  22.22 
 
 		 290 aa  83.6  0.000000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>