More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_1952 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007802  Jann_1952  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 
271 aa  559  1e-158  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0598764  normal  0.641899 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6275  AraC family transcriptional regulator  43.91 
 
 
279 aa  221  9.999999999999999e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0261  AraC family transcriptional regulator  41.45 
 
 
281 aa  218  1e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2938  AraC family transcriptional regulator  43.64 
 
 
279 aa  212  4.9999999999999996e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.487848  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7157  transcriptional regulator, AraC family  41.09 
 
 
277 aa  211  1e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.367426 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3417  transcriptional regulator, AraC family  39.35 
 
 
279 aa  202  5e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.27768  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2797  transcription activator effector binding  39.71 
 
 
279 aa  201  9.999999999999999e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.338998 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3715  transcriptional regulator, AraC family  38.63 
 
 
279 aa  199  5e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.424878 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4053  AraC family transcriptional regulator  41.45 
 
 
277 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1216  AraC family transcriptional regulator  31.21 
 
 
300 aa  124  1e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1036  AraC family transcriptional regulator  30.54 
 
 
300 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.139629  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1114  AraC family transcriptional regulator  30.54 
 
 
300 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1013  AraC family transcriptional regulator  30.54 
 
 
300 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.126228  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1194  transcriptional regulator, AraC family  30.54 
 
 
300 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.926126 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1170  transcriptional regulator, AraC family  30.54 
 
 
300 aa  120  3e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00906983  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1014  AraC family transcriptional regulator  30.54 
 
 
300 aa  120  3e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.210728  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1021  AraC family transcriptional regulator  30.2 
 
 
300 aa  120  3e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4171  transcriptional regulator, AraC family  30.54 
 
 
300 aa  119  7e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1271  transcriptional regulator, AraC family  30.14 
 
 
300 aa  119  7e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.121916  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4077  transcription activator effector binding  37.65 
 
 
178 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06300  methylphosphotriester-DNA alkyltransferase  27.36 
 
 
302 aa  105  5e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3503  transcription activator, effector binding  32.5 
 
 
294 aa  105  1e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00111619  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0424  transcriptional regulator, AraC family  26.33 
 
 
281 aa  102  9e-21  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1790  transcriptional regulator, AraC family  27.43 
 
 
282 aa  101  1e-20  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.191731  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3983  transcriptional regulator, AraC family  27.68 
 
 
291 aa  99.4  6e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0568  transcriptional regulator, AraC family  26.29 
 
 
293 aa  97.8  2e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.117041  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1784  AraC family transcriptional regulator  26.74 
 
 
280 aa  97.1  3e-19  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000275244  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0529  transcriptional regulator, AraC family  26.69 
 
 
288 aa  97.1  3e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0853  transcriptional regulator, AraC family  31.03 
 
 
284 aa  97.1  3e-19  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0771  AraC family transcriptional regulator  31.41 
 
 
288 aa  95.9  6e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.472166 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2323  transcriptional regulator, AraC family  28.83 
 
 
289 aa  95.1  1e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.614848  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1217  transcription activator, effector binding  29.24 
 
 
288 aa  92.4  7e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3526  transcription activator, effector binding  27.97 
 
 
288 aa  90.9  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0011  transcriptional regulator, AraC family  29.34 
 
 
285 aa  89.4  5e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000871788  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3174  AraC family transcriptional regulator  28.17 
 
 
280 aa  89.4  6e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.626893  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0679  AraC family transcriptional regulator  25.9 
 
 
289 aa  89.4  7e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0014238  normal  0.551474 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3181  AraC family transcriptional regulator  25.26 
 
 
292 aa  88.6  9e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3673  transcriptional regulator, AraC family  25.5 
 
 
295 aa  89  9e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4986  AraC family transcriptional regulator  23.32 
 
 
290 aa  87.4  2e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1474  transcriptional regulator, AraC family  29.54 
 
 
286 aa  86.7  3e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3356  transcription activator, effector binding  28.24 
 
 
288 aa  87  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4973  transcriptional regulator, AraC family  23.32 
 
 
290 aa  87  3e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5265  transcriptional regulator, AraC family  26.77 
 
 
281 aa  86.3  5e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0223  transcriptional activator, AraC family  27.74 
 
 
281 aa  86.3  6e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000178737 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3425  transcription activator, effector binding  27.86 
 
 
288 aa  85.1  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2556  AraC family transcriptional regulator  25.68 
 
 
290 aa  84.7  0.000000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000000235949  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3431  transcription activator, effector binding  27.86 
 
 
288 aa  85.1  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3867  transcriptional regulator, AraC family  24.7 
 
 
295 aa  84.3  0.000000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.0000535009  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0205  transcriptional activator, AraC family  27.51 
 
 
281 aa  84  0.000000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000524418 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0019  transcriptional regulator, AraC family  29.62 
 
 
314 aa  83.6  0.000000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3481  right origin-binding protein  27.38 
 
 
288 aa  83.2  0.000000000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3609  AraC family transcriptional regulator  27.38 
 
 
288 aa  83.2  0.000000000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0814  right origin-binding protein  27.38 
 
 
288 aa  83.2  0.000000000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3264  transcriptional regulator, AraC family  25.44 
 
 
287 aa  82.4  0.000000000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0990  AraC family transcriptional regulator  27 
 
 
281 aa  82.4  0.000000000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0216  transcriptional regulator, AraC family  40 
 
 
299 aa  82.4  0.000000000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0086  transcriptional regulator, AraC family  27.27 
 
 
313 aa  82  0.000000000000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.353006  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4947  transcriptional regulator, AraC family  23.18 
 
 
290 aa  82  0.000000000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0165  AraC family transcriptional regulator  25.36 
 
 
298 aa  82  0.000000000000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0278  transcriptional regulator, AraC family  22.6 
 
 
290 aa  81.6  0.00000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4957  transcriptional regulator, AraC family  23.32 
 
 
290 aa  81.6  0.00000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0211  transcriptional regulator, AraC family  39 
 
 
299 aa  81.3  0.00000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0192  AraC family transcriptional regulator  39 
 
 
299 aa  81.3  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0179  AraC family transcriptional regulator  39 
 
 
299 aa  81.3  0.00000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0147136  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4021  AraC family transcriptional regulator  24.48 
 
 
288 aa  80.9  0.00000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.185045  normal  0.0217611 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0191  AraC family transcriptional regulator  39 
 
 
299 aa  81.3  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003322  hypothetical protein  25.43 
 
 
310 aa  81.3  0.00000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.757084  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2678  transcriptional regulator, AraC family  27.53 
 
 
284 aa  80.9  0.00000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4724  AraC family transcriptional regulator  21.92 
 
 
290 aa  80.5  0.00000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.440387  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2251  transcriptional regulator, AraC family  26.8 
 
 
287 aa  80.5  0.00000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5086  AraC family transcriptional regulator  21.92 
 
 
290 aa  80.5  0.00000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0182  AraC family transcriptional regulator  39 
 
 
299 aa  79.7  0.00000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0076  transcription activator, effector binding  28.09 
 
 
288 aa  80.1  0.00000000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0176  AraC family transcriptional regulator  40 
 
 
299 aa  79.7  0.00000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4582  AraC family transcriptional regulator  22.61 
 
 
290 aa  79.3  0.00000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.763033  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0329  transcription activator effector binding protein  30.08 
 
 
288 aa  79.3  0.00000000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0236652  normal  0.0105288 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1127  transcriptional regulator, AraC family  29.03 
 
 
288 aa  79.3  0.00000000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3142  AraC family transcriptional regulator  26.38 
 
 
301 aa  79.3  0.00000000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4672  AraC family transcriptional regulator  23.53 
 
 
290 aa  79  0.00000000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3846  transcriptional regulator, AraC family  26.3 
 
 
287 aa  79  0.00000000000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0557  AraC family transcriptional regulator  25.1 
 
 
289 aa  79  0.00000000000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5600  putative transcriptional regulator  37.67 
 
 
270 aa  78.6  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1802  transcriptional regulator, AraC family  31.58 
 
 
286 aa  78.6  0.0000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3702  transcriptional regulator, AraC type  38.61 
 
 
308 aa  77.8  0.0000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1224  AraC family transcriptional regulator  26.55 
 
 
288 aa  77.4  0.0000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0494811  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64500  putative transcriptional regulator  37.68 
 
 
270 aa  77.4  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12290  Transcriptional regulator, AraC family  28 
 
 
325 aa  77.8  0.0000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0034  transcriptional regulator, AraC family  30.62 
 
 
279 aa  77  0.0000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.255751 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04272  DNA-binding transcriptional activator  26.79 
 
 
289 aa  76.6  0.0000000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3601  transcriptional regulator, AraC family  26.79 
 
 
289 aa  76.6  0.0000000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4994  right origin-binding protein  26.79 
 
 
289 aa  76.6  0.0000000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5910  right origin-binding protein  26.79 
 
 
289 aa  76.6  0.0000000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4566  AraC family transcriptional regulator  22.49 
 
 
290 aa  76.6  0.0000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.017881  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4632  right origin-binding protein  26.79 
 
 
289 aa  76.6  0.0000000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04237  hypothetical protein  26.79 
 
 
289 aa  76.6  0.0000000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3660  AraC family transcriptional regulator  26.79 
 
 
289 aa  76.6  0.0000000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4943  right origin-binding protein  26.79 
 
 
289 aa  76.6  0.0000000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4946  right origin-binding protein  26.79 
 
 
289 aa  76.6  0.0000000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.96055 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3564  transcriptional regulator, AraC family  25 
 
 
285 aa  76.3  0.0000000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0126  AraC family transcriptional regulator  28.85 
 
 
293 aa  76.3  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.436666  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>