117 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_0126 on replicon NC_010551
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010551  BamMC406_0126  transcription activator effector binding  100 
 
 		 159 aa  323  8.000000000000001e-88  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0116  transcription activator, effector binding  93.71 
 
 		 159 aa  306  5.9999999999999995e-83  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2929  AraC family transcriptional regulator  89.94 
 
 		 293 aa  303  7e-82  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0126  AraC family transcriptional regulator  89.94 
 
 		 293 aa  303  7e-82  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.436666  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0140  AraC family transcriptional regulator  88.05 
 
 		 293 aa  297  3e-80  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.877598  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3306  AraC family transcriptional regulator  87.42 
 
 		 292 aa  290  4e-78  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0124  transcription activator effector binding  76.1 
 
 		 159 aa  244  3e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0019  transcriptional regulator, AraC family  49.06 
 
 		 314 aa  159  1e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4446  putative DNA gyrase inhibitor  47.17 
 
 		 160 aa  149  1e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.823142  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1956  transcriptional regulator, AraC family  45.45 
 
 		 283 aa  142  3e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0993473  normal  0.479782 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2167  transcriptional regulator, AraC family  44.16 
 
 		 283 aa  140  9.999999999999999e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.273156  normal  0.0865176 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0946  transcriptional regulator, AraC family  44.52 
 
 		 286 aa  137  3.9999999999999997e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.584518  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3953  AraC family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 287 aa  122  2e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0509927  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0771  AraC family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 288 aa  118  3.9999999999999996e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.472166 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2480  transcription activator, effector binding  40.26 
 
 		 154 aa  104  4e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.540117  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7295  AraC family transcriptional regulator  35.9 
 
 		 277 aa  100  1e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.158014  normal  0.567517 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6018  hypothetical protein  35.95 
 
 		 156 aa  98.2  4e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0418  transcription activator, effector binding  35.95 
 
 		 154 aa  98.2  4e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3161  AraC family transcriptional regulator  38.75 
 
 		 277 aa  96.7  1e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3702  transcriptional regulator, AraC type  35.71 
 
 		 308 aa  89.7  1e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2798  transcription activator effector binding  36.54 
 
 		 156 aa  87.8  5e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3503  transcription activator, effector binding  35.71 
 
 		 294 aa  85.1  4e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00111619  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2703  transcription activator, effector binding  34.38 
 
 		 326 aa  81.3  0.000000000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.268178 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3349  transcription activator, effector binding  30.2 
 
 		 160 aa  77  0.00000000000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.808619  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1474  transcriptional regulator, AraC family  31.41 
 
 		 286 aa  71.2  0.000000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0028  transcriptional regulator, AraC family  32.05 
 
 		 279 aa  70.1  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4046  AraC family transcriptional regulator  31.41 
 
 		 289 aa  70.1  0.00000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4381  transcription activator effector binding  30.77 
 
 		 286 aa  68.9  0.00000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.134609  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1224  AraC family transcriptional regulator  32 
 
 		 288 aa  68.2  0.00000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0494811  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0076  transcription activator, effector binding  31.45 
 
 		 288 aa  67.4  0.00000000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0540  transcriptional regulator, AraC family  31.47 
 
 		 289 aa  67.4  0.00000000008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.516999  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0034  transcriptional regulator, AraC family  31.21 
 
 		 279 aa  67  0.00000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.255751 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0132  transcription regulator protein  32.48 
 
 		 265 aa  66.2  0.0000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3013  transcription activator, effector binding  30.77 
 
 		 289 aa  66.2  0.0000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3526  transcription activator, effector binding  31.21 
 
 		 288 aa  66.2  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2209  transcription activator, effector binding  27.95 
 
 		 156 aa  64.7  0.0000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.796256 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2764  hypothetical protein  25.64 
 
 		 166 aa  64.7  0.0000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000234477  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0621  AraC family transcriptional regulator  23.9 
 
 		 291 aa  64.7  0.0000000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3431  transcription activator, effector binding  30.57 
 
 		 288 aa  64.3  0.0000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3356  transcription activator, effector binding  30.57 
 
 		 288 aa  64.3  0.0000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3425  transcription activator, effector binding  30.57 
 
 		 288 aa  64.3  0.0000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2745  transcriptional regulator, AraC family  25.64 
 
 		 158 aa  63.9  0.0000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.611146  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3099  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 326 aa  63.9  0.0000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0853  transcriptional regulator, AraC family  30 
 
 		 284 aa  62.4  0.000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2158  AraC family transcriptional regulator  29.68 
 
 		 294 aa  61.6  0.000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2547  transcriptional regulator, AraC family  25.64 
 
 		 156 aa  61.6  0.000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0684742  hitchhiker  0.0000000036137 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1576  transcriptional regulator, AraC family  30.66 
 
 		 436 aa  61.6  0.000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1217  transcription activator, effector binding  28.85 
 
 		 288 aa  60.8  0.000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2753  hypothetical protein  31.17 
 
 		 156 aa  59.7  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4810  transcription activator effector binding  32.58 
 
 		 274 aa  59.7  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.858088  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3086  transcriptional regulator, AraC family  25.79 
 
 		 296 aa  58.5  0.00000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.164604  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2788  hypothetical protein  25 
 
 		 166 aa  58.5  0.00000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.0000000178794  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2776  AraC family transcriptional regulator  25.16 
 
 		 296 aa  58.2  0.00000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2116  transcriptional regulator, AraC family  30.46 
 
 		 287 aa  58.2  0.00000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0918782  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3506  transcription activator, effector binding  32.84 
 
 		 274 aa  57.8  0.00000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.771694  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3564  AraC family transcriptional regulator  29.01 
 
 		 279 aa  57.4  0.00000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.236142  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2502  hypothetical protein  24.84 
 
 		 159 aa  57.4  0.00000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000359333  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1774  AraC family transcriptional regulator  29.01 
 
 		 289 aa  57  0.0000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.524324  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2173  AraC family transcriptional regulator  28.4 
 
 		 289 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.671765  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2843  AraC family transcriptional regulator  23.9 
 
 		 296 aa  55.1  0.0000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.538425  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2816  AraC family transcriptional regulator  23.75 
 
 		 296 aa  55.1  0.0000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3057  AraC family transcriptional regulator  23.9 
 
 		 296 aa  55.1  0.0000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.118978  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0371  AraC family transcriptional regulator  24.84 
 
 		 288 aa  55.1  0.0000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2546  hypothetical protein  24.36 
 
 		 159 aa  53.9  0.0000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000652694  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2733  hypothetical protein  24.36 
 
 		 159 aa  53.9  0.0000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000951736  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3088  AraC family transcriptional regulator  24.38 
 
 		 296 aa  53.5  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.530109  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3611  transcriptional regulator, MerR family  37.35 
 
 		 267 aa  53.9  0.000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2467  hypothetical protein  23.72 
 
 		 159 aa  52.4  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0149967  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2836  AraC family transcriptional regulator  23.27 
 
 		 296 aa  52.8  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00254989  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2193  transcriptional regulator, AraC family  24.31 
 
 		 296 aa  52.4  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000412725 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3560  MerR family transcriptional regulator  26.11 
 
 		 287 aa  52  0.000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.453881 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3069  transcriptional regulator, AraC family  23.97 
 
 		 296 aa  52  0.000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3053  transcriptional regulator, AraC family  24.84 
 
 		 296 aa  50.8  0.000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1237  transcription activator, effector binding  31.82 
 
 		 267 aa  50.8  0.000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.516302  normal  0.923656 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2741  hypothetical protein  23.72 
 
 		 159 aa  50.4  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.19844e-25 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1231  transcription activator effector binding  34.52 
 
 		 155 aa  49.7  0.00002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0816033 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0385  transcription activator, effector binding  26.22 
 
 		 286 aa  48.5  0.00003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03191  transcription regulator protein  29.94 
 
 		 310 aa  48.5  0.00004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2184  DNA gyrase inhibitor  22.73 
 
 		 155 aa  48.1  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03030  predicted transcriptional regulator  35.29 
 
 		 276 aa  47.8  0.00006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2238  DNA gyrase inhibitor  22.73 
 
 		 155 aa  47.8  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.478709  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2284  DNA gyrase inhibitor  22.73 
 
 		 155 aa  47.8  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0569461 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2231  DNA gyrase inhibitor  22.73 
 
 		 155 aa  47.8  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.107411  normal  0.171145 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2397  DNA gyrase inhibitor  22.73 
 
 		 155 aa  47.8  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3627  DNA gyrase inhibitor  29.01 
 
 		 300 aa  46.6  0.0001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000240584  hitchhiker  0.00747313 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1641  transcription activator effector binding protein  22.73 
 
 		 287 aa  47  0.0001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0296  transcription activator effector binding  28.93 
 
 		 120 aa  45.4  0.0003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.285639 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12290  Transcriptional regulator, AraC family  24.59 
 
 		 325 aa  45.4  0.0003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01912  DNA gyrase inhibitor  22.81 
 
 		 157 aa  45.1  0.0004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2324  hypothetical protein  22.93 
 
 		 321 aa  45.1  0.0004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0188345  normal  0.69843 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1631  DNA gyrase inhibitor  22.81 
 
 		 157 aa  45.1  0.0004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0493763 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01898  hypothetical protein  22.81 
 
 		 157 aa  45.1  0.0004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2865  DNA gyrase inhibitor  22.81 
 
 		 157 aa  45.1  0.0004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.114813 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2147  DNA gyrase inhibitor  21.97 
 
 		 157 aa  45.1  0.0005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1052  DNA gyrase inhibitor  21.93 
 
 		 157 aa  44.3  0.0006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.170354 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02895  predicted transcriptional regulator  25.17 
 
 		 160 aa  43.1  0.001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.468717  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1206  transcription activator, effector binding  28.18 
 
 		 132 aa  43.5  0.001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4053  AraC family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 277 aa  43.5  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3201  transcription activator effector binding domain/DNA gyrase inhibitor domain-containing protein  25.17 
 
 		 160 aa  43.1  0.001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5359  transcriptional regulator, AraC family  25.62 
 
 		 297 aa  43.5  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.6789  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>