More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_4810 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_4810  transcription activator effector binding  100 
 
 		 274 aa  551  1e-156  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.858088  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3506  transcription activator, effector binding  91.54 
 
 		 274 aa  507  1e-143  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.771694  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3611  transcriptional regulator, MerR family  29.93 
 
 		 267 aa  145  7.0000000000000006e-34  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0225  putative transcriptional regulator, MerR family  36.76 
 
 		 262 aa  141  9.999999999999999e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4179  transcriptional activator ligand binding domain protein  36.59 
 
 		 279 aa  141  9.999999999999999e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.803381 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4799  transcriptional regulator, MerR family  37 
 
 		 258 aa  135  9.999999999999999e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3560  MerR family transcriptional regulator  30.82 
 
 		 287 aa  132  5e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.453881 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0385  transcription activator, effector binding  34.88 
 
 		 286 aa  132  5e-30  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3833  MerR family transcriptional regulator  32.97 
 
 		 270 aa  130  3e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000100059  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0684  MerR family transcriptional regulator  33.71 
 
 		 279 aa  129  6e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7266  transcriptional regulator, MerR family  30.88 
 
 		 274 aa  124  2e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2305  transcriptional regulator, MerR family  32.35 
 
 		 268 aa  116  3e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.643594 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5047  MerR family transcriptional regulator  32.73 
 
 		 276 aa  114  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.574995  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1424  MerR family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 279 aa  113  3e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.140644 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3507  MerR family transcriptional regulator  31.9 
 
 		 292 aa  113  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.401792  normal  0.0867153 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3205  MerR family transcriptional regulator  26.55 
 
 		 273 aa  112  9e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.208736  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2895  transcriptional regulator, MerR family  27.8 
 
 		 269 aa  111  1.0000000000000001e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2018  putative transcriptional regulator, MerR family  32.74 
 
 		 286 aa  111  1.0000000000000001e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.253438  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2735  putative transcriptional regulator, MerR family  30.88 
 
 		 264 aa  110  3e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0721242  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20290  predicted transcriptional regulator  31.52 
 
 		 277 aa  109  5e-23  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0400625  normal  0.347976 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3503  transcriptional regulator, putative  25.27 
 
 		 273 aa  107  2e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.590051  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2638  transcriptional regulator, MerR family  28.47 
 
 		 273 aa  107  2e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0331  MerR family transcriptional regulator  27.45 
 
 		 281 aa  107  3e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3767  transcriptional regulator, MerR family  31.82 
 
 		 264 aa  107  3e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.237591  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6982  MerR family transcriptional regulator  30.88 
 
 		 270 aa  106  5e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.80949  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0010  hypothetical protein  28.67 
 
 		 270 aa  105  6e-22  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03030  predicted transcriptional regulator  29.41 
 
 		 276 aa  105  1e-21  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3493  transcriptional regulator, MerR family  26.33 
 
 		 273 aa  104  1e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2545  transcriptional regulator, MerR family  27.31 
 
 		 269 aa  104  2e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1701  MerR family transcriptional regulator  29.35 
 
 		 280 aa  104  2e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.126124  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2263  transcriptional regulator, MerR family  33.45 
 
 		 281 aa  103  3e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2808  transcriptional regulator, MerR family  30 
 
 		 276 aa  103  4e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.44001  normal  0.316047 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1820  MerR family transcriptional regulator  25.81 
 
 		 270 aa  103  4e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.404333  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2780  transcriptional regulator, MerR family  26.94 
 
 		 269 aa  102  5e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000880145 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1993  transcriptional regulator, MerR family  29.79 
 
 		 272 aa  102  5e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1629  transcriptional regulator, MerR family  30.99 
 
 		 306 aa  101  1e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0882685  normal  0.393491 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4163  transcriptional regulator, MerR family  29.45 
 
 		 275 aa  100  2e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3830  transcriptional regulator, MerR family  28.88 
 
 		 274 aa  100  2e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2354  MerR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 269 aa  100  4e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000403249  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2588  transcriptional regulator, MerR family  26.67 
 
 		 269 aa  100  4e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.40806e-18 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2317  MerR family transcriptional regulator  26.3 
 
 		 269 aa  99  7e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0566035  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2401  MerR family transcriptional regulator  26.57 
 
 		 269 aa  98.2  1e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.908212  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2576  MerR family transcriptional regulator  26.57 
 
 		 269 aa  98.2  1e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.473387  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4099  transcription activator effector binding protein  31.67 
 
 		 276 aa  97.8  2e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0247  MerR family transcriptional regulator  26.41 
 
 		 287 aa  97.8  2e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2481  transcriptional regulator, MerR family  30.11 
 
 		 269 aa  97.1  3e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.564945  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0932  MerR family transcriptional regulator  27.44 
 
 		 290 aa  97.1  3e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4623  transcriptional regulator, MerR family  31.77 
 
 		 297 aa  95.5  9e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1231  transcription activator effector binding  41.96 
 
 		 155 aa  94.7  1e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0816033 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2529  transcriptional regulator, MerR family  29.45 
 
 		 270 aa  94  2e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1731  MerR family transcriptional regulator  25.36 
 
 		 276 aa  93.6  3e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.867101  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2630  transcriptional regulator, MerR family  25.45 
 
 		 269 aa  93.6  3e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00281071  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1708  transcriptional regulator, MerR family  25.36 
 
 		 276 aa  92  8e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1641  MerR family transcriptional regulator  25.36 
 
 		 276 aa  92  9e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1364  hypothetical protein  30.92 
 
 		 152 aa  92  1e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.33275  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3825  transcriptional activator ligand binding domain protein  25.36 
 
 		 280 aa  91.3  2e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1523  MerR family transcriptional regulator  25.36 
 
 		 276 aa  91.3  2e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.193632  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1485  MerR family transcriptional regulator  25 
 
 		 276 aa  90.1  3e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0543962  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7229  putative transcriptional regulator, MerR family  29.33 
 
 		 272 aa  90.1  3e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.385629 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1495  MerR family transcriptional regulator  25 
 
 		 276 aa  89.7  4e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00542237  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1782  transcriptional regulator, MerR family  25.36 
 
 		 276 aa  89.4  6e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.381283  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2528  transcriptional regulator, MerR family  28.43 
 
 		 293 aa  88.2  1e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1677  transcriptional regulator, MerR family  24.28 
 
 		 276 aa  87.4  2e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.128581  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5012  MerR family transcriptional regulator  25.36 
 
 		 289 aa  87.8  2e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.147011  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3667  transcriptional regulator, MerR family  24.64 
 
 		 276 aa  86.7  4e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.372345  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1527  MerR family transcriptional regulator  23.21 
 
 		 276 aa  86.3  5e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2109  transcription activator, effector binding  31.72 
 
 		 283 aa  85.5  9e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.309412  normal  0.0724645 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2159  MerR family transcriptional regulator  29.68 
 
 		 265 aa  85.1  0.000000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2598  transcriptional regulator, MerR family  27.08 
 
 		 271 aa  84.7  0.000000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000630559  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1754  transcriptional regulator, MerR family  23.46 
 
 		 257 aa  82.8  0.000000000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.99712  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1974  transcriptional regulator, MerR family  31.79 
 
 		 283 aa  82.4  0.000000000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00000269645  unclonable  0.0000000367636 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4044  transcriptional regulator, MerR family  29.6 
 
 		 271 aa  81.6  0.00000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0218982 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2402  transcriptional regulator, MerR family  30.5 
 
 		 272 aa  81.6  0.00000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.290341  hitchhiker  0.00583984 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2144  transcriptional regulator, MerR family  25.26 
 
 		 272 aa  82  0.00000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1609  MerR family transcriptional regulator  21.38 
 
 		 272 aa  81.6  0.00000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.822901  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1206  transcription activator, effector binding  38.6 
 
 		 132 aa  79  0.00000000000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0318  transcription activator effector binding  28.28 
 
 		 157 aa  77.8  0.0000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.289482 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0345  transcription activator effector binding  30.22 
 
 		 156 aa  77.4  0.0000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8866  putative transcriptional regulator, MerR family  32.37 
 
 		 279 aa  76.6  0.0000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.249264  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64500  putative transcriptional regulator  27.03 
 
 		 270 aa  74.7  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0479  MerR family transcriptional regulator  34.86 
 
 		 354 aa  73.6  0.000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.369084 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0888  transcriptional regulator, MerR family  34.51 
 
 		 270 aa  73.6  0.000000000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00108118  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0379  transcriptional regulator, MerR family  39.47 
 
 		 327 aa  72.8  0.000000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22770  predicted transcriptional regulator  52.78 
 
 		 284 aa  72  0.000000000009  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19550  serine/threonine protein phosphatase  38.61 
 
 		 361 aa  71.6  0.00000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.17725  normal  0.381768 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2316  regulatory protein, MerR  39.13 
 
 		 369 aa  70.9  0.00000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.280801  normal  0.123157 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3847  transcriptional activator ligand binding domain protein  29.3 
 
 		 148 aa  69.3  0.00000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0993  MerR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 267 aa  68.2  0.0000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1063  MerR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 267 aa  68.2  0.0000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0593  transcription activator, effector binding  28.87 
 
 		 153 aa  68.2  0.0000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0978  MerR family transcriptional regulator  25.2 
 
 		 267 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00933333  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0980  MerR family transcriptional regulator  25.2 
 
 		 267 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.812542  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1146  transcriptional regulator, MerR family  25.2 
 
 		 267 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2992  transcriptional regulator, MerR family  27.56 
 
 		 282 aa  67.4  0.0000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.663692  normal  0.0173107 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2311  putative transcriptional regulator, MerR family  41.82 
 
 		 399 aa  67  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2898  transcriptional regulator, MerR family  36.79 
 
 		 282 aa  66.2  0.0000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22860  predicted transcriptional regulator  37.41 
 
 		 224 aa  65.9  0.0000000008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3263  transcription activator effector binding  26.88 
 
 		 151 aa  65.5  0.0000000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2419  protein serine/threonine phosphatase  43.33 
 
 		 355 aa  65.5  0.000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.111892 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4131  transcriptional activator ligand binding domain protein  30.77 
 
 		 154 aa  64.7  0.000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>