105 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_1231 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_1231  transcription activator effector binding  100 
 
 		 155 aa  311  1.9999999999999998e-84  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0816033 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1206  transcription activator, effector binding  50 
 
 		 132 aa  144  5e-34  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0385  transcription activator, effector binding  41.14 
 
 		 286 aa  113  7.999999999999999e-25  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4810  transcription activator effector binding  41.96 
 
 		 274 aa  94.7  4e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.858088  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0684  MerR family transcriptional regulator  39.6 
 
 		 279 aa  93.2  1e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3506  transcription activator, effector binding  40.18 
 
 		 274 aa  89  3e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.771694  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3611  transcriptional regulator, MerR family  32.68 
 
 		 267 aa  87.8  5e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3560  MerR family transcriptional regulator  34.18 
 
 		 287 aa  85.9  2e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.453881 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0345  transcription activator effector binding  32.9 
 
 		 156 aa  78.6  0.00000000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0318  transcription activator effector binding  30.97 
 
 		 157 aa  73.9  0.0000000000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.289482 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0304  transcription activator, effector binding  27.63 
 
 		 158 aa  70.9  0.000000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3825  transcriptional activator ligand binding domain protein  29.09 
 
 		 280 aa  69.7  0.00000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4179  transcriptional activator ligand binding domain protein  47.69 
 
 		 279 aa  68.9  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.803381 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3503  transcription activator, effector binding  33.12 
 
 		 294 aa  67.4  0.00000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00111619  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1364  hypothetical protein  28.57 
 
 		 152 aa  65.9  0.0000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.33275  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0019  transcriptional regulator, AraC family  31.06 
 
 		 314 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4446  putative DNA gyrase inhibitor  30.86 
 
 		 160 aa  63.9  0.0000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.823142  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3847  transcriptional activator ligand binding domain protein  30.13 
 
 		 148 aa  63.9  0.0000000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0296  transcription activator effector binding  40.58 
 
 		 120 aa  62.8  0.000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.285639 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2895  transcriptional regulator, MerR family  36.45 
 
 		 269 aa  62  0.000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1956  transcriptional regulator, AraC family  30.72 
 
 		 283 aa  61.2  0.000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0993473  normal  0.479782 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0225  putative transcriptional regulator, MerR family  37.08 
 
 		 262 aa  60.8  0.000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2324  hypothetical protein  26.28 
 
 		 321 aa  60.5  0.000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0188345  normal  0.69843 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2167  transcriptional regulator, AraC family  30.72 
 
 		 283 aa  60.5  0.000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.273156  normal  0.0865176 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6173  transcriptional activator ligand binding domain protein  32.35 
 
 		 158 aa  59.7  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0354767  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4131  transcriptional activator ligand binding domain protein  27.5 
 
 		 154 aa  60.1  0.00000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0593  transcription activator, effector binding  27.85 
 
 		 153 aa  59.7  0.00000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4799  transcriptional regulator, MerR family  50 
 
 		 258 aa  59.3  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5047  MerR family transcriptional regulator  43.06 
 
 		 276 aa  57.4  0.00000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.574995  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1237  transcription activator, effector binding  37.18 
 
 		 267 aa  56.2  0.0000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.516302  normal  0.923656 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3161  AraC family transcriptional regulator  40 
 
 		 277 aa  55.8  0.0000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2209  transcription activator, effector binding  29.41 
 
 		 156 aa  55.1  0.0000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.796256 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0771  AraC family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 288 aa  55.1  0.0000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.472166 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0010  hypothetical protein  37.5 
 
 		 270 aa  52.8  0.000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3571  hypothetical protein  37.7 
 
 		 203 aa  52.8  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0218579  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1782  transcriptional regulator, MerR family  42.42 
 
 		 276 aa  52.8  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.381283  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3263  transcription activator effector binding  26.28 
 
 		 151 aa  52.4  0.000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2929  AraC family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 293 aa  51.6  0.000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0116  transcription activator, effector binding  35.71 
 
 		 159 aa  51.6  0.000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0126  AraC family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 293 aa  51.6  0.000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.436666  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6982  MerR family transcriptional regulator  39.73 
 
 		 270 aa  51.6  0.000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.80949  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0140  AraC family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 293 aa  51.6  0.000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.877598  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0946  transcriptional regulator, AraC family  34.12 
 
 		 286 aa  51.6  0.000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.584518  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3306  AraC family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 292 aa  51.2  0.000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3507  MerR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 292 aa  51.2  0.000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.401792  normal  0.0867153 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1731  MerR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 276 aa  50.4  0.000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.867101  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1523  MerR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 276 aa  50.4  0.000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.193632  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1641  MerR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 276 aa  50.4  0.000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1495  MerR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 276 aa  50.1  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00542237  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1485  MerR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 276 aa  50.1  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0543962  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1708  transcriptional regulator, MerR family  36.36 
 
 		 276 aa  50.1  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0653  transcriptional activator ligand binding domain protein  30.25 
 
 		 158 aa  50.1  0.00001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000130359  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4737  hypothetical protein  37.5 
 
 		 204 aa  49.7  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.889648 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3349  transcription activator, effector binding  36.11 
 
 		 160 aa  49.3  0.00002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.808619  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0126  transcription activator effector binding  34.52 
 
 		 159 aa  49.7  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1132  transcription activator, effector binding  24.09 
 
 		 164 aa  48.9  0.00003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03030  predicted transcriptional regulator  29.03 
 
 		 276 aa  48.1  0.00004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2159  MerR family transcriptional regulator  27.33 
 
 		 265 aa  48.1  0.00005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7295  AraC family transcriptional regulator  34.25 
 
 		 277 aa  47.8  0.00006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.158014  normal  0.567517 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0124  transcription activator effector binding  34.15 
 
 		 159 aa  47.4  0.00007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7266  transcriptional regulator, MerR family  31.58 
 
 		 274 aa  47.4  0.00007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6884  transcriptional regulator, AraC family  27.94 
 
 		 301 aa  47  0.00008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0331  MerR family transcriptional regulator  24.52 
 
 		 281 aa  47  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2851  hypothetical protein  32.86 
 
 		 210 aa  46.6  0.0001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000359813 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0732  hypothetical protein  38.03 
 
 		 216 aa  46.6  0.0001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3667  transcriptional regulator, MerR family  39.39 
 
 		 276 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.372345  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6018  hypothetical protein  24.84 
 
 		 156 aa  46.2  0.0002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2263  transcriptional regulator, MerR family  32.29 
 
 		 281 aa  46.2  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0418  transcription activator, effector binding  24.84 
 
 		 154 aa  46.2  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1527  MerR family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 276 aa  46.2  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1851  transcription activator effector binding  35.21 
 
 		 241 aa  45.8  0.0002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.493771 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1677  transcriptional regulator, MerR family  37.88 
 
 		 276 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.128581  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2808  transcriptional regulator, MerR family  30.84 
 
 		 276 aa  46.2  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.44001  normal  0.316047 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0360  hypothetical protein  28.72 
 
 		 199 aa  46.2  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3702  transcriptional regulator, AraC type  31.4 
 
 		 308 aa  45.4  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2480  transcription activator, effector binding  26.75 
 
 		 154 aa  45.4  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.540117  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2735  putative transcriptional regulator, MerR family  33.63 
 
 		 264 aa  45.4  0.0003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0721242  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2481  transcriptional regulator, MerR family  35.53 
 
 		 269 aa  45.4  0.0003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.564945  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2529  transcriptional regulator, MerR family  38.36 
 
 		 270 aa  45.1  0.0003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1609  MerR family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 272 aa  44.7  0.0005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.822901  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0371  hypothetical protein  30.14 
 
 		 240 aa  43.9  0.0007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.548098  normal  0.611025 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2798  transcription activator effector binding  26.62 
 
 		 156 aa  44.3  0.0007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0250  transcription activator effector binding  27.54 
 
 		 260 aa  43.9  0.0008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.495724  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0754  transcription activator, effector binding  23.4 
 
 		 156 aa  43.1  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.287281  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1418  hypothetical protein  28.42 
 
 		 209 aa  43.5  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2780  transcriptional regulator, MerR family  24.44 
 
 		 269 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000880145 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2581  transcriptional regulator, putative  24.44 
 
 		 212 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0799223  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3953  AraC family transcriptional regulator  24.05 
 
 		 287 aa  43.1  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0509927  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2545  transcriptional regulator, MerR family  24.44 
 
 		 269 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0540  transcriptional regulator, AraC family  29.41 
 
 		 289 aa  42.7  0.002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.516999  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0358  transcription activator, effector binding  27.54 
 
 		 243 aa  42  0.003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.923721  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4107  hypothetical protein  32.79 
 
 		 207 aa  42  0.003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0941268  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0216  transcription activator, effector binding  26.09 
 
 		 252 aa  42  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.05327  hitchhiker  0.00731322 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3920  transcription activator, effector binding  29.21 
 
 		 161 aa  42  0.003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2034  hypothetical protein  37.78 
 
 		 195 aa  42.4  0.003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0123018 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4044  transcriptional regulator, MerR family  29.41 
 
 		 271 aa  42  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0218982 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3767  transcriptional regulator, MerR family  31.71 
 
 		 264 aa  41.6  0.004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.237591  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0052  hypothetical protein  40.32 
 
 		 211 aa  41.6  0.004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.889174 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4914  hypothetical protein  27.54 
 
 		 207 aa  41.6  0.004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.70965  normal  0.145699 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1629  hypothetical protein  40.32 
 
 		 205 aa  41.2  0.005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>