29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_1851 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_1851  transcription activator effector binding  100 
 
 		 241 aa  465  9.999999999999999e-131  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.493771 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3021  transcription activator effector binding  62.11 
 
 		 219 aa  204  1e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0182  transcription activator effector binding  43.83 
 
 		 236 aa  142  6e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3657  transcription activator effector binding  44.1 
 
 		 259 aa  140  9.999999999999999e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.217912  hitchhiker  0.00540131 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2719  transcription activator effector binding  39.01 
 
 		 257 aa  132  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2946  transcription activator effector binding  38.57 
 
 		 298 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.433346  hitchhiker  0.00143394 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2841  transcription activator effector binding  37.6 
 
 		 249 aa  130  3e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.491142  normal  0.203894 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5334  transcription activator effector binding  39.37 
 
 		 255 aa  126  3e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.313635  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0371  hypothetical protein  42.95 
 
 		 240 aa  121  9.999999999999999e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.548098  normal  0.611025 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0216  transcription activator, effector binding  39.51 
 
 		 252 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.05327  hitchhiker  0.00731322 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0250  transcription activator effector binding  39.58 
 
 		 260 aa  116  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.495724  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0513  transcription activator, effector binding  34.05 
 
 		 268 aa  115  5e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.482512  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0358  transcription activator, effector binding  37.09 
 
 		 243 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.923721  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3576  transcription activator, effector binding  35.14 
 
 		 242 aa  112  7.000000000000001e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0410  transcription activator effector binding  36.47 
 
 		 227 aa  108  6e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.122194  normal  0.857811 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2777  transcription activator, effector binding  36.65 
 
 		 242 aa  106  4e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0772774  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0318  transcription activator effector binding  29.01 
 
 		 157 aa  56.6  0.0000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.289482 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0754  transcription activator, effector binding  34.91 
 
 		 156 aa  53.1  0.000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.287281  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4607  transcription activator, effector binding  26.17 
 
 		 156 aa  52.4  0.000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0684789  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2214  transcriptional activator ligand binding domain protein  30.91 
 
 		 210 aa  51.6  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.307481  normal  0.371698 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0345  transcription activator effector binding  27.68 
 
 		 156 aa  51.6  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1206  transcription activator, effector binding  30.47 
 
 		 132 aa  51.2  0.00001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0304  transcription activator, effector binding  26.15 
 
 		 158 aa  50.1  0.00003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2087  transcription activator effector binding  28.28 
 
 		 166 aa  48.5  0.0001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000102768 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1364  hypothetical protein  27.03 
 
 		 152 aa  46.2  0.0005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.33275  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1231  transcription activator effector binding  35.21 
 
 		 155 aa  45.1  0.001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0816033 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4810  transcription activator effector binding  25.23 
 
 		 274 aa  44.3  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.858088  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0005  hypothetical protein  32.81 
 
 		 157 aa  44.3  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.251807  normal  0.30014 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3506  transcription activator, effector binding  26.24 
 
 		 274 aa  43.1  0.004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.771694  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>