37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_2851 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_2851  hypothetical protein  100 
 
 		 210 aa  436  9.999999999999999e-123  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000359813 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0605  hypothetical protein  45.89 
 
 		 207 aa  202  3e-51  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00360834  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0819  hypothetical protein  39.52 
 
 		 208 aa  153  2e-36  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000589024  normal  0.37029 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0709  hypothetical protein  35.5 
 
 		 234 aa  152  4e-36  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0505  hypothetical protein  36.49 
 
 		 208 aa  150  1e-35  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.762727 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0029  hypothetical protein  40.09 
 
 		 212 aa  144  1e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.379928  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0046  hypothetical protein  38.46 
 
 		 210 aa  143  1e-33  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0238  hypothetical protein  37.14 
 
 		 213 aa  140  9.999999999999999e-33  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1927  hypothetical protein  37.56 
 
 		 210 aa  137  1e-31  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0360  hypothetical protein  36.87 
 
 		 199 aa  135  3.0000000000000003e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4107  hypothetical protein  33.01 
 
 		 207 aa  131  6e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0941268  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3571  hypothetical protein  35.44 
 
 		 203 aa  128  5.0000000000000004e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0218579  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25880  hypothetical protein  34.12 
 
 		 210 aa  125  4.0000000000000003e-28  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0732  hypothetical protein  32.39 
 
 		 216 aa  125  6e-28  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0693  hypothetical protein  31.6 
 
 		 207 aa  123  2e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.477394  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4737  hypothetical protein  33.65 
 
 		 204 aa  121  9e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.889648 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4914  hypothetical protein  33.97 
 
 		 207 aa  117  9.999999999999999e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.70965  normal  0.145699 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0701  hypothetical protein  33.98 
 
 		 203 aa  116  1.9999999999999998e-25  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.181233  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1727  hypothetical protein  35.29 
 
 		 214 aa  116  1.9999999999999998e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.360385 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0783  hypothetical protein  34.47 
 
 		 203 aa  115  3e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000955418  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1536  hypothetical protein  30.58 
 
 		 211 aa  115  5e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00837132 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1787  Protein of unknown function DUF2174  31.25 
 
 		 218 aa  114  1.0000000000000001e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.337101 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0052  hypothetical protein  33.01 
 
 		 211 aa  108  5e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.889174 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1418  hypothetical protein  30.48 
 
 		 209 aa  104  1e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2941  hypothetical protein  29.81 
 
 		 206 aa  96.7  2e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1629  hypothetical protein  29.32 
 
 		 205 aa  96.3  3e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4614  hypothetical protein  29.84 
 
 		 210 aa  90.1  2e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.877664 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2790  Protein of unknown function DUF2174-like protein  28.34 
 
 		 213 aa  89.7  3e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000223606 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1139  hypothetical protein  29.52 
 
 		 210 aa  88.6  7e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0224  hypothetical protein  24.73 
 
 		 170 aa  69.7  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2034  hypothetical protein  22.92 
 
 		 195 aa  52.8  0.000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0123018 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1290  hypothetical protein  27.08 
 
 		 172 aa  51.6  0.000008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1500  hypothetical protein  27.08 
 
 		 172 aa  50.8  0.00001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1275  hypothetical protein  25.52 
 
 		 172 aa  49.3  0.00004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00585097  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1231  transcription activator effector binding  32.86 
 
 		 155 aa  46.6  0.0003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0816033 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1206  transcription activator, effector binding  32.81 
 
 		 132 aa  45.8  0.0004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4810  transcription activator effector binding  26.39 
 
 		 274 aa  42  0.007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.858088  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>