34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apar_0046 on replicon NC_013203
Organism: Atopobium parvulum DSM 20469



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013203  Apar_0046  hypothetical protein  100 
 
 		 210 aa  437  9.999999999999999e-123  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0819  hypothetical protein  62.98 
 
 		 208 aa  298  5e-80  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000589024  normal  0.37029 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0029  hypothetical protein  61.43 
 
 		 212 aa  292  3e-78  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.379928  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25880  hypothetical protein  57.14 
 
 		 210 aa  273  2.0000000000000002e-72  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1927  hypothetical protein  56.73 
 
 		 210 aa  263  2e-69  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0732  hypothetical protein  52.56 
 
 		 216 aa  237  1e-61  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0709  hypothetical protein  45.22 
 
 		 234 aa  214  5.9999999999999996e-55  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0505  hypothetical protein  46.63 
 
 		 208 aa  203  2e-51  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.762727 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4737  hypothetical protein  37.68 
 
 		 204 aa  151  7e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.889648 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3571  hypothetical protein  39.9 
 
 		 203 aa  149  2e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0218579  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4107  hypothetical protein  39.42 
 
 		 207 aa  149  3e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0941268  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2851  hypothetical protein  38.46 
 
 		 210 aa  143  1e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000359813 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4914  hypothetical protein  35.81 
 
 		 207 aa  143  2e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.70965  normal  0.145699 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0052  hypothetical protein  39.23 
 
 		 211 aa  138  4.999999999999999e-32  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.889174 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0783  hypothetical protein  37.62 
 
 		 203 aa  136  2e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000955418  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0238  hypothetical protein  38.61 
 
 		 213 aa  136  2e-31  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1727  hypothetical protein  38.03 
 
 		 214 aa  135  4e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.360385 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0693  hypothetical protein  36.97 
 
 		 207 aa  134  9e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.477394  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0360  hypothetical protein  37.98 
 
 		 199 aa  134  9.999999999999999e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1787  Protein of unknown function DUF2174  36.15 
 
 		 218 aa  133  1.9999999999999998e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.337101 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0701  hypothetical protein  36.71 
 
 		 203 aa  130  1.0000000000000001e-29  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.181233  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1536  hypothetical protein  33.02 
 
 		 211 aa  130  2.0000000000000002e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00837132 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1418  hypothetical protein  38.76 
 
 		 209 aa  130  2.0000000000000002e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1139  hypothetical protein  35.58 
 
 		 210 aa  129  4.0000000000000003e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0605  hypothetical protein  35.98 
 
 		 207 aa  125  3e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00360834  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2941  hypothetical protein  34.91 
 
 		 206 aa  125  5e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1629  hypothetical protein  36.32 
 
 		 205 aa  121  8e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2790  Protein of unknown function DUF2174-like protein  33.17 
 
 		 213 aa  113  2.0000000000000002e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000223606 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4614  hypothetical protein  33.49 
 
 		 210 aa  112  5e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.877664 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0224  hypothetical protein  28.57 
 
 		 170 aa  88.2  8e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2034  hypothetical protein  27.04 
 
 		 195 aa  59.7  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0123018 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1275  hypothetical protein  27.27 
 
 		 172 aa  54.3  0.000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00585097  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1290  hypothetical protein  26.9 
 
 		 172 aa  50.4  0.00002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1500  hypothetical protein  26.9 
 
 		 172 aa  50.4  0.00002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>