31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DhcVS_1275 on replicon NC_013552
Organism: Dehalococcoides sp. VS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013552  DhcVS_1275  hypothetical protein  100 
 
 		 172 aa  357  6e-98  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00585097  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1290  hypothetical protein  90.7 
 
 		 172 aa  325  1.0000000000000001e-88  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1500  hypothetical protein  90.12 
 
 		 172 aa  325  3e-88  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1727  hypothetical protein  30.11 
 
 		 214 aa  69.7  0.00000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.360385 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4737  hypothetical protein  28.34 
 
 		 204 aa  68.6  0.00000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.889648 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0819  hypothetical protein  29.59 
 
 		 208 aa  63.9  0.0000000009  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000589024  normal  0.37029 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0701  hypothetical protein  31.35 
 
 		 203 aa  62  0.000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.181233  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0052  hypothetical protein  28.81 
 
 		 211 aa  62  0.000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.889174 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1927  hypothetical protein  28.21 
 
 		 210 aa  61.2  0.000000006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4107  hypothetical protein  27.87 
 
 		 207 aa  59.7  0.00000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0941268  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0360  hypothetical protein  27.96 
 
 		 199 aa  56.6  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0783  hypothetical protein  28.74 
 
 		 203 aa  57.4  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000955418  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0693  hypothetical protein  26.35 
 
 		 207 aa  56.2  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.477394  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1787  Protein of unknown function DUF2174  26.63 
 
 		 218 aa  55.8  0.0000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.337101 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0029  hypothetical protein  27.27 
 
 		 212 aa  55.8  0.0000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.379928  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3571  hypothetical protein  28.57 
 
 		 203 aa  55.5  0.0000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0218579  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25880  hypothetical protein  27.46 
 
 		 210 aa  54.7  0.0000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0505  hypothetical protein  28.57 
 
 		 208 aa  54.7  0.0000007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.762727 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0046  hypothetical protein  27.27 
 
 		 210 aa  54.3  0.0000009  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0732  hypothetical protein  26.5 
 
 		 216 aa  52.4  0.000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0605  hypothetical protein  40.28 
 
 		 207 aa  51.6  0.000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00360834  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0684  MerR family transcriptional regulator  25.5 
 
 		 279 aa  51.2  0.000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1536  hypothetical protein  22.46 
 
 		 211 aa  50.4  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00837132 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1139  hypothetical protein  38.36 
 
 		 210 aa  50.1  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2851  hypothetical protein  25.52 
 
 		 210 aa  49.3  0.00003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000359813 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2941  hypothetical protein  27.96 
 
 		 206 aa  48.9  0.00003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4914  hypothetical protein  26.56 
 
 		 207 aa  43.9  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.70965  normal  0.145699 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1629  hypothetical protein  23.94 
 
 		 205 aa  43.1  0.002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1418  hypothetical protein  36.76 
 
 		 209 aa  41.6  0.005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0358  transcription activator, effector binding  29.32 
 
 		 243 aa  41.2  0.007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.923721  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0238  hypothetical protein  24.87 
 
 		 213 aa  41.2  0.008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>