38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_1418 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_1418  hypothetical protein  100 
 
 		 209 aa  432  1e-120  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1629  hypothetical protein  50.73 
 
 		 205 aa  204  5e-52  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1787  Protein of unknown function DUF2174  49.74 
 
 		 218 aa  194  7e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.337101 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2790  Protein of unknown function DUF2174-like protein  49.21 
 
 		 213 aa  189  4e-47  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000223606 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2941  hypothetical protein  44.61 
 
 		 206 aa  188  4e-47  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0693  hypothetical protein  46.12 
 
 		 207 aa  187  1e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.477394  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4107  hypothetical protein  45.27 
 
 		 207 aa  182  4.0000000000000006e-45  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0941268  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3571  hypothetical protein  45.81 
 
 		 203 aa  181  9.000000000000001e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0218579  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1536  hypothetical protein  43.08 
 
 		 211 aa  180  1e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00837132 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0701  hypothetical protein  44.78 
 
 		 203 aa  179  2.9999999999999997e-44  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.181233  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4614  hypothetical protein  48.45 
 
 		 210 aa  177  8e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.877664 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0052  hypothetical protein  45.32 
 
 		 211 aa  177  1e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.889174 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1139  hypothetical protein  46.77 
 
 		 210 aa  176  2e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0783  hypothetical protein  44.55 
 
 		 203 aa  171  5.999999999999999e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000955418  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1727  hypothetical protein  42.65 
 
 		 214 aa  147  1.0000000000000001e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.360385 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0505  hypothetical protein  42.18 
 
 		 208 aa  139  1.9999999999999998e-32  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.762727 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4737  hypothetical protein  41.67 
 
 		 204 aa  138  4.999999999999999e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.889648 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0360  hypothetical protein  38.61 
 
 		 199 aa  131  7.999999999999999e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0046  hypothetical protein  38.76 
 
 		 210 aa  130  2.0000000000000002e-29  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0819  hypothetical protein  38.57 
 
 		 208 aa  127  2.0000000000000002e-28  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000589024  normal  0.37029 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4914  hypothetical protein  35.41 
 
 		 207 aa  124  9e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.70965  normal  0.145699 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0709  hypothetical protein  36.64 
 
 		 234 aa  122  3e-27  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0029  hypothetical protein  36.28 
 
 		 212 aa  122  5e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.379928  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1927  hypothetical protein  34.45 
 
 		 210 aa  116  3e-25  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25880  hypothetical protein  36.84 
 
 		 210 aa  113  2.0000000000000002e-24  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0732  hypothetical protein  36.92 
 
 		 216 aa  107  2e-22  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0238  hypothetical protein  31.28 
 
 		 213 aa  104  8e-22  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2851  hypothetical protein  30.48 
 
 		 210 aa  104  1e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000359813 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0605  hypothetical protein  32.35 
 
 		 207 aa  100  1e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00360834  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0224  hypothetical protein  34.59 
 
 		 170 aa  92.8  3e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2034  hypothetical protein  35.52 
 
 		 195 aa  73.9  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0123018 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1231  transcription activator effector binding  28.42 
 
 		 155 aa  43.5  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0816033 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7295  AraC family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 277 aa  43.9  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.158014  normal  0.567517 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1539  Protein of unknown function DUF2174-like protein  28.65 
 
 		 242 aa  43.1  0.003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.639401  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1290  hypothetical protein  36.76 
 
 		 172 aa  42.4  0.004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1500  hypothetical protein  36.76 
 
 		 172 aa  42  0.006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1206  transcription activator, effector binding  29.21 
 
 		 132 aa  42  0.007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1275  hypothetical protein  36.76 
 
 		 172 aa  41.6  0.008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00585097  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>