31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_0224 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_0224  hypothetical protein  100 
 
 		 170 aa  343  5e-94  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0360  hypothetical protein  39.88 
 
 		 199 aa  120  9e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4914  hypothetical protein  34.22 
 
 		 207 aa  112  2.0000000000000002e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.70965  normal  0.145699 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2941  hypothetical protein  36.11 
 
 		 206 aa  105  2e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4107  hypothetical protein  32.57 
 
 		 207 aa  101  5e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0941268  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1536  hypothetical protein  36.81 
 
 		 211 aa  96.7  1e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00837132 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1787  Protein of unknown function DUF2174  37.5 
 
 		 218 aa  94.7  5e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.337101 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0693  hypothetical protein  37.5 
 
 		 207 aa  94.4  6e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.477394  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3571  hypothetical protein  32.97 
 
 		 203 aa  93.2  1e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0218579  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1418  hypothetical protein  34.59 
 
 		 209 aa  92.8  2e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0701  hypothetical protein  30.77 
 
 		 203 aa  90.5  1e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.181233  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4737  hypothetical protein  34.22 
 
 		 204 aa  90.1  1e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.889648 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0052  hypothetical protein  35.71 
 
 		 211 aa  89.7  2e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.889174 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0046  hypothetical protein  28.57 
 
 		 210 aa  88.2  5e-17  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1727  hypothetical protein  32.24 
 
 		 214 aa  87  1e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.360385 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0783  hypothetical protein  31.11 
 
 		 203 aa  85.9  2e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000955418  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2790  Protein of unknown function DUF2174-like protein  38.29 
 
 		 213 aa  83.2  0.000000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000223606 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0029  hypothetical protein  27.08 
 
 		 212 aa  82.4  0.000000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.379928  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1139  hypothetical protein  33.71 
 
 		 210 aa  80.9  0.000000000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1629  hypothetical protein  36.9 
 
 		 205 aa  77.8  0.00000000000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0505  hypothetical protein  29.74 
 
 		 208 aa  76.3  0.0000000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.762727 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0709  hypothetical protein  27.1 
 
 		 234 aa  75.1  0.0000000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2034  hypothetical protein  35.2 
 
 		 195 aa  74.7  0.0000000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0123018 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0819  hypothetical protein  26.16 
 
 		 208 aa  73.6  0.000000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000589024  normal  0.37029 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25880  hypothetical protein  31.25 
 
 		 210 aa  72  0.000000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2851  hypothetical protein  24.73 
 
 		 210 aa  69.7  0.00000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000359813 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4614  hypothetical protein  40 
 
 		 210 aa  68.6  0.00000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.877664 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1927  hypothetical protein  27.55 
 
 		 210 aa  68.6  0.00000000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0732  hypothetical protein  24.88 
 
 		 216 aa  57.8  0.00000007  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0605  hypothetical protein  21.81 
 
 		 207 aa  55.5  0.0000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00360834  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0238  hypothetical protein  24.29 
 
 		 213 aa  55.1  0.0000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>