35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_4614 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_4614  hypothetical protein  100 
 
 
210 aa  431  1e-120  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.877664 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1536  hypothetical protein  66.99 
 
 
211 aa  295  5e-79  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00837132 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1787  Protein of unknown function DUF2174  69.31 
 
 
218 aa  288  5.0000000000000004e-77  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.337101 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1629  hypothetical protein  61.95 
 
 
205 aa  248  4e-65  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2790  Protein of unknown function DUF2174-like protein  59.8 
 
 
213 aa  243  9.999999999999999e-64  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000223606 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0693  hypothetical protein  56.93 
 
 
207 aa  236  2e-61  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.477394  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2941  hypothetical protein  53.66 
 
 
206 aa  202  3e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1418  hypothetical protein  48.21 
 
 
209 aa  199  3e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0783  hypothetical protein  48.53 
 
 
203 aa  193  1e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000955418  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1139  hypothetical protein  55.39 
 
 
210 aa  191  1e-47  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3571  hypothetical protein  48.04 
 
 
203 aa  189  2e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0218579  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4107  hypothetical protein  49.02 
 
 
207 aa  187  8e-47  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0941268  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0052  hypothetical protein  50.49 
 
 
211 aa  181  1e-44  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.889174 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0701  hypothetical protein  43.63 
 
 
203 aa  167  1e-40  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.181233  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1727  hypothetical protein  42.31 
 
 
214 aa  147  9e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.360385 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4737  hypothetical protein  37.25 
 
 
204 aa  142  4e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.889648 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4914  hypothetical protein  39.23 
 
 
207 aa  138  7.999999999999999e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.70965  normal  0.145699 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0029  hypothetical protein  35.81 
 
 
212 aa  133  1.9999999999999998e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.379928  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0505  hypothetical protein  38.74 
 
 
208 aa  132  3.9999999999999996e-30  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.762727 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25880  hypothetical protein  40 
 
 
210 aa  132  3.9999999999999996e-30  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0046  hypothetical protein  33.95 
 
 
210 aa  129  2.0000000000000002e-29  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0819  hypothetical protein  35.55 
 
 
208 aa  127  1.0000000000000001e-28  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000589024  normal  0.37029 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0360  hypothetical protein  39.56 
 
 
199 aa  123  2e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0709  hypothetical protein  33.47 
 
 
234 aa  121  9e-27  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1927  hypothetical protein  35.05 
 
 
210 aa  119  3.9999999999999996e-26  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0238  hypothetical protein  33.01 
 
 
213 aa  114  1.0000000000000001e-24  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0732  hypothetical protein  35.02 
 
 
216 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2851  hypothetical protein  31.41 
 
 
210 aa  104  1e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000359813 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0605  hypothetical protein  28.78 
 
 
207 aa  97.8  1e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00360834  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0224  hypothetical protein  35.14 
 
 
170 aa  85.1  7e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2034  hypothetical protein  34.41 
 
 
195 aa  67.8  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0123018 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1290  hypothetical protein  26.52 
 
 
172 aa  53.1  0.000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1500  hypothetical protein  25.97 
 
 
172 aa  52  0.000007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1275  hypothetical protein  24.86 
 
 
172 aa  47  0.0002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00585097  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1539  Protein of unknown function DUF2174-like protein  33.85 
 
 
242 aa  46.2  0.0004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.639401  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>