35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_0505 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008942  Mlab_0505  hypothetical protein  100 
 
 
208 aa  433  1e-121  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.762727 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0029  hypothetical protein  51.69 
 
 
212 aa  221  4.9999999999999996e-57  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.379928  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0709  hypothetical protein  49.78 
 
 
234 aa  221  7e-57  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25880  hypothetical protein  52.43 
 
 
210 aa  220  9.999999999999999e-57  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0732  hypothetical protein  51.64 
 
 
216 aa  216  2e-55  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0819  hypothetical protein  49.03 
 
 
208 aa  214  5.9999999999999996e-55  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000589024  normal  0.37029 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0046  hypothetical protein  46.63 
 
 
210 aa  203  2e-51  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1927  hypothetical protein  48.29 
 
 
210 aa  201  9e-51  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4737  hypothetical protein  45.19 
 
 
204 aa  169  4e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.889648 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3571  hypothetical protein  46.19 
 
 
203 aa  162  3e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0218579  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1727  hypothetical protein  44.98 
 
 
214 aa  161  6e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.360385 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2941  hypothetical protein  47.2 
 
 
206 aa  156  2e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4107  hypothetical protein  42.86 
 
 
207 aa  155  4e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0941268  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0783  hypothetical protein  45.07 
 
 
203 aa  154  7e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000955418  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1139  hypothetical protein  42.38 
 
 
210 aa  153  2e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2851  hypothetical protein  36.49 
 
 
210 aa  150  1e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000359813 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0693  hypothetical protein  38.68 
 
 
207 aa  146  2.0000000000000003e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.477394  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0701  hypothetical protein  44.39 
 
 
203 aa  146  2.0000000000000003e-34  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.181233  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0605  hypothetical protein  36.67 
 
 
207 aa  144  1e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00360834  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1418  hypothetical protein  42.18 
 
 
209 aa  139  1.9999999999999998e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0238  hypothetical protein  38.28 
 
 
213 aa  139  1.9999999999999998e-32  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0052  hypothetical protein  39.23 
 
 
211 aa  134  7.000000000000001e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.889174 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0360  hypothetical protein  37.32 
 
 
199 aa  134  9.999999999999999e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1787  Protein of unknown function DUF2174  41.51 
 
 
218 aa  133  1.9999999999999998e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.337101 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1536  hypothetical protein  38.68 
 
 
211 aa  125  4.0000000000000003e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00837132 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1629  hypothetical protein  38.5 
 
 
205 aa  123  2e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4614  hypothetical protein  38.25 
 
 
210 aa  116  1.9999999999999998e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.877664 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2790  Protein of unknown function DUF2174-like protein  37.5 
 
 
213 aa  115  3.9999999999999997e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000223606 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4914  hypothetical protein  36 
 
 
207 aa  112  4.0000000000000004e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.70965  normal  0.145699 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0224  hypothetical protein  29.74 
 
 
170 aa  76.3  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1275  hypothetical protein  28.57 
 
 
172 aa  54.7  0.000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00585097  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1290  hypothetical protein  27.55 
 
 
172 aa  50.1  0.00002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1500  hypothetical protein  27.04 
 
 
172 aa  49.3  0.00004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2034  hypothetical protein  26.13 
 
 
195 aa  47.4  0.0001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0123018 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0345  transcription activator effector binding  35.48 
 
 
156 aa  43.5  0.002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>